Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10057
• Subject: NM_001011880.2
• Aligned Length: 1365
• Identities: 1326
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGCTGCATCCAGAGACCTCCCCTGGCCGGGGGCATCTCCTGGCTGTGCTCCTGGCCCTCCTTGGCACCGCCTG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct    1  ATGCTGCATCCAGAGACCTCCCCTGGCCGGGGGCATCTCCTGGCTGTGCTCCTGGCCCTCCTTGGCACCACCTG  74

Query   75  GGCAGAGGTGTGGCCACCCCAGCTGCAGGAGCAGGCTCCGATGGCCGGAGCCCTGAACAGGAAGGAGAGTTTCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCAGAGGTGTGGCCACCCCAGCTGCAGGAGCAGGCTCCGATGGCCGGAGCCCTGAACAGGAAGGAGAGTTTCT  148

Query  149  TGCTCCTCTCCCTGCACAACCGCCTGCGCAGCTGGGTCCAGCCCCCTGCGGCTGACATGCGGAGGCTGGACTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTCCTCTCCCTGCACAACCGCCTGCGCAGCTGGGTCCAGCCCCCTGCGGCTGACATGCGGAGGCTGGACTGG  222

Query  223  AGTGACAGCCTGGCCCAGCTGGCTCAAGCCAGGGCAGCCCTCTGTGGAACCCCAACCCCGAGCCTGGCGTCCGG  296
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTGACAGCCTGGCCCAACTGGCTCAAGCCAGGGCAGCCCTCTGTGGAATCCCAACCCCGAGCCTGGCGTCCGG  296

Query  297  CCTGTGGCGCACCCTGCAAGTGGGCTGGAACATGCAGCTGCTACCCGCGGGCTTGGTGTCCTTTGTCGAAGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct  297  CCTGTGGCGCACCCTGCAAGTGGGCTGGAACATGCAGCTGCTGCCCGCGGGCTTGGCGTCCTTTGTTGAAGTGG  370

Query  371  TCAGCCTATGGTTTGCAGAGGGGCAGCGGTACAGCCACGCGGCAGGAGAGTGTGCTCGCAACGCCACCTGCACC  444
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAGCCTGTGGTTTGCAGAGGGGCAGCGGTACAGCCACGCGGCAGGAGAGTGTGCTCGCAACGCCACCTGCACC  444

Query  445  CACTACACGCAGCTCGTGTGGGCCACCTCAAGCCAGCTGGGCTGTGGGCGGCACCTGTGCTCTGCAGGCCAGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  445  CACTACACGCAGCTCGTGTGGGCCACCTCAAGCCAGCTGGGCTGTGGGCGGCACCTGTGCTCTGCAGGCCAGAC  518

Query  519  AGCGATAGAAGCCTTTGTCTGTGCCTACTCCCCCAGAGGCAACTGGGAGGTCAACGGGAAGACAATCGTCCCCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  519  AGCGATAGAAGCCTTTGTCTGTGCCTACTCCCCCGGAGGCAACTGGGAGGTCAACGGGAAGACAATCATCCCCT  592

Query  593  ATAAGAAGGGTGCCTGGTGTTCGCTCTGCACAGCCAGTGTCTCAGGCTGCTTCAAAGCCTGGGACCATGCAGGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAAGAAGGGTGCCTGGTGTTCGCTCTGCACAGCCAGTGTCTCAGGCTGCTTCAAAGCCTGGGACCATGCAGGG  666

Query  667  GGGCTCTGTGAGGTCCCCAGGAATCCTTGTCGCATGAGCTGCCAGAACCATGGACGTCTCAACATCAGCACCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGCTCTGTGAGGTCCCCAGGAATCCTTGTCGCATGAGCTGCCAGAACCATGGACGTCTCAACATCAGCACCTG  740

Query  741  CCACTGCCACTGTCCCCCTGGCTACACGGGCAGATACTGCCAAGTGAGGTGCAGCCTGCAGTGTGTGCACGGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCACTGCCACTGTCCCCCTGGCTACACGGGCAGATACTGCCAAGTGAGGTGCAGCCTGCAGTGTGTGCACGGCC  814

Query  815  GGCTCCGGGAGGAGGAGTGCTCGTGCGTCTGTGACATCGGCTACGGGGGAGCCCAGTGTGCCACCAAGGTGCAT  888
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGTTCCGGGAGGAGGAGTGCTCGTGCGTCTGTGACATCGGCTACGGGGGAGCCCAGTGTGCCACCAAGGTGCAT  888

Query  889  TTTCCCTTCCACACCTGTGACCTGAGGATCGACGGAGACTGCTTCATGGTGTCTTCAGAGGCAGACACCTATTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTCCCTTCCACACCTGTGACCTGAGGATCGACGGAGACTGCTTCATGGTGTCTTCAGAGGCAGACACCTATTA  962

Query  963  CAGAGCCAGGATGAAATGTCAGAGGAAAGGCGGGGTGCTGGCCCAGATCAAGAGCCAGAAAGTGCAGGACATCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGAGCCAGGATGAAATGTCAGAGGAAAGGCGGGGTGCTGGCCCAGATCAAGAGCCAGAAAGTGCAGGACATCC  1036

Query 1037  TCGCCTTCTATCTGGGCCGCCTGGAGACCACCAACGAGGTGATTGACAGTGACTTCGAGACCAGGAACTTCTGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGCCTTCTATCTGGGCCGCCTGGAGACCACCAACGAGGTGATTGACAGTGACTTCGAGACCAGGAACTTCTGG  1110

Query 1111  ATCGGGCTCACCTACAAGACCGCCAAGGACTCCTTCCGCTGGGCCACAGGGGAGCACCAGGCCTTCACCAGTTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCGGGCTCACCTACAAGACCGCCAAGGACTCCTTCCGCTGGGCCACAGGGGAGCACCAGGCCTTCACCAGTTT  1184

Query 1185  TGCCTTTGGGCAGCCTGACAACCAC---------------------------GGGTTTGGCAACTGCGTGGAGC  1231
            |||||||||||||||||||||||||                           ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCTTTGGGCAGCCTGACAACCACGGGCTGGTGTGGCTGAGTGCTGCCATGGGGTTTGGCAACTGCGTGGAGC  1258

Query 1232  TGCAGGCTTCAGCTGCCTTCAACTGGAACAACCAGCGCTGCAAAACCCGAAACCGTTACATCTGCCAGTTTGCC  1305
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCAGGCTTCAGCTGCCTTCAACTGGAACGACCAGCGCTGCAAAACCCGAAACCGTTACATCTGCCAGTTTGCC  1332

Query 1306  CAGGAGCACATCTCCCGGTGGGGCCCAGGGTCC  1338
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGGAGCACATCTCCCGGTGGGGCCCAGGGTCC  1365