Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10057
• Subject: XM_024450240.1
• Aligned Length: 1366
• Identities: 1128
• Gaps: 221

Alignment

Query    1  ATGCTGCATCCAGAGACCTCCCCTGGCCGGGGGCATCTCCTGGCTGTGCTCCTGGCCCTCCTTGGCACCGCCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGCATCCAGAGACCTCCCCTGGCCGGGGGCATCTCCTGGCTGTGCTCCTGGCCCTCCTTGGCACCGCCTG  74

Query   75  GGCAGAGGTGTGGCCACCCCAGCTGCAGGAGCAGGCTCCGATGGCCGGAGCCCTGAACAGGAAGGAGAGTTTCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCAGAGGTGTGGCCACCCCAGCTGCAGGAGCAGGCTCCGATGGCCGGAGCCCTGAACAGGAAGGAGAGTTTCT  148

Query  149  TGCTCCTCTCCCTGCACAACCGCCTGCGCAGCTGGGTCCAGCCCCCTGCGGCTGACATGCGGAGGCTGGACTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTCCTCTCCCTGCACAACCGCCTGCGCAGCTGGGTCCAGCCCCCTGCGGCTGACATGCGGAGGCTGGACTGG  222

Query  223  AGTGACAGCCTGGCCCAGCTGGCTCAAGCCAGGGCAGCCCTCTGTGGAACCCCAACCCCGAGCCTGGCGTCCGG  296
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTGACAGCCTGGCCCAACTGGCTCAAGCCAGGGCAGCCCTCTGTGGAATCCCAACCCCGAGCCTGGCGTCCGG  296

Query  297  CCTGTGGCGCACCCTGCAAGTGGGCTGGAACATGCAGCTGCTACCCGCGGGCTTGGTGTCCTTTGTCGAAGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct  297  CCTGTGGCGCACCCTGCAAGTGGGCTGGAACATGCAGCTGCTGCCCGCGGGCTTGGCGTCCTTTGTTGAAGTGG  370

Query  371  TCAGCCTATGGTTTGCAGAGGGGCAGCGGTACAGCCACGCGGCAGGAGAGTGTGCTCGCAACGCCACCTGCACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAGCCTATGGTTTGCAGAGGGGCAGCGGTACAGCCACGCGGCAGGAGAGTGTGCTCGCAACGCCACCTGCACC  444

Query  445  CACTACACGCAGCTCGTGTGGGCCACCTCAAGCCAGCTGGGCTGTGGGCGGCACCTGTGCTCTGCAGGCCAGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACTACACGCAGCTCGTGTGGGCCACCTCAAGCCAGCTGGGCTGTGGGCGGCACCTGTGCTCTGCAGGCCAGGC  518

Query  519  AGCGATAGAAGCCTTTGTCTGTGCCTACTCCCCCAGAGGCAACTGGGAGGTCAACGGGAAGACAATCGTCCCCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCGATAGAAGCCTTTGTCTGTGCCTACTCCCCCAGAGGCAACTGGGAGGTCAACGGGAAGACAATCGTCCCCT  592

Query  593  ATAAGAAGGGTGCCTGGTGTTCGCTCTGCACAGCCAGTGTCTCAGGCTGCTTCAAAGCCTGGGACCATGCAGGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAAGAAGGGTGCCTGGTGTTCGCTCTGCACAGCCAGTGTCTCAGGCTGCTTCAAAGCCTGGGACCATGCAGGG  666

Query  667  GGGCTCTGTGAGGTCCCCAGGAATCCTTGTCGCATGAGCTGCCAGAACCATGGACGTCTCAACATCAGCACCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGCTCTGTGAGGTCCCCAGGAATCCTTGTCGCATGAGCTGCCAGAACCATGGACGTCTCAACATCAGCACCTG  740

Query  741  CCACTGCCACTGTCCCCCTGGCTACACGGGCAGATACTGCCAAGTGAGGTGCAGCCTGCAGTGTGTGCACGGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCACTGCCACTGTCCCCCTGGCTACACGGGCAGATACTGCCAAGTGAGGTGCAGCCTGCAGTGTGTGCACGGCC  814

Query  815  GGCTCCGGGAGGAGGAGTGCTCGTGCGTCTGTGACATCGGCTACGGGGGAGCCCAGTGTGCCACCAAGGTGCAT  888
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGTTCCGGGAGGAGGAGTGCTCGTGCGTCTGTGACATCGGCTACGGGGGAGCCCAGTGTGCCACCAAGGTGCAT  888

Query  889  TTTCCCTTCCACACCTGTGACCTGAGGATCGACGGAGACTGCTTCATGGTGTCTTCAGAGGCAGACACCTATTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTCCCTTCCACACCTGTGACCTGAGGATCGACGGAGACTGCTTCATGGTGTCTTCAGAGGCAGACACCTATTA  962

Query  963  CAGAGCCAGGATGAAATGTCAGAGGA----------AAGGCGGGGTGCTGGCC--CAGAT--CAAGAGCCAGAA  1022
            ||||||||||||||||||||  ||||          |.||||    ||| |||  |||||  ||||.|      
Sbjct  963  CAGAGCCAGGATGAAATGTC--AGGAACCCTGGGCCATGGCG----GCT-GCCAGCAGATGGCAAGGG------  1023

Query 1023  AGTG--CAGGACATCCTCGCCTTCTATCTGGGCCGCCTGGAGACCACCAACGAG-GTGATTGACAG----TGAC  1089
            .|||  .|||                        ||||||||.|||     ||| |.|   |.|||    |.||
Sbjct 1024  TGTGTTGAGG------------------------GCCTGGAGCCCA-----GAGCGGG---GCCAGCTGCTCAC  1065

Query 1090  -----TTCGAGACCAGGAACTTCTGGATC--GGGCTCACCTACAAGACCGCCAAGGACTCCTTCCGCTGGGCCA  1156
                 |||    ||.||||     ||..|  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066  CCCCTTTC----CCGGGAA-----GGGCCCAGGGCTCACCTACAAGACCGCCAAGGACTCCTTCCGCTGGGCCA  1130

Query 1157  CAGGGGAGCACCAGGCCTTCACCAGTTTTGCCTTTGGGCAGCCTGACAACCACGGGTTTGGCAACTGCGTGGAG  1230
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 1131  CAGGGGAGCACCAGGCCTTCACCAGTTTTGCCTTTGGGCAGCC-------------------------------  1173

Query 1231  CTGCAGGCTTCAGCTGCCTTCAACTGGAACAACCAGCGCTGCAAAACCCGAAACCGTTACATCTGCCAGTTTGC  1304
                                                                                      
Sbjct 1174  --------------------------------------------------------------------------  1173

Query 1305  CCAGGAGCACATCTCCCGGTGGGGCCCAGGGTCC  1338
                                              
Sbjct 1174  ----------------------------------  1173