Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10086
• Subject: NM_001367405.1
• Aligned Length: 1341
• Identities: 1110
• Gaps: 214

Alignment

Query    1  MMNRTTPDQELAPASEPVWERPWSVEEIRRSSQSWSLAADAGLLQFLQEFSQQTISRTHEIKKQVDGLIRETKA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TDCRLHNVFNDFLMLSNTQFIENRVYDEEVEEPVLKAEAEKTEQEKTREQKEVDLIPKVQEAVNYGLQVLDSAF  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  EQLDIKAGNSDSEEDDANGRVELILEPKDLYIDRPLPYLIGSKLFMEQEDVGLGELSSEEGSVGSDRGSIVDTE  222
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------MEQEDVGLGELSSEEGSVGSDRGSIVDTE  29

Query  223  EEKEEEESDEDFAHHSDNEQNRHTTQMSDEEEDDDGCDLFADSEKEEEDIEDIEENTRPKRSRPTSFADELAAR  296
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   30  EEKEEEESDEDFAHHSDNEQNQHTTQMSDEEEDDDGCDLFADSEKEEEDIEDIEENTRPKRSRPTSFADELAAR  103

Query  297  IKGDAVGRVDEEPTTLPSGEAKPRKTLKEKKERRTPSDDEEDNLFAPPKLTDEDFSPFGSGGGLFSGGKGLFDD  370
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  104  IKGDAMGRVDEEPTTLPSGEAKPRKTLKEKKERRTPSDDEEDNLFAPPKLTDEDFSPFGSGGGLFSGGKGLFDD  177

Query  371  EDEESDLFTEAPQDRQAGASVKEESSSSKPGKKIPAGAVSVFLGDTDVFGAASVPSMKEPQKPEQPTPRKSPYG  444
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  178  EDEESDLFTEASQDRQAGASVKEESSSSKPGKKIPAGAVSVFLGDTDVFGAASVPSLKEPQKPEQPTPRKSPYG  251

Query  445  PPPTGLFDDDDGDDDDDFFSAPHSKPSKTGKVQSTADIFGDEEGDLFKEKAVASPEATVSQTDENKARAEKKVT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  252  PPPTGLFDDDDGDDDDDFFSAPHSKPSKTRKVQSTADIFGDEEGDLFKEKAVASPEATVSQTDENKARAEKKVT  325

Query  519  LSSSKNLKPSSETKTQKGLFSDEEDSEDLFSSQSASKLKGASLLPGKLPTLVSLFDDEDEEDNLFGGTAAKKQT  592
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  326  LSYSKNLKPSSETKTQKGLFSDEEDSEDLFSSQSASNLKGASLLPGKLPTSVSLFDDEDEEDNLFGGTAAKKQT  399

Query  593  LCLQAQREEKAKASELSKKKASALLFSSDEEDQWNIPASQTHLASDSRSKGEPRDSGTLQSQEAKAVKKTSLFE  666
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  400  LSLQAQREEKAKASELSKKKASALLFSSDEEDQWNIPASQTHLASDSRSKGEPRDSGTLQSQEAKAVKKTSLFE  473

Query  667  EDEEDDLFAIAKDSQKKTQRVSLLFEDDVDSGGSLFGSPPTSVPPATKKKETVSEAPPLLFSDEEEKEAQLGVK  740
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  474  EDKEDDLFAIAKDSQKKTQRVSLLFEDDVDSGGSLFGSPPTSVPPATKKKETVSEAPPLLFSDEEEKEAQLGVK  547

Query  741  SVDKKVESAKESLKFGRTDVAESEKEGLLTRSAQETVKHSDLFSSSSPWDKGTKPRTKTVLSLFDEEEDKMEDQ  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  548  SVDKKVESAKESLKFGRTDVAESEKEGLLTRSAQETVKHSDLFSSSSPWDKGTKPRTKTVLSLFDEEEDKMEDQ  621

Query  815  NIIQAPQKEVGKGRDPDAHPKSTGVFQDEELLFSHKLQKDNDPDVDLFAGTKKTKLLEPSVGSLFGDDEDDDLF  888
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  622  NIIQAPQKEVGKGCDPDAHPKSTGVFQDEELLFSHKLQKDNDPDVDLFAGTKKTKLLEPSVGSLFGDDEDDDLF  695

Query  889  SSAKSQPLVQEKKRVVKKDHSVDSFKNQKHPESIQGSKEKGIWKPETPQDSSGLAPFKTKEPSTRIGKIQANLA  962
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||                     |||||
Sbjct  696  SSAKSQPLVQEKKRVVKKDHSVNSFKNQKHPESIQGSKEKGIWKPETP---------------------QANLA  748

Query  963  INPAALLPTAASQISEVKPVLPELAFPSSEHRRSYGLESVPVLPGSGEAGVSFDLPAQADTLHSANKSRVKMRG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  749  INPAALLPTAASQISEVKPVLPELAFPSSEHRRSHGLESVPVLPGSGEAGVSFDLPAQADTLHSANKSRVKMRG  822

Query 1037  KRRPQTRAARRLAAQESSETEDMSVPRGPIAQWADGAISPNGHRPQLRAASGEDSTEEALAAAAAPWEGGPVPG  1110
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  823  KRRPQTRAARRLAAQESSEAEDMSVPRGPIAQWADGAISPNGHRPQLRAASGEDSTEEALAAAAAPWEGGPVPG  896

Query 1111  VDRSPFAKSLGHSRGEADLFDSGDIFSTGTGSQSVERTKPKAKIAENPANPPVGGKAKSPMFPALGEASSDDDL  1184
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897  VDTSPFAKSLGHSRGEADLFDSGDIFSTGTGSQSVERTKPKAKIAENPANPPVGGKAKSPMFPALGEASSDDDL  970

Query 1185  FQSAKPKPAKKTNPFPLLEDEDDLFTDQKVKKNETKSNSQQDVILTTQDIFEDDIFATEAIKPSQKTREKEKTL  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  971  FQSAKPKPAKKTNPFPLLEDEDDLFTDQKVKKNETKSSSQQDVILTTQDIFEDDIFATEAIKPSQKTREKEKTL  1044

Query 1259  ESNLFDDNIDIFADLTVKPKEKSKKKVEAKSIFDDDMDDIFSSGIQAKTTKPKSRSAQAAPEPRFEHKVSNIFD  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045  ESNLFDDNIDIFADLTVKPKEKSKKKVEAKSIFDDDMDDIFSTGIQAKTTKPKSRSAQAAPEPRFEHKVSNIFD  1118

Query 1333  DPLNAFGGQ  1341
            |||||||||
Sbjct 1119  DPLNAFGGQ  1127