Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10086
• Subject: NM_001367413.1
• Aligned Length: 1341
• Identities: 1151
• Gaps: 173

Alignment

Query    1  MMNRTTPDQELAPASEPVWERPWSVEEIRRSSQSWSLAADAGLLQFLQEFSQQTISRTHEIKKQVDGLIRETKA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TDCRLHNVFNDFLMLSNTQFIENRVYDEEVEEPVLKAEAEKTEQEKTREQKEVDLIPKVQEAVNYGLQVLDSAF  148
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------MLSNTQFIENRVYDEEVEEPVLKAEAEKTEQEKTREQKEVDLIPKVQEAVNYGLQVLDSAF  61

Query  149  EQLDIKAGNSDSEEDDANGRVELILEPKDLYIDRPLPYLIGSKLFMEQEDVGLGELSSEEGSVGSDRGSIVDTE  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   62  EQLDIKAGNSDSEEDDANGRVELILEPKDLYIDRPLPYLIGSKLFMEQEDVGLGELSSEEGSVGSDRGSIVDTE  135

Query  223  EEKEEEESDEDFAHHSDNEQNRHTTQMSDEEEDDDGCDLFADSEKEEEDIEDIEENTRPKRSRPTSFADELAAR  296
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  136  EEKEEEESDEDFAHHSDNEQNQHTTQMSDEEEDDDGCDLFADSEKEEEDIEDIEENTRPKRSRPTSFADELAAR  209

Query  297  IKGDAVGRVDEEPTTLPSGEAKPRKTLKEKKERRTPSDDEEDNLFAPPKLTDEDFSPFGSGGGLFSGGKGLFDD  370
            |||||.||||||||                        .|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  210  IKGDAMGRVDEEPT------------------------NEEDNLFAPPKLTDEDFSPFGSGGGLFSGGKGLFDD  259

Query  371  EDEESDLFTEAPQDRQAGASVKEESSSSKPGKKIPAGAVSVFLGDTDVFGAASVPSMKEPQKPEQPTPRKSPYG  444
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  260  EDEESDLFTEASQDRQAGASVKEESSSSKPGKKIPAGAVSVFLGDTDVFGAASVPSLKEPQKPEQPTPRKSPYG  333

Query  445  PPPTGLFDDDDGDDDDDFFSAPHSKPSKTGKVQSTADIFGDEEGDLFKEKAVASPEATVSQTDENKARAEKKVT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  334  PPPTGLFDDDDGDDDDDFFSAPHSKPSKTRKVQSTADIFGDEEGDLFKEKAVASPEATVSQTDENKARAEKKVT  407

Query  519  LSSSKNLKPSSETKTQKGLFSDEEDSEDLFSSQSASKLKGASLLPGKLPTLVSLFDDEDEEDNLFGGTAAKKQT  592
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  408  LSYSKNLKPSSETKTQKGLFSDEEDSEDLFSSQSASNLKGASLLPGKLPTSVSLFDDEDEEDNLFGGTAAKKQT  481

Query  593  LCLQAQREEKAKASELSKKKASALLFSSDEEDQWNIPASQTHLASDSRSKGEPRDSGTLQSQEAKAVKKTSLFE  666
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  482  LSLQAQREEKAKASELSKKKASALLFSSDEEDQWNIPASQTHLASDSRSKGEPRDSGTLQSQEAKAVKKTSLFE  555

Query  667  EDEEDDLFAIAKDSQKKTQRVSLLFEDDVDSGGSLFGSPPTSVPPATKKKETVSEAPPLLFSDEEEKEAQLGVK  740
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  EDKEDDLFAIAKDSQKKTQRVSLLFEDDVDSGGSLFGSPPTSVPPATKKKETVSEAPPLLFSDEEEKEAQLGVK  629

Query  741  SVDKKVESAKESLKFGRTDVAESEKEGLLTRSAQETVKHSDLFSSSSPWDKGTKPRTKTVLSLFDEEEDKMEDQ  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  630  SVDKKVESAKESLKFGRTDVAESEKEGLLTRSAQETVKHSDLFSSSSPWDKGTKPRTKTVLSLFDEEEDKMEDQ  703

Query  815  NIIQAPQKEVGKGRDPDAHPKSTGVFQDEELLFSHKLQKDNDPDVDLFAGTKKTKLLEPSVGSLFGDDEDDDLF  888
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  704  NIIQAPQKEVGKGCDPDAHPKSTGVFQDEELLFSHKLQKDNDPDVDLFAGTKKTKLLEPSVGSLFGDDEDDDLF  777

Query  889  SSAKSQPLVQEKKRVVKKDHSVDSFKNQKHPESIQGSKEKGIWKPETPQDSSGLAPFKTKEPSTRIGKIQANLA  962
            ||||||||                                                              ||||
Sbjct  778  SSAKSQPL--------------------------------------------------------------ANLA  789

Query  963  INPAALLPTAASQISEVKPVLPELAFPSSEHRRSYGLESVPVLPGSGEAGVSFDLPAQADTLHSANKSRVKMRG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  790  INPAALLPTAASQISEVKPVLPELAFPSSEHRRSHGLESVPVLPGSGEAGVSFDLPAQADTLHSANKSRVKMRG  863

Query 1037  KRRPQTRAARRLAAQESSETEDMSVPRGPIAQWADGAISPNGHRPQLRAASGEDSTEEALAAAAAPWEGGPVPG  1110
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  864  KRRPQTRAARRLAAQESSEAEDMSVPRGPIAQWADGAISPNGHRPQLRAASGEDSTEEALAAAAAPWEGGPVPG  937

Query 1111  VDRSPFAKSLGHSRGEADLFDSGDIFSTGTGSQSVERTKPKAKIAENPANPPVGGKAKSPMFPALGEASSDDDL  1184
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  938  VDTSPFAKSLGHSRGEADLFDSGDIFSTGTGSQSVERTKPKAKIAENPANPPVGGKAKSPMFPALGEASSDDDL  1011

Query 1185  FQSAKPKPAKKTNPFPLLEDEDDLFTDQKVKKNETKSNSQQDVILTTQDIFEDDIFATEAIKPSQKTREKEKTL  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012  FQSAKPKPAKKTNPFPLLEDEDDLFTDQKVKKNETKSSSQQDVILTTQDIFEDDIFATEAIKPSQKTREKEKTL  1085

Query 1259  ESNLFDDNIDIFADLTVKPKEKSKKKVEAKSIFDDDMDDIFSSGIQAKTTKPKSRSAQAAPEPRFEHKVSNIFD  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1086  ESNLFDDNIDIFADLTVKPKEKSKKKVEAKSIFDDDMDDIFSTGIQAKTTKPKSRSAQAAPEPRFEHKVSNIFD  1159

Query 1333  DPLNAFGGQ  1341
            |||||||||
Sbjct 1160  DPLNAFGGQ  1168