Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09958
• Subject: NM_146090.5
• Aligned Length: 1132
• Identities: 957
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGCTGCGGCTGGTGCCCACCGGGGCCCGGGCCATCGTGGACATGTCGTACGCCCGCCACTTCCTGGACTTCCA  74
            ||||||.||||||.|.||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGAGGCTGGCGGCCGCCGGGGCCCGAGCCATCGTGGACATGTCGTACGCCCGTCACTTCCTGGACTTCCA  74

Query   75  GGGCTCCGCCATTCCCCAAGCCATGCAGAAGCTGGTGGTGACCCGGCTGAGCCCCAACTTCCGCGAGGCCGTCA  148
            ||||||||||||.||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct   75  GGGCTCCGCCATCCCCCGAACCATGCAGAAGCTGGTGGTGACCCGGCTGAGCCCTAACTTCCACGAGGCCGTCA  148

Query  149  CCCTGAGCCGGGACTGCCCGGTGCCGCTCCCCGGGGACGGAGACCTCCTCGTCCGGAACCGATTTGTTGGTGTT  222
            |||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||
Sbjct  149  CCCTGCGCCGGGACTGCCCAGTGCCGCTCCCCGGGGACGGAGACCTCCTCGTCCGGAACCGATTCGTTGGTATT  222

Query  223  AATGCATCTGACATCAACTATTCAGCAGGCCGCTATGACCCCTCAGTTAAGCCTCCCTTTGACATAGGTTTCGA  296
            ||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||..|.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  223  AACGCATCTGACATCAACTATTCGGCTGGCCGCTACGACCCGTCCCTGAAGCCACCCTTTGACATAGGTTTTGA  296

Query  297  AGGCATTGGGGAGGTGGTGGCCCTAGGCCTCTCTGCTAGTGCCAGATACACAGTTGGCCAAGCTGTGGCTTACA  370
            |||.|||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  297  AGGGATTGGTGAGGTGGTGGCCTTAGGCCTCTCTGCTAGTGCTAGGTACACAGTGGGCCAGGCTGTGGCTTATA  370

Query  371  TGGCACCTGGTTCTTTTGCTGAGTACACAGTTGTGCCTGCCAGCATTGCAACTCCAGTGCCCTCAGTGAAACCC  444
            ||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||.|||..||||.|||||||||||.
Sbjct  371  TGGCTCCTGGTTCCTTTGCTGAGTATACAGTGGTGCCTGCTAGCATTGCAATTCCCATGCCTTCAGTGAAACCA  444

Query  445  GAGTATCTTACCCTGCTGGTAAGTGGCACCACCGCATACATCAGCCTGAAAGAGCTCGGAGGACTGTCGGAAGG  518
            ||||||||.|||.|||||||.|||||||||||.||||||.||||||||.|||||||.||.|.||||||.|||||
Sbjct  445  GAGTATCTCACCATGCTGGTTAGTGGCACCACTGCATACCTCAGCCTGGAAGAGCTTGGGGAACTGTCAGAAGG  518

Query  519  GAAAAAAGTTTTGGTGACAGCAGCAGCTGGGGGAACGGGCCAGTTTGCCATGCAGCTTTCAAAGAAGGCAAAGT  592
            |||.||||||.||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||..||||||||||.||||..||.||||
Sbjct  519  GAAGAAAGTTCTGGTCACAGCAGCCGCTGGGGGCACAGGCCAGTTTGCTGTGCAGCTTTCCAAGATAGCCAAGT  592

Query  593  GCCATGTAATTGGAACCTGCTCTTCTGATGAAAAGTCTGCTTTTCTGAAATCTCTTGGCTGTGATCGTCCTATC  666
            ||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||.|.||||||||||||||..||||.||||||||.||.|||
Sbjct  593  GCCACGTTATCGGAACCTGCTCCTCAGACGAAAAGGCAGCTTTTCTGAAATCAATTGGGTGTGATCGGCCCATC  666

Query  667  AACTATAAAACTGAACCCGTAGGTACCGTCCTTAAGCAGGAGTACCCTGAAGGTGTCGATGTGGTCTATGAATC  740
            |||||.|.|||.||.||.||.|..||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct  667  AACTACAGAACAGAGCCTGTGGAGACGGTTCTGAAGCAGGAGTACCCTGAAGGCGTTGACGTAGTCTATGAGTC  740

Query  741  TGTTGGGGGAGCCATGTTTGACTTGGCTGTAGACGCCCTGGCTACGAAAGGGCGCTTGATAGTAATAGGGTTTA  814
            ||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||.||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  741  TGTTGGGGGAGCCATGTTTGACCTGGCTGTGGATGCCTTGGCCACCAAAGGGCGCTTGATAGTGATTGGGTTTA  814

Query  815  TCTCTGGCTACCAAACTCCTACTGGCCTTTCGCCTGTGAAAGCAGGAACATTGCCAGCCAAACTGCTCAAGAAA  888
            |||||||||||||||..|||||.||.||.||.||..|.|||||.|||...||||||.||||.||.||.|||||.
Sbjct  815  TCTCTGGCTACCAAAGCCCTACAGGACTCTCACCAATAAAAGCGGGAGTTTTGCCAACCAAGCTCCTGAAGAAG  888

Query  889  TCTGCCAGCGTACA-GGGCTTCTTCCTGAACCATTACCTTTCTAAGTATCAAGCAGCCATGAGCCACTTGCTCG  961
            ||.||||||.| || |||.|||||.||||||||.|||.|.||.|||||.||.||.||||||...|..|||||.|
Sbjct  889  TCGGCCAGCCT-CAGGGGTTTCTTTCTGAACCACTACTTCTCCAAGTACCAGGCTGCCATGGAACGTTTGCTGG  961

Query  962  AGATGTGTGTGAGCGGAGACCTGGTTTGTGAGGTGGACCTTGGAGATCTGTCTCCAGAGGGCAGGTTTACTGGC  1035
            ||.|||..|...|.||.||||||||.||||||||||||||.|||.|.|||.||||.||.||.|||||.|.||||
Sbjct  962  AGCTGTACGCTCGTGGGGACCTGGTGTGTGAGGTGGACCTGGGACACCTGGCTCCGGATGGAAGGTTCATTGGC  1035

Query 1036  CTGGAGTCCATATTCCGTGCTGTCAATTATATGTACATGGGAAAAAACACTGGAAAAATTGTAGTTGAATTACC  1109
            |||||||||.|.||.|..||||||.|.||||||||||.|||.|||||.|||||.||..||||.|||||.|||||
Sbjct 1036  CTGGAGTCCGTGTTTCAGGCTGTCGACTATATGTACACGGGGAAAAATACTGGGAAGCTTGTTGTTGAGTTACC  1109

Query 1110  TCACTCTGTCAACAGTAAGCTG  1131
            .|||.||||||.||||||||||
Sbjct 1110  ACACCCTGTCAGCAGTAAGCTG  1131