Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10086
• Subject: NM_001367411.1
• Aligned Length: 1341
• Identities: 1237
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  MMNRTTPDQELAPASEPVWERPWSVEEIRRSSQSWSLAADAGLLQFLQEFSQQTISRTHEIKKQVDGLIRETKA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TDCRLHNVFNDFLMLSNTQFIENRVYDEEVEEPVLKAEAEKTEQEKTREQKEVDLIPKVQEAVNYGLQVLDSAF  148
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------MLSNTQFIENRVYDEEVEEPVLKAEAEKTEQEKTREQKEVDLIPKVQEAVNYGLQVLDSAF  61

Query  149  EQLDIKAGNSDSEEDDANGRVELILEPKDLYIDRPLPYLIGSKLFMEQEDVGLGELSSEEGSVGSDRGSIVDTE  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   62  EQLDIKAGNSDSEEDDANGRVELILEPKDLYIDRPLPYLIGSKLFMEQEDVGLGELSSEEGSVGSDRGSIVDTE  135

Query  223  EEKEEEESDEDFAHHSDNEQNRHTTQMSDEEEDDDGCDLFADSEKEEEDIEDIEENTRPKRSRPTSFADELAAR  296
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  136  EEKEEEESDEDFAHHSDNEQNQHTTQMSDEEEDDDGCDLFADSEKEEEDIEDIEENTRPKRSRPTSFADELAAR  209

Query  297  IKGDAVGRVDEEPTTLPSGEAKPRKTLKEKKERRTPSDDEEDNLFAPPKLTDEDFSPFGSGGGLFSGGKGLFDD  370
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  210  IKGDAMGRVDEEPTTLPSGEAKPRKTLKEKKERRTPSDDEEDNLFAPPKLTDEDFSPFGSGGGLFSGGKGLFDD  283

Query  371  EDEESDLFTEAPQDRQAGASVKEESSSSKPGKKIPAGAVSVFLGDTDVFGAASVPSMKEPQKPEQPTPRKSPYG  444
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  284  EDEESDLFTEASQDRQAGASVKEESSSSKPGKKIPAGAVSVFLGDTDVFGAASVPSLKEPQKPEQPTPRKSPYG  357

Query  445  PPPTGLFDDDDGDDDDDFFSAPHSKPSKTGKVQSTADIFGDEEGDLFKEKAVASPEATVSQTDENKARAEKKVT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358  PPPTGLFDDDDGDDDDDFFSAPHSKPSKTRKVQSTADIFGDEEGDLFKEKAVASPEATVSQTDENKARAEKKVT  431

Query  519  LSSSKNLKPSSETKTQKGLFSDEEDSEDLFSSQSASKLKGASLLPGKLPTLVSLFDDEDEEDNLFGGTAAKKQT  592
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  432  LSYSKNLKPSSETKTQKGLFSDEEDSEDLFSSQSASNLKGASLLPGKLPTSVSLFDDEDEEDNLFGGTAAKKQT  505

Query  593  LCLQAQREEKAKASELSKKKASALLFSSDEEDQWNIPASQTHLASDSRSKGEPRDSGTLQSQEAKAVKKTSLFE  666
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  LSLQAQREEKAKASELSKKKASALLFSSDEEDQWNIPASQTHLASDSRSKGEPRDSGTLQSQEAKAVKKTSLFE  579

Query  667  EDEEDDLFAIAKDSQKKTQRVSLLFEDDVDSGGSLFGSPPTSVPPATKKKETVSEAPPLLFSDEEEKEAQLGVK  740
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  EDKEDDLFAIAKDSQKKTQRVSLLFEDDVDSGGSLFGSPPTSVPPATKKKETVSEAPPLLFSDEEEKEAQLGVK  653

Query  741  SVDKKVESAKESLKFGRTDVAESEKEGLLTRSAQETVKHSDLFSSSSPWDKGTKPRTKTVLSLFDEEEDKMEDQ  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  SVDKKVESAKESLKFGRTDVAESEKEGLLTRSAQETVKHSDLFSSSSPWDKGTKPRTKTVLSLFDEEEDKMEDQ  727

Query  815  NIIQAPQKEVGKGRDPDAHPKSTGVFQDEELLFSHKLQKDNDPDVDLFAGTKKTKLLEPSVGSLFGDDEDDDLF  888
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  NIIQAPQKEVGKGCDPDAHPKSTGVFQDEELLFSHKLQKDNDPDVDLFAGTKKTKLLEPSVGSLFGDDEDDDLF  801

Query  889  SSAKSQPLVQEKKRVVKKDHSVDSFKNQKHPESIQGSKEKGIWKPETPQDSSGLAPFKTKEPSTRIGKIQANLA  962
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  SSAKSQPLVQEKKRVVKKDHSVNSFKNQKHPESIQGSKEKGIWKPETPQDSSGLAPFKTKEPSTRIGKIQANLA  875

Query  963  INPAALLPTAASQISEVKPVLPELAFPSSEHRRSYGLESVPVLPGSGEAGVSFDLPAQADTLHSANKSRVKMRG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  INPAALLPTAASQISEVKPVLPELAFPSSEHRRSHGLESVPVLPGSGEAGVSFDLPAQADTLHSANKSRVKMRG  949

Query 1037  KRRPQTRAARRLAAQESSETEDMSVPRGPIAQWADGAISPNGHRPQLRAASGEDSTEEALAAAAAPWEGGPVPG  1110
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  KRRPQTRAARRLAAQESSEAEDMSVPRGPIAQWADGAISPNGHRPQLRAASGEDSTEEALAAAAAPWEGGPVPG  1023

Query 1111  VDRSPFAKSLGHSRGEADLFDSGDIFSTGTGSQSVERTKPKAKIAENPANPPVGGKAKSPMFPALGEASSDDDL  1184
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  VDTSPFAKSLGHSRGEADLFDSGDIFSTGTGSQSVERTKPKAKIAENPANPPVGGKAKSPMFPALGEASSDDDL  1097

Query 1185  FQSAKPKPAKKTNPFPLLEDEDDLFTDQKVKKNETKSNSQQDVILTTQDIFEDDIFATEAIKPSQKTREKEKTL  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098  FQSAKPKPAKKTNPFPLLEDEDDLFTDQKVKKNETKSSSQQDVILTTQDIFEDDIFATEAIKPSQKTREKEKTL  1171

Query 1259  ESNLFDDNIDIFADLTVKPKEKSKKKVEAKSIFDDDMDDIFSSGIQAKTTKPKSRSAQAAPEPRFEHKVSNIFD  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172  ESNLFDDNIDIFADLTVKPKEKSKKKVEAKSIFDDDMDDIFSTGIQAKTTKPKSRSAQAAPEPRFEHKVSNIFD  1245

Query 1333  DPLNAFGGQ  1341
            |||||||||
Sbjct 1246  DPLNAFGGQ  1254