Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10057
• Subject: XM_017023206.1
• Aligned Length: 1435
• Identities: 1322
• Gaps: 104

Alignment

Query    1  ATGCTGCATCCAGAGACCTCCCCTGGCCGGGGGCATCTCCTGGCTGTGCTCCTGGCCCTCCTTGGCACCGCCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGCATCCAGAGACCTCCCCTGGCCGGGGGCATCTCCTGGCTGTGCTCCTGGCCCTCCTTGGCACCGCCTG  74

Query   75  GGCAGAGGTGTGGCCACCCCAGCTGCAGGAGCAGGCTCCGATGGCCGGAGCCCTGAACAGGAAGGAGAGTTTCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCAGAGGTGTGGCCACCCCAGCTGCAGGAGCAGGCTCCGATGGCCGGAGCCCTGAACAGGAAGGAGAGTTTCT  148

Query  149  TGCTCCTCTCCCTGCACAACCGCCTGCGCAGCTGGGTCCAGCCCCCTGCGGCTGACATGCGGAGGCTGGACTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTCCTCTCCCTGCACAACCGCCTGCGCAGCTGGGTCCAGCCCCCTGCGGCTGACATGCGGAGGCTGGACTGG  222

Query  223  AGTGACAGCCTGGCCCAGCTGGCTCAAGCCAGGGCAGCCCTCTGTGGAACCCCAACCCCGAGCCTGGCGTCCGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTGACAGCCTGGCCCAGCTGGCTCAAGCCAGGGCAGCCCTCTGTGGAACCCCAACCCCGAGCCTGGCGTCCGG  296

Query  297  CCTGTGGCGCACCCTGCAAGTGGGCTGGAACATGCAGCTGCTACCCGCGGGCTTGGTGTCCTTTGTCGAAGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGTGGCGCACCCTGCAAGTGGGCTGGAACATGCAGCTGCTACCCGCGGGCTTGGTGTCCTTTGTCGAAGTGG  370

Query  371  TCAGCCTATGGTTTGCAGAGGGGCAGCGGTACAGCCACGCGGCAGGAGAGTGTGCTCGCAACGCCACCTGCACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAGCCTATGGTTTGCAGAGGGGCAGCGGTACAGCCACGCGGCAGGAGAGTGTGCTCGCAACGCCACCTGCACC  444

Query  445  CACTACACGCAGCTCGTGTGGGCCACCTCAAGCCAGCTGGGCTGTGGGCGGCACCTGTGCTCTGCAGGCCAGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACTACACGCAGCTCGTGTGGGCCACCTCAAGCCAGCTGGGCTGTGGGCGGCACCTGTGCTCTGCAGGCCAGGC  518

Query  519  AGCGATAGAAGCCTTTGTCTGTGCCTACTCCCCCAGAGGCAACTGGGAGGTCAACGGGAAGACAATCGTCCCCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCGATAGAAGCCTTTGTCTGTGCCTACTCCCCCAGAGGCAACTGGGAGGTCAACGGGAAGACAATCGTCCCCT  592

Query  593  ATAAGAAGGGTGCCTGGTGTTCGCTCTGCACAGCCAGTGTCTCAGGCTGCTTCAAAGCCTGGGACCATGCAGGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAAGAAGGGTGCCTGGTGTTCGCTCTGCACAGCCAGTGTCTCAGGCTGCTTCAAAGCCTGGGACCATGCAGGG  666

Query  667  GGGCTCTGTGAGGTCCCCAGGAATCCTTGTCGCATGAGCTGCCAGAACCATGGACGTCTCAACATCAGCACCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGCTCTGTGAGGTCCCCAGGAATCCTTGTCGCATGAGCTGCCAGAACCATGGACGTCTCAACATCAGCACCTG  740

Query  741  CCACTGCCACTGTCCCCCTGGCTACACGGGCAGATACTGCCAAGTGAGGTGCAGCCTGCAGTGTGTGCACGGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCACTGCCACTGTCCCCCTGGCTACACGGGCAGATACTGCCAAGTGAGGTGCAGCCTGCAGTGTGTGCACGGCC  814

Query  815  GGCTCCGGGAGGAGGAGTGCTCGTGCGTCTGTGACATCGGCTACGGGGGAGCCCAGTGTGCCACCAAGGTGCAT  888
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGTTCCGGGAGGAGGAGTGCTCGTGCGTCTGTGACATCGGCTACGGGGGAGCCCAGTGTGCCACCAAGGTGCAT  888

Query  889  TTTCCCTTCCACACCTGTGACCTGAGGATCGACGGAGACTGCTTCATGGTGTCTTCAGAGGCAGACACCTATTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTCCCTTCCACACCTGTGACCTGAGGATCGACGGAGACTGCTTCATGGTGTCTTCAGAGGCAGACACCTATTA  962

Query  963  CAGAGCCAGGATGAAATGTCAGAGGAAAGGCGGGGTGCTGGCCCAGATCAAGAGCCAGAAAGTGCAGGACATCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGAGCCAGGATGAAATGTCAGAGGAAAGGCGGGGTGCTGGCCCAGATCAAGAGCCAGAAAGTGCAGGACATCC  1036

Query 1037  TCGCCTTCTATCTGGGCCGCCTGGAGACCACCAACGAGGTGATTGACAGTGACTTCGAGACCAGGAACTTCTGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGCCTTCTATCTGGGCCGCCTGGAGACCACCAACGAGGTGATTGACAGTGACTTCGAGACCAGGAACTTCTGG  1110

Query 1111  ATCGGGCTCACCTACAAGACCGCCAAGGACTCCTTCCGCTGGGCCACAGGGGAGCACCAGGCCTTCACCAGTTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCGGGCTCACCTACAAGACCGCCAAGGACTCCTTCCGCTGGGCCACAGGGGAGCACCAGGCCTTCACCAGTTT  1184

Query 1185  TGCCTTTGGGCAGCCTGACAACCACGGGTTTGGCAACTGCGTGGAGCTGCAGGCTTCAGCTGCCTTCAACTGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCTTTGGGCAGCCTGACAACCACGGGTTTGGCAACTGCGTGGAGCTGCAGGCTTCAGCTGCCTTCAACTGGA  1258

Query 1259  ACAACCAGCGCTGCAAAACCCGAAACCGTTACATCTGCCAGTT----------------------TGCCCA---  1307
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      ||||||   
Sbjct 1259  ACGACCAGCGCTGCAAAACCCGAAACCGTTACATCTGCCAGTTTGGCTCTCCTTCTGCCTCCGCATGCCCAACG  1332

Query 1308  ----GGAGCACATCTCCCGGTGGGGCCCAGG---------GTCC------------------------------  1338
                ||||.|.|.|.|       ||.|||.|         |.||                              
Sbjct 1333  ATCCGGAGAAAAACAC-------GGACCATGACATCAAAAGGCCTTGGCAAAGGAATCGTGATTATTGTGATAC  1399

Query 1339  -----------------------------  1338
                                         
Sbjct 1400  AAGATTCTGCACCTCAAAGGGGATCCCTG  1428