Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10057
• Subject: XM_017023208.2
• Aligned Length: 1435
• Identities: 1082
• Gaps: 344

Alignment

Query    1  ATGCTGCATCCAGAGACCTCCCCTGGCCGGGGGCATCTCCTGGCTGTGCTCCTGGCCCTCCTTGGCACCGCCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGCATCCAGAGACCTCCCCTGGCCGGGGGCATCTCCTGGCTGTGCTCCTGGCCCTCCTTGGCACCGCCTG  74

Query   75  GGCAGAGGTGTGGCCACCCCAGCTGCAGGAGCAGGCTCCGATGGCCGGAGCCCTGAACAGGAAGGAGAGTTTCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCAGAGGTGTGGCCACCCCAGCTGCAGGAGCAGGCTCCGATGGCCGGAGCCCTGAACAGGAAGGAGAGTTTCT  148

Query  149  TGCTCCTCTCCCTGCACAACCGCCTGCGCAGCTGGGTCCAGCCCCCTGCGGCTGACATGCGGAGGCTGGACTGG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  149  TGCTCCTCTCCCTGCACAACCGCCTGCGCAGCTGGGTCCAGCCCCCTGCGGCTGACATGCGGAGGCT-------  215

Query  223  AGTGACAGCCTGGCCCAGCTGGCTCAAGCCAGGGCAGCCCTCTGTGGAACCCCAACCCCGAGCCTGGCGTCCGG  296
                                                                                      
Sbjct  216  --------------------------------------------------------------------------  215

Query  297  CCTGTGGCGCACCCTGCAAGTGGGCTGGAACATGCAGCTGCTACCCGCGGGCTTGGTGTCCTTTGTCGAAGTGG  370
                                                                                      
Sbjct  216  --------------------------------------------------------------------------  215

Query  371  TCAGCCTATGGTTTGCAGAGGGGCAGCGGTACAGCCACGCGGCAGGAGAGTGTGCTCGCAACGCCACCTGCACC  444
                                                                                      
Sbjct  216  --------------------------------------------------------------------------  215

Query  445  CACTACACGCAGCTCGTGTGGGCCACCTCAAGCCAGCTGGGCTGTGGGCGGCACCTGTGCTCTGCAGGCCAGGC  518
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  -----------GCTCGTGTGGGCCACCTCAAGCCAGCTGGGCTGTGGGCGGCACCTGTGCTCTGCAGGCCAGGC  278

Query  519  AGCGATAGAAGCCTTTGTCTGTGCCTACTCCCCCAGAGGCAACTGGGAGGTCAACGGGAAGACAATCGTCCCCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  279  AGCGATAGAAGCCTTTGTCTGTGCCTACTCCCCCAGAGGCAACTGGGAGGTCAACGGGAAGACAATCGTCCCCT  352

Query  593  ATAAGAAGGGTGCCTGGTGTTCGCTCTGCACAGCCAGTGTCTCAGGCTGCTTCAAAGCCTGGGACCATGCAGGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  353  ATAAGAAGGGTGCCTGGTGTTCGCTCTGCACAGCCAGTGTCTCAGGCTGCTTCAAAGCCTGGGACCATGCAGGG  426

Query  667  GGGCTCTGTGAGGTCCCCAGGAATCCTTGTCGCATGAGCTGCCAGAACCATGGACGTCTCAACATCAGCACCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  427  GGGCTCTGTGAGGTCCCCAGGAATCCTTGTCGCATGAGCTGCCAGAACCATGGACGTCTCAACATCAGCACCTG  500

Query  741  CCACTGCCACTGTCCCCCTGGCTACACGGGCAGATACTGCCAAGTGAGGTGCAGCCTGCAGTGTGTGCACGGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  501  CCACTGCCACTGTCCCCCTGGCTACACGGGCAGATACTGCCAAGTGAGGTGCAGCCTGCAGTGTGTGCACGGCC  574

Query  815  GGCTCCGGGAGGAGGAGTGCTCGTGCGTCTGTGACATCGGCTACGGGGGAGCCCAGTGTGCCACCAAGGTGCAT  888
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  575  GGTTCCGGGAGGAGGAGTGCTCGTGCGTCTGTGACATCGGCTACGGGGGAGCCCAGTGTGCCACCAAGGTGCAT  648

Query  889  TTTCCCTTCCACACCTGTGACCTGAGGATCGACGGAGACTGCTTCATGGTGTCTTCAGAGGCAGACACCTATTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  649  TTTCCCTTCCACACCTGTGACCTGAGGATCGACGGAGACTGCTTCATGGTGTCTTCAGAGGCAGACACCTATTA  722

Query  963  CAGAGCCAGGATGAAATGTCAGAGGAAAGGCGGGGTGCTGGCCCAGATCAAGAGCCAGAAAGTGCAGGACATCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  723  CAGAGCCAGGATGAAATGTCAGAGGAAAGGCGGGGTGCTGGCCCAGATCAAGAGCCAGAAAGTGCAGGACATCC  796

Query 1037  TCGCCTTCTATCTGGGCCGCCTGGAGACCACCAACGAGGTGATTGACAGTGACTTCGAGACCAGGAACTTCTGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  797  TCGCCTTCTATCTGGGCCGCCTGGAGACCACCAACGAGGTGATTGACAGTGACTTCGAGACCAGGAACTTCTGG  870

Query 1111  ATCGGGCTCACCTACAAGACCGCCAAGGACTCCTTCCGCTGGGCCACAGGGGAGCACCAGGCCTTCACCAGTTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  871  ATCGGGCTCACCTACAAGACCGCCAAGGACTCCTTCCGCTGGGCCACAGGGGAGCACCAGGCCTTCACCAGTTT  944

Query 1185  TGCCTTTGGGCAGCCTGACAACCACGGGTTTGGCAACTGCGTGGAGCTGCAGGCTTCAGCTGCCTTCAACTGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  945  TGCCTTTGGGCAGCCTGACAACCACGGGTTTGGCAACTGCGTGGAGCTGCAGGCTTCAGCTGCCTTCAACTGGA  1018

Query 1259  ACAACCAGCGCTGCAAAACCCGAAACCGTTACATCTGCCAGTT----------------------TGCCCA---  1307
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      ||||||   
Sbjct 1019  ACGACCAGCGCTGCAAAACCCGAAACCGTTACATCTGCCAGTTTGGCTCTCCTTCTGCCTCCGCATGCCCAACG  1092

Query 1308  ----GGAGCACATCTCCCGGTGGGGCCCAGG---------GTCC------------------------------  1338
                ||||.|.|.|.|       ||.|||.|         |.||                              
Sbjct 1093  ATCCGGAGAAAAACAC-------GGACCATGACATCAAAAGGCCTTGGCAAAGGAATCGTGATTATTGTGATAC  1159

Query 1339  -----------------------------  1338
                                         
Sbjct 1160  AAGATTCTGCACCTCAAAGGGGATCCCTG  1188