Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09988
• Subject: NM_213603.3
• Aligned Length: 1275
• Identities: 1273
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTTCCCACCAGCCAGGGGGAAGGAGCTGCTCTCGTTTGAGGATGTGGCGATGTACTTCACCAGAGAGGAGTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTCCCACCAGCCAGGGGGAAGGAGCTGCTCTCGTTTGAGGATGTGGCGATGTACTTCACCAGAGAGGAGTG  74

Query   75  GGGCCACCTCAACTGGGGTCAGAAGGACCTCTACCGAGATGTGATGTTGGAGAACTACAGGAACATGGTCTTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCCACCTCAACTGGGGTCAGAAGGACCTCTACCGAGATGTGATGTTGGAGAACTACAGGAACATGGTCTTGC  148

Query  149  TGGGATTTCAGTTTCCCAAACCTGAGATGATCTGTCAGCTGGAGAACTGGGACGAGCAGTGGATCCTGGATCTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGGATTTCAGTTTCCCAAACCTGAGATGATCTGTCAGCTGGAGAACTGGGACGAGCAGTGGATCCTGGATCTA  222

Query  223  CCGAGAGCTGGGAATAGGAAGGCTTCCGGTAGTGCTTGCCCAGGTTCTGAAGCCAGACACAAGATGAAAAAGCT  296
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCGAGAACTGGGAATAGGAAGGCTTCCGGTAGTGCTTGCCCAGGTTCTGAAGCCAGACACAAGATGAAAAAGCT  296

Query  297  AACTCCAAAACAGAAATTTTCTGAAGATTTAGAGTCATATAAGATATCAGTGGTAATGCAGGAATCAGCTGAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACTCCAAAACAGAAATTTTCTGAAGATTTAGAGTCATATAAGATATCAGTGGTAATGCAGGAATCAGCTGAGA  370

Query  371  AACTTTCAGAAAAGTTACATAAGTGTAAAGAATTTGTGGACAGTTGCAGGCTTACTTTCCCTACTAGTGGTGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACTTTCAGAAAAGTTACATAAGTGTAAAGAATTTGTGGACAGTTGCAGGCTTACTTTCCCTACTAGTGGTGAT  444

Query  445  GAATACAGCAGGGGCTTCCTTCAAAACCTTAACCTTATTCAAGATCAGAATGCGCAAACAAGGTGGAAGCAGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAATACAGCAGGGGCTTCCTTCAAAACCTTAACCTTATTCAAGATCAGAATGCGCAAACAAGGTGGAAGCAGGG  518

Query  519  CAGATATGATGAGGATGGCAAACCCTTCAATCAAAGATCTTTGCTTTTGGGGCATGAGCGAATTCTCACAAGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGATATGATGAGGATGGCAAACCCTTCAATCAAAGATCTTTGCTTTTGGGGCATGAGCGAATTCTCACAAGAG  592

Query  593  CAAAGTCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTCATTAGGCGTAAGGCATGGTTTGATCAACATCAAAGAATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAAAGTCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTCATTAGGCGTAAGGCATGGTTTGATCAACATCAAAGAATT  666

Query  667  CACTTTTTAGAGAATCCTTTTGAGTGTAAGGTCTGTGGGCAAGCCTTCAGACAGCGGTCAGCTCTTACGGTCCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACTTTTTAGAGAATCCTTTTGAGTGTAAGGTCTGTGGGCAAGCCTTCAGACAGCGGTCAGCTCTTACGGTCCA  740

Query  741  TAAACAGTGTCACCTGCAAAACAAGCCATACAGATGTCATGACTGTGGAAAGTGTTTTCGGCAGCTCGCGTATA  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  741  TAAACAGTGTCACCTGCAAAACAAGCCATACAGATGTCATGACTGTGGAAAGTGTTTTCGGCAGCTCGCGTATC  814

Query  815  TTGTTGAACATAAGAGGATTCACACCAAAGAAAAACCTTATAAATGTAGCAAATGTGAAAAAACGTTTAGTCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGTTGAACATAAGAGGATTCACACCAAAGAAAAACCTTATAAATGTAGCAAATGTGAAAAAACGTTTAGTCAG  888

Query  889  AATTCAACCCTTATTCGACATCAGGTGATCCATAGTGGAGAAAAACGCCATAAATGCCTTGAGTGTGGAAAAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATTCAACCCTTATTCGACATCAGGTGATCCATAGTGGAGAAAAACGCCATAAATGCCTTGAGTGTGGAAAAGC  962

Query  963  CTTTGGCCGGCATTCAACCCTTCTATGTCATCAACAGATTCACAGTAAACCGAACACCCATAAATGCAGTGAAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTTGGCCGGCATTCAACCCTTCTATGTCATCAACAGATTCACAGTAAACCGAACACCCATAAATGCAGTGAAT  1036

Query 1037  GTGGACAGTCCTTTGGTAGGAATGTGGATCTCATTCAGCATCAAAGAATCCATACAAAGGAGGAATTCTTTCAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGGACAGTCCTTTGGTAGGAATGTGGATCTCATTCAGCATCAAAGAATCCATACAAAGGAGGAATTCTTTCAA  1110

Query 1111  TGTGGAGAATGTGGGAAAACGTTTAGTTTTAAGAGGAATCTTTTTCGACATCAGGTCATTCACACTGGAAGCCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGTGGAGAATGTGGGAAAACGTTTAGTTTTAAGAGGAATCTTTTTCGACATCAGGTCATTCACACTGGAAGCCA  1184

Query 1185  ACCCTACCAATGTGTCATATGTGGAAAATCTTTCAAGTGGCACACAAGCTTTATTAAGCACCAGGGCACTCACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACCCTACCAATGTGTCATATGTGGAAAATCTTTCAAGTGGCACACAAGCTTTATTAAGCACCAGGGCACTCACA  1258

Query 1259  AAGGACAGATATCCACA  1275
            |||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGGACAGATATCCACA  1275