Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_09953
Subject:
NM_178171.5
Aligned Length:
1335
Identities:
1333
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGACCATGTTTGAAAATGTCACCCGGGCCCTGGCCAGACAGCTAAACCCTCGAGGGGACCTGACACCACTTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCATGTTTGAAAATGTCACCCGGGCCCTGGCCAGACAGCTAAACCCTCGAGGGGACCTGACACCACTTGA  74

Query   75  CAGCCTCATCGACTTCAAGCGCTTCCATCCCTTCTGCCTGGTGCTGAGGAAGAGGAAGAGCACGCTCTTCTGGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCCTCATCGACTTCAAGCGCTTCCATCCCTTCTGCCTGGTGCTGAGGAAGAGGAAGAGCACGCTCTTCTGGG  148

Query  149  GGGCCCGGTACGTCCGCACCGACTACACGCTGCTGGATGTGCTTGAGCCCGGCAGCTCACCTTCAGACCCAACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGCCCGGTACGTCCGCACCGACTACACGCTGCTGGATGTGCTTGAGCCCGGCAGCTCACCTTCAGACCCAACA  222

Query  223  GACACTGGGAATTTTGGCTTTAAGAATATGCTGGACACCCGAGTGGAGGGAGATGTGGATGTACCAAAGACGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACACTGGGAATTTTGGCTTTAAGAATATGCTGGACACCCGAGTGGAGGGAGATGTGGATGTACCAAAGACGGT  296

Query  297  GAAGGTGAAGGGAACGGCAGGGCTCTCGCAGAACAGCACTCTGGAGGTCCAGACACTCAGTGTGGCTCCCAAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGGTGAAGGGAACGGCAGGGCTCTCGCAGAACAGCACTCTGGAGGTCCAGACACTCAGTGTGGCTCCCAAGG  370

Query  371  CCCTGGAGACCTTGCAGGAGAGGAAGCTGGCAGCAGACCACCCATTCCTGAAGGAGATGCAAGATCAAGGGGAG  444
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTGGAGACCGTGCAGGAGAGGAAGCTGGCAGCAGACCACCCATTCCTGAAGGAGATGCAAGATCAAGGGGAG  444

Query  445  AACCTGTATGTGGTGATGGAGGTGGTGGAGACGGTGCAGGAGGTCACACTGGAGCGAGCCGGCAAGGCAGAGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACCTGTATGTGGTGATGGAGGTGGTGGAGACGGTGCAGGAGGTCACACTGGAGCGAGCCGGCAAGGCAGAGGC  518

Query  519  CTGCTTCTCCCTCCCCTTCTTCGCCCCATTGGGGCTACAGGGATCCATAAATCACAAGGAGGCTGTAACCATCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGCTTCTCCCTCCCCTTCTTCGCCCCATTGGGGCTACAGGGATCCATAAATCACAAGGAGGCTGTAACCATCC  592

Query  593  CCAAGGGCTGCGTCCTGGCCTTTCGAGTGAGACAGCTGATGGTCAAAGGCAAAGATGAGTGGGATATTCCACAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAAGGGCTGCGTCCTGGCCTTTCGAGTGAGACAGCTGATGGTCAAAGGCAAAGATGAGTGGGATATTCCACAT  666

Query  667  ATCTGCAATGATAACATGCAAACCTTCCCTCCTGGAGAAAAGTCAGGAGAGGAGAAGGTCATCCTTATCCAGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCTGCAATGATAACATGCAAACCTTCCCTCCTGGAGAAAAGTCAGGAGAGGAGAAGGTCATCCTTATCCAGGC  740

Query  741  ATCTGATGTTGGGGACGTACACGAAGGCTTCAGGACACTAAAAGAAGAAGTTCAGAGAGAGACCCAACAAGTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCTGATGTTGGGGACGTACACGAAGGCTTCAGGACACTAAAAGAAGAAGTTCAGAGAGAGACCCAACAAGTGG  814

Query  815  AGAAGCTGAGCCGAGTAGGGCAAAGCTCCCTGCTCAGCTCCCTCAGCAAACTTCTAGGGAAGAAAAAGGAGCTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAAGCTGAGCCGAGTAGGGCAAAGCTCCCTGCTCAGCTCCCTCAGCAAACTTCTAGGGAAGAAAAAGGAGCTA  888

Query  889  CAAGACCTTGAGCTCGCACTTGAAGGGGCTCTAGACAAGGGACATGAAGTGAACCTGGAGGCACTCCCAAAAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAAGACCTTGAGCTCGCACTTGAAGGGGCTCTAGACAAGGGACATGAAGTGACCCTGGAGGCACTCCCAAAAGA  962

Query  963  TGTCCTGCTATCAAAGGAGGCCGTGGGCGCCATCCTCTATTTCGTTGGAGCCCTAACAGAGCTAAGTGAAGCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTCCTGCTATCAAAGGAGGCCGTGGGCGCCATCCTCTATTTCGTTGGAGCCCTAACAGAGCTAAGTGAAGCCC  1036

Query 1037  AACAGAAGCTGCTGGTGAAATCCATGGAGAAAAAGATCCTACCCGTGCAGCTAAAGCTGGTGGAGAGCACGATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AACAGAAGCTGCTGGTGAAATCCATGGAGAAAAAGATCCTACCCGTGCAGCTAAAGCTGGTGGAGAGCACGATG  1110

Query 1111  GAACAGAACTTCCTGCTGGATAAAGAGGGTGTTTTCCCCCTGCAACCTGAGCTGCTCTCCTCCCTTGGGGACGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAACAGAACTTCCTGCTGGATAAAGAGGGTGTTTTCCCCCTGCAACCTGAGCTGCTCTCCTCCCTTGGGGACGA  1184

Query 1185  GGAGCTGACCCTCACGGAGGCTCTAGTCGGGCTGAGTGGCCTGGAAGTGCAGAGATCGGGCCCCCAATATATGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGCTGACCCTCACGGAGGCTCTAGTCGGGCTGAGTGGCCTGGAAGTGCAGAGATCGGGCCCCCAATATATGT  1258

Query 1259  GGGACCCAGACACCCTCCCTCGCCTCTGTGCTCTTTATGCAGGCCTCTCTCTCCTTCAGCAGCTTACCAAGGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGACCCAGACACCCTCCCTCGCCTCTGTGCTCTTTATGCAGGCCTCTCTCTCCTTCAGCAGCTTACCAAGGCC  1332

Query 1333  TCC  1335
            |||
Sbjct 1333  TCC  1335