Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10086
• Subject: NM_001367397.1
• Aligned Length: 1341
• Identities: 1248
• Gaps: 76

Alignment

Query    1  MMNRTTPDQELAPASEPVWERPWSVEEIRRSSQSWSLAADAGLLQFLQEFSQQTISRTHEIKKQVDGLIRETKA  74
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Sbjct    1  MMNRTTPDQELVPASEPVWERPWSVEEIRRSSQSWSLAADAGLLQFLQEFSQQTISRTHEIKKQVDGLIRETKA  74

Query   75  TDCRLHNVFNDFLMLSNTQFIENRVYDEEVEEPVLKAEAEKTEQEKTREQKEVDLIPKVQEAVNYGLQVLDSAF  148
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Sbjct   75  TDCRLHNVFNDFLMLSNTQFIENRVYDEEVEEPVLKAEAEKTEQEKTREQKEVDLIPKVQEAVNYGLQVLDSAF  148

Query  149  EQLDIKAGNSDSEEDDANGRVELILEPKDLYIDRPLPYLIGSKLFMEQEDVGLGELSSEEGSVGSDRGSIVDTE  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  EQLDIKAGNSDSEEDDANGRVELILEPKDLYIDRPLPYLIGSKLFMEQEDVGLGELSSEEGSVGSDRGSIVDTE  222

Query  223  EEKEEEESDEDFAHHSDNEQNRHTTQMSDEEEDDDGCDLFADSEKEEEDIEDIEENTRPKRSRPTSFADELAAR  296
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  EEKEEEESDEDFAHHSDNEQNQHTTQMSDEEEDDDGCDLFADSEKEEEDIEDIEENTRPKRSRPTSFADELAAR  296

Query  297  IKGDAVGRVDEEPTTLPSGEAKPRKTLKEKKERRTPSDDEEDNLFAPPKLTDEDFSPFGSGGGLFSGGKGLFDD  370
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  IKGDAMGRVDEEPTTLPSGEAKPRKTLKEKKERRTPSDDEEDNLFAPPKLTDEDFSPFGSGGGLFSGGKGLFDD  370

Query  371  EDEESDLFTEAPQDRQAGASVKEESSSSKPGKKIPAGAVSVFLGDTDVFGAASVPSMKEPQKPEQPTPRKSPYG  444
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  371  EDEESDLFTEASQDRQAGASVKEESSSSKPGKKIPAGAVSVFLGDTDVFGAASVPSLKEPQKPEQPTPRKSPYG  444

Query  445  PPPTGLFDDDDGDDDDDFFSAPHSKPSKTGKVQSTADIFGDEEGDLFKEKAVASPEATVSQTDENKARAEKKVT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  PPPTGLFDDDDGDDDDDFFSAPHSKPSKTRKVQSTADIFGDEEGDLFKEKAVASPEATVSQTDENKARAEKKVT  518

Query  519  LSSSKNLKPSSETKTQKGLFSDEEDSEDLFSSQSASKLKGASLLPGKLPTLVSLFDDEDEEDNLFGGTAAKKQT  592
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  LSYSKNLKPSSETKTQKGLFSDEEDSEDLFSSQSASNLKGASLLPGKLPTSVSLFDDEDEEDNLFGGTAAKKQT  592

Query  593  LCLQAQREEKAKASELSKKKASALLFSSDEEDQWNIPASQTHLASDSRSKGEPRDSGTLQSQEAKAVKKTSLFE  666
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  LSLQAQREEKAKASELSKKKASALLFSSDEEDQWNIPASQTHLASDSRSKGEPRDSGTLQSQEAKAVKKTSLFE  666

Query  667  EDEEDDLFAIAKDSQKKTQRVSLLFEDDVDSGGSLFGSPPTSVPPATKKKETVSEAPPLLFSDEEEKEAQLGVK  740
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  EDKEDDLFAIAKDSQKKTQRVSLLFEDDVDSGGSLFGSPPTSVPPATKKKETVSEAPPLLFSDEEEKEAQLGVK  740

Query  741  SVDKKVESAKESLKFGRTDVAESEKEGLLTRSAQETVKHSDLFSSSSPWDKGTKPRTKTVLSLFDEEEDKMEDQ  814
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Sbjct  741  SVDKKVESAKESLKFGRTDVAESEKEGLLTRSAQETVKHSDLFSSSSPWDKGTKPRTKTVLSLFDEEEDKMEDQ  814

Query  815  NIIQAPQKEVGKGRDPDAHPKSTGVFQDEELLFSHKLQKDNDPDVDLFAGTKKTKLLEPSVGSLFGDDEDDDLF  888
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  NIIQAPQKEVGKGCDPDAHPKSTGVFQDEELLFSHKLQKDNDPDVDLFAGTKKTKLLEPSVGSLFGDDEDDDLF  888

Query  889  SSAKSQPLVQEKKRVVKKDHSVDSFKNQKHPESIQGSKEKGIWKPETPQDSSGLAPFKTKEPSTRIGKIQANLA  962
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Sbjct  889  SSAKSQPLVQEKKRVVKKDHSVNSFKNQKHPESIQGSKEKGIWKPETPQDSSGLAPFKTKEPSTRIGKIQANLA  962

Query  963  INPAALLPTAASQISEVKPVLPELAFPSSEHRRSYGLESVPVLPGSGEAGVSFDLPAQADTLHSANKSRVKMRG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  INPAALLPTAASQISEVKPVLPELAFPSSEHRRSHGLESVPVLPGSGEAGVSFDLPAQADTLHSANKSRVKMRG  1036

Query 1037  KRRPQTRAARRLAAQESSETEDMSVPRGPIAQWADGAISPNGHRPQLRAASGEDSTEEALAAAAAPWEGGPVPG  1110
            |||||||||||||||||||.|                                                     
Sbjct 1037  KRRPQTRAARRLAAQESSEAE-----------------------------------------------------  1057

Query 1111  VDRSPFAKSLGHSRGEADLFDSGDIFSTGTGSQSVERTKPKAKIAENPANPPVGGKAKSPMFPALGEASSDDDL  1184
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058  -----------------------DIFSTGTGSQSVERTKPKAKIAENPANPPVGGKAKSPMFPALGEASSDDDL  1108

Query 1185  FQSAKPKPAKKTNPFPLLEDEDDLFTDQKVKKNETKSNSQQDVILTTQDIFEDDIFATEAIKPSQKTREKEKTL  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  FQSAKPKPAKKTNPFPLLEDEDDLFTDQKVKKNETKSSSQQDVILTTQDIFEDDIFATEAIKPSQKTREKEKTL  1182

Query 1259  ESNLFDDNIDIFADLTVKPKEKSKKKVEAKSIFDDDMDDIFSSGIQAKTTKPKSRSAQAAPEPRFEHKVSNIFD  1332
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Sbjct 1183  ESNLFDDNIDIFADLTVKPKEKSKKKVEAKSIFDDDMDDIFSTGIQAKTTKPKSRSAQAAPEPRFEHKVSNIFD  1256

Query 1333  DPLNAFGGQ  1341
            |||||||||
Sbjct 1257  DPLNAFGGQ  1265