Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09988
• Subject: XM_017012022.1
• Aligned Length: 1294
• Identities: 1184
• Gaps: 89

Alignment

Query    1  ATGTTCC--CACCAGCCAGGGGGAAGGAGCTGCTCT---CGTTTGAGG---AT--------GTGGCGA-TGTAC  57
            |||.|.|  .||||               |||..||   |||.|..||   ||        ||.||.| |||||
Sbjct    1  ATGCTGCAATACCA---------------CTGTGCTGAACGTCTCTGGCACATTCATCTTGGTTGCAATTGTAC  59

Query   58  TTCACCAGAGAGGAGTGGGGCCACCTCAACTGGGGTCAGAAGGACCTCTACCGAGATGTG--ATGTTGGAGAAC  129
            ||.|              |||.|                   .|..||||   ||| |||  |||       ||
Sbjct   60  TTTA--------------GGCTA-------------------TATTTCTA---AGA-GTGAAATG-------AC  89

Query  130  TACAGGAACATGGTCTTGCTGGGATTTCAGTTTCCCAAACCTGAGATGATCTGTCAGCTGGAGAACTGGGACGA  203
            .||||..|.|           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   90  CACAGCCAAA-----------GGATTTCAGTTTCCCAAACCTGAGATGATCTGTCAGCTGGAGAACTGGGACGA  152

Query  204  GCAGTGGATCCTGGATCTACCGAGAGCTGGGAATAGGAAGGCTTCCGGTAGTGCTTGCCCAGGTTCTGAAGCCA  277
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  153  GCAGTGGATCCTGGATCTACCGAGAACTGGGAATAGGAAGGCTTCCGGTAGTGCTTGCCCAGGTTCTGAAGCCA  226

Query  278  GACACAAGATGAAAAAGCTAACTCCAAAACAGAAATTTTCTGAAGATTTAGAGTCATATAAGATATCAGTGGTA  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  GACACAAGATGAAAAAGCTAACTCCAAAACAGAAATTTTCTGAAGATTTAGAGTCATATAAGATATCAGTGGTA  300

Query  352  ATGCAGGAATCAGCTGAGAAACTTTCAGAAAAGTTACATAAGTGTAAAGAATTTGTGGACAGTTGCAGGCTTAC  425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ATGCAGGAATCAGCTGAGAAACTTTCAGAAAAGTTACATAAGTGTAAAGAATTTGTGGACAGTTGCAGGCTTAC  374

Query  426  TTTCCCTACTAGTGGTGATGAATACAGCAGGGGCTTCCTTCAAAACCTTAACCTTATTCAAGATCAGAATGCGC  499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  TTTCCCTACTAGTGGTGATGAATACAGCAGGGGCTTCCTTCAAAACCTTAACCTTATTCAAGATCAGAATGCGC  448

Query  500  AAACAAGGTGGAAGCAGGGCAGATATGATGAGGATGGCAAACCCTTCAATCAAAGATCTTTGCTTTTGGGGCAT  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  AAACAAGGTGGAAGCAGGGCAGATATGATGAGGATGGCAAACCCTTCAATCAAAGATCTTTGCTTTTGGGGCAT  522

Query  574  GAGCGAATTCTCACAAGAGCAAAGTCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTCATTAGGCGTAAGGCATGGTT  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  GAGCGAATTCTCACAAGAGCAAAGTCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAAGTCATTAGGCGTAAGGCATGGTT  596

Query  648  TGATCAACATCAAAGAATTCACTTTTTAGAGAATCCTTTTGAGTGTAAGGTCTGTGGGCAAGCCTTCAGACAGC  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  TGATCAACATCAAAGAATTCACTTTTTAGAGAATCCTTTTGAGTGTAAGGTCTGTGGGCAAGCCTTCAGACAGC  670

Query  722  GGTCAGCTCTTACGGTCCATAAACAGTGTCACCTGCAAAACAAGCCATACAGATGTCATGACTGTGGAAAGTGT  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  GGTCAGCTCTTACGGTCCATAAACAGTGTCACCTGCAAAACAAGCCATACAGATGTCATGACTGTGGAAAGTGT  744

Query  796  TTTCGGCAGCTCGCGTATATTGTTGAACATAAGAGGATTCACACCAAAGAAAAACCTTATAAATGTAGCAAATG  869
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  TTTCGGCAGCTCGCGTATCTTGTTGAACATAAGAGGATTCACACCAAAGAAAAACCTTATAAATGTAGCAAATG  818

Query  870  TGAAAAAACGTTTAGTCAGAATTCAACCCTTATTCGACATCAGGTGATCCATAGTGGAGAAAAACGCCATAAAT  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  819  TGAAAAAACGTTTAGTCAGAATTCAACCCTTATTCGACATCAGGTGATCCATAGTGGAGAAAAACGCCATAAAT  892

Query  944  GCCTTGAGTGTGGAAAAGCCTTTGGCCGGCATTCAACCCTTCTATGTCATCAACAGATTCACAGTAAACCGAAC  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  893  GCCTTGAGTGTGGAAAAGCCTTTGGCCGGCATTCAACCCTTCTATGTCATCAACAGATTCACAGTAAACCGAAC  966

Query 1018  ACCCATAAATGCAGTGAATGTGGACAGTCCTTTGGTAGGAATGTGGATCTCATTCAGCATCAAAGAATCCATAC  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  967  ACCCATAAATGCAGTGAATGTGGACAGTCCTTTGGTAGGAATGTGGATCTCATTCAGCATCAAAGAATCCATAC  1040

Query 1092  AAAGGAGGAATTCTTTCAATGTGGAGAATGTGGGAAAACGTTTAGTTTTAAGAGGAATCTTTTTCGACATCAGG  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041  AAAGGAGGAATTCTTTCAATGTGGAGAATGTGGGAAAACGTTTAGTTTTAAGAGGAATCTTTTTCGACATCAGG  1114

Query 1166  TCATTCACACTGGAAGCCAACCCTACCAATGTGTCATATGTGGAAAATCTTTCAAGTGGCACACAAGCTTTATT  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  TCATTCACACTGGAAGCCAACCCTACCAATGTGTCATATGTGGAAAATCTTTCAAGTGGCACACAAGCTTTATT  1188

Query 1240  AAGCACCAGGGCACTCACAAAGGACAGATATCCACA  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189  AAGCACCAGGGCACTCACAAAGGACAGATATCCACA  1224