Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09947
• Subject: NM_001365389.1
• Aligned Length: 999
• Identities: 946
• Gaps: 51

Alignment

Query   1  ---------------------------------------------------ATGAAGATAGCAAACAACACAGT  23
                                                              |||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCCTTCCTTCTGGCCTTGCTCAAGAAACTTTCAGGCTCAGGCAGAAGAAATGAAGATAGCAAACAACACAGT  74

Query  24  AGTGACAGAATTTATCCTCCTTGGTCTGACTCAGTCTCAAGATATTCAGCTCTTGGTCTTTGTGCTGATCTTAA  97
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AGTGACAGAATTTATCCTCCTTGGTCTGACTCAGTCTCAAGATATTCAGCTCTTGGTCTTTGTGCTGATCTTAA  148

Query  98  TTTTCTACCTTATCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCATAAGGTCAGACCCTGGGCTCACAGCC  171
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TTTTCTACCTTATCATCCTCCCTGGAAATTTTCTCATTATTTTCACCATAAGGTCAGACCCTGGGCTCACAGCC  222

Query 172  CCCCTCTATTTATTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGTT  245
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CCCCTCTATTTATTTCTGGGCAACTTGGCCTTCCTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGCTCCCAGGATGTT  296

Query 246  GGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCC  319
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  GGTGGACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTACAGAGGCTGCATCACTCAGCTCTTTTTCTTGCACTTCC  370

Query 320  TTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCCCTGCAC  393
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 371  TTGGAGGAGGGGAGGGATTACTCCTTGTTGTGATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCTCTGCAC  444

Query 394  TGTTCAACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCAATGATGTTGGCTCTGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTC  467
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TGTTCAACTGTCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCAATGATGTTGGCTCTGTGGCTTGGGGGTTTTGTCCACTC  518

Query 468  CATTATCCAGGTGGTCCTCATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATG  541
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CATTATCCAGGTGGTCCTCATCCTCCGCTTGCCTTTTTGTGGCCCAAACCAGCTGGACAACTTCTTCTGTGATG  592

Query 542  TCCGACAGGTCATCAAGCTGGCTTGCACCGACATGTTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTG  615
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TCCGACAGGTCATCAAGCTGGCTTGCACCGACATGTTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTCTTCAACAGTGGCCTG  666

Query 616  ATGACACTCCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCTTCCTATGCAGTCATCCTCTGCCATGTTCGTAGGGCAGCTTC  689
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  ATGACACTCCTGTGCTTTCTGGGGCTTCTGGCTTCCTATGCAGTCATCCTCTGCCATGTTCGTAGGGCAGCTTC  740

Query 690  TGAAGGGAAGAACAAGGCCATGTCCACATGCACCACTCGTGTCATTATTATACTTCTTATGTTTGGACCTGCTA  763
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  TGAAGGGAAGAACAAGGCCATGTCCACATGCACCACTCGTGTCATTATTATACTTCTTATGTTTGGACCTGCTA  814

Query 764  TCTTCATCTACATGTGCCCTTTCAGGGCCTTACCAGCTGACAAGATGGTTTCTCTCTTTCACACAGTGATCTTT  837
           |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  TCTTCATCTACATATGCCCTTTCAGGGCCTTACCAGCTGACAAGATGGTTTCTCTCTTTCACACAGTGATCTTT  888

Query 838  CCATTGATGAATCCTATGATTTATACCCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAACTTCCATGAAGAGGTTATTGAGTCG  911
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  CCATTGATGAATCCTATGATTTATACCCTTCGCAACCAGGAAGTGAAAACTTCCATGAAGAGGTTATTGAGTCG  962

Query 912  ACATGTAGTCTGTCAAGTGGATTTTATAATAAGAAAC  948
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963  ACATGTAGTCTGTCAAGTGGATTTTATAATAAGAAAC  999