Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10206
• Subject: NM_001008800.2
• Aligned Length: 1635
• Identities: 1518
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  ---ATGGGCCATCGTCCAGTGCTCGTGCTCAGCCAGAACACAAAGCGTGAATCCGGAAGAAAAGTTCAATCTGG  71
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGGGCCATCGTCCAGTGCTCGTGCTCAGCCAGAACACAAAGCGTGAATCCGGAAGAAAAGTTCAATCTGG  74

Query   72  AAACATCAATGCTGCCAAGACTATTGCAGATATCATCCGAACATGTTTGGGACCCAAGTCCATGATGAAGATGC  145
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct   75  AAACATCAATGCTGCCA---------------------------------------------------------  91

Query  146  TTTTGGACCCAATGGGAGGCATTGTGATGACCAATGATGGCAATGCCATTCTTCGAGAGATTCAAGTCCAGCAT  219
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct   92  ---------------------------------------------------------AGATTCAAGTCCAGCAT  108

Query  220  CCAGCGGCCAAGTCCATGATCGAAATTAGCCGGACCCAGGATGAAGAGGTTGGAGATGGGACCACATCAGTAAT  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  109  CCAGCGGCCAAGTCCATGATCGAAATTAGCCGGACCCAGGATGAAGAGGTTGGAGATGGGACCACATCAGTAAT  182

Query  294  TATTCTTGCAGGGGAAATGCTGTCTGTAGCTGAGCACTTCCTGGAGCAGCAGATGCACCCAACAGTGGTGATCA  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  183  TATTCTTGCAGGGGAAATGCTGTCTGTAGCTGAGCACTTCCTGGAGCAGCAGATGCACCCAACAGTGGTGATCA  256

Query  368  GTGCTTACCGCAAGGCATTGGATGATATGATCAGCACCCTAAAGAAAATAAGTATCCCAGTCGACATCAGTGAC  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  257  GTGCTTACCGCAAGGCATTGGATGATATGATCAGCACCCTAAAGAAAATAAGTATCCCAGTCGACATCAGTGAC  330

Query  442  AGTGATATGATGCTGAACATCATCAACAGCTCTATTACTACCAAAGCCATCAGTCGGTGGTCATCTTTGGCTTG  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  331  AGTGATATGATGCTGAACATCATCAACAGCTCTATTACTACCAAAGCCATCAGTCGGTGGTCATCTTTGGCTTG  404

Query  516  CAACATTGCCCTGGATGCTGTCAAGATGGTACAGTTTGAGGAGAATGGTCGGAAAGAGATTGACATAAAAAAAT  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  405  CAACATTGCCCTGGATGCTGTCAAGATGGTACAGTTTGAGGAGAATGGTCGGAAAGAGATTGACATAAAAAAAT  478

Query  590  ATGCAAGAGTGGAAAAGATACCTGGAGGCATCATTGAAGACTCCTGTGTCTTGCGTGGAGTCATGATTAACAAG  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  ATGCAAGAGTGGAAAAGATACCTGGAGGCATCATTGAAGACTCCTGTGTCTTGCGTGGAGTCATGATTAACAAG  552

Query  664  GATGTGACCCATCCACGTATGCGGCGCTATATCAAGAACCCTCGCATTGTGCTGCTGGATTCTTCTCTGGAATA  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  GATGTGACCCATCCACGTATGCGGCGCTATATCAAGAACCCTCGCATTGTGCTGCTGGATTCTTCTCTGGAATA  626

Query  738  CAAGAAAGGAGAAAGCCAGACTGACATTGAGATTACACGAGAGGAGGACTTCACCCGAATTCTCCAGATGGAGG  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  CAAGAAAGGAGAAAGCCAGACTGACATTGAGATTACACGAGAGGAGGACTTCACCCGAATTCTCCAGATGGAGG  700

Query  812  AAGAGTACATCCAGCAGCTCTGTGAGGACATTATCCAACTGAAGCCCGATGTGGTCATCACTGAAAAGGGCATC  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  AAGAGTACATCCAGCAGCTCTGTGAGGACATTATCCAACTGAAGCCCGATGTGGTCATCACTGAAAAGGGCATC  774

Query  886  TCAGATTTAGCTCAGCACTACCTTATGCGGGCCAATATCACAGCCATCCGCAGAGTCCGGAAGACAGACAATAA  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  TCAGATTTAGCTCAGCACTACCTTATGCGGGCCAATATCACAGCCATCCGCAGAGTCCGGAAGACAGACAATAA  848

Query  960  TCGCATTGCTAGAGCCTGTGGGGCCCGGATAGTCAGCCGACCAGAGGAACTGAGAGAAGATGATGTTGGAACAG  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  TCGCATTGCTAGAGCCTGTGGGGCCCGGATAGTCAGCCGACCAGAGGAACTGAGAGAAGATGATGTTGGAACAG  922

Query 1034  GAGCAGGCCTGTTGGAAATCAAGAAAATTGGAGATGAATACTTTACTTTCATCACTGACTGCAAAGACCCCAAG  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  923  GAGCAGGCCTGTTGGAAATCAAGAAAATTGGAGATGAATACTTTACTTTCATCACTGACTGCAAAGACCCCAAG  996

Query 1108  GCCTGCACCATTCTCCTCCGGGGGGCTAGCAAAGAGATTCTCTCGGAAGTAGAACGCAACCTCCAGGATGCCAT  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  GCCTGCACCATTCTCCTCCGGGGGGCTAGCAAAGAGATTCTCTCGGAAGTAGAACGCAACCTCCAGGATGCCAT  1070

Query 1182  GCAAGTGTGTCGCAATGTTCTCCTGGACCCTCAGCTGGTGCCAGGGGGTGGGGCCTCCGAGATGGCTGTGGCCC  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071  GCAAGTGTGTCGCAATGTTCTCCTGGACCCTCAGCTGGTGCCAGGGGGTGGGGCCTCCGAGATGGCTGTGGCCC  1144

Query 1256  ATGCCTTGACAGAAAAATCCAAGGCCATGACTGGTGTGGAACAATGGCCATACAGGGCTGTTGCCCAGGCCCTA  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145  ATGCCTTGACAGAAAAATCCAAGGCCATGACTGGTGTGGAACAATGGCCATACAGGGCTGTTGCCCAGGCCCTA  1218

Query 1330  GAGGTCATTCCTCGTACCCTGATCCAGAACTGTGGGGCCAGCACCATCCGTCTACTTACCTCCCTTCGGGCCAA  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1219  GAGGTCATTCCTCGTACCCTGATCCAGAACTGTGGGGCCAGCACCATCCGTCTACTTACCTCCCTTCGGGCCAA  1292

Query 1404  GCACACCCAGGAGAACTGTGAGACCTGGGGTGTAAATGGTGAGACGGGTACTTTGGTGGACATGAAGGAACTGG  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1293  GCACACCCAGGAGAACTGTGAGACCTGGGGTGTAAATGGTGAGACGGGTACTTTGGTGGACATGAAGGAACTGG  1366

Query 1478  GCATATGGGAGCCATTGGCTGTGAAGCTGCAGACTTATAAGACAGCAGTGGAGACGGCAGTTCTGCTACTGCGA  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1367  GCATATGGGAGCCATTGGCTGTGAAGCTGCAGACTTATAAGACAGCAGTGGAGACGGCAGTTCTGCTACTGCGA  1440

Query 1552  ATTGATGACATCGTTTCAGGCCACAAAAAGAAAGGCGATGACCAGAGCCGGCAAGGCGGGGCTCCTGATGCTGG  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441  ATTGATGACATCGTTTCAGGCCACAAAAAGAAAGGCGATGACCAGAGCCGGCAAGGCGGGGCTCCTGATGCTGG  1514

Query 1626  CCAGGAG  1632
            |||||||
Sbjct 1515  CCAGGAG  1521