Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10214
- Subject:
- XM_017015200.1
- Aligned Length:
- 1626
- Identities:
- 1035
- Gaps:
- 591
Alignment
Query 1 ATGTTTGGTGGCTATGAGACTATAGAAGCATACGAAGATGATCTTTATCGAGATGAGTCATCTAGTGAACTGAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGTTGATAGTGAGGTGGAATTTCAACTCTATAGCCAAATTCATTATGCCCAAGATCTTGATGATGTCATCAGGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGGAAGAGCATGAAGAAAAGAACTCTGGGAATTCGGAATCTTCGAGTAGTAAACCAAATCAGAAGAAGCTAATC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GTCCTTTCAGATAGTGAGGTCATCCAGCTGTCAGATGGGTCAGAGGTCATCACTTTGTCTGATGAAGACAGTAT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TTATAGATGTAAAGGAAAGAATGTTAGAGTTCAAGCACAAGAAAATGCCCATGGTCTTTCTTCTTCTCTTCAAT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CTAATGAGCTGGTTGATAAGAAATGCAAGAGTGATATTGAGAAGCCTAAATCTGAAGAGAGATCAGGTGTAATC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 CGAGAGGTCATGATTATAGAGGTCAGTTCAAGTGAAGAGGAAGAGAGCACCATTTCAGAAGGTGATAATGTGGA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AAGCTGGATGCTACTGGGATGTGAAGTAGATGATAAAGATGATGATATCCTTCTCAACCTTGTGGGATGTGAAA 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------ATGATAAAGATGATGATATCCTTCTCAACCTTGTGGGATGTGAAA 45
Query 593 ACTCTGTTACTGAAGGAGAAGATGGTATAAACTGGTCCATCAGTGACAAAGACATTGAGGCCCAGATAGCTAAT 666
||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 46 ACTCTGTTACTGA--------------------------------------------AGGCCCAGATAGCTAAT 75
Query 667 AACCGAACACCTGGAAGATGGACCCAGCGGTACTATTCAGCCAACAAAAACATTATCTGTAGAAATTGTGACAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 AACCGAACACCTGGAAGATGGACCCAGCGGTACTATTCAGCCAACAAAAACATTATCTGTAGAAATTGTGACAA 149
Query 741 ACGTGGTCATTTATCAAAAAACTGCCCCTTACCACGAAAAGTTCGTCGCTGCTTCCTGTGCTCCAGGAGAGGAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 150 ACGTGGTCATTTATCAAAAAACTGCCCCTTACCACGAAAAGTTCGTCGCTGCTTCCTGTGCTCCAGGAGAGGAC 223
Query 815 ATCTCCTGTATTCCTGTCCAGCCCCCCTTTGCGAATACTGTCCTGTGCCTAAGATGTTGGACCACTCATGTCTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 224 ATCTCCTGTATTCCTGTCCAGCCCCCCTTTGCGAATACTGTCCTGTGCCTAAGATGTTGGACCACTCATGTCTT 297
Query 889 TTCAGACATTCCTGGGATAAACAGTGTGACCGATGTCATATGCTAGGCCACTATACAGATGCTTGCACAGAAAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 TTCAGACATTCCTGGGATAAACAGTGTGACCGATGTCATATGCTAGGCCACTATACAGATGCTTGCACAGAAAT 371
Query 963 CTGGAGGCAGTATCACCTAACGACCAAACCTGGACCACCCAAAAAGCCGAAGACCCCTTCAAGACCATCAGCCT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 372 CTGGAGGCAGTATCACCTAACGACCAAACCTGGACCACCCAAAAAGCCGAAGACCCCTTCAAGACCATCAGCCT 445
Query 1037 TAGCATATTGCTATCACTGCGCGCAAAAAGGCCATTATGGACACGAATGTCCAGAAAGAGAAGTGTATGACCCG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 446 TAGCATATTGCTATCACTGCGCGCAAAAAGGCCATTATGGACACGAATGTCCAGAAAGAGAAGTGTATGACCCG 519
Query 1111 TCTCCAGTATCTCCATTCATCTGCTACTATGATGACAAATATGAAATTCAGGAGAGAGAAAAGAGACTAAAACA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 520 TCTCCAGTATCTCCATTCATCTGCTACTATGATGACAAATATGAAATTCAGGAGAGAGAAAAGAGACTAAAACA 593
Query 1185 AAAAATAAAAGTACTCAAGAAAAATGGGGTTATCCCAGAGCCATCCAAGCTACCTTATATAAAAGCAGCAAATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 594 AAAAATAAAAGTACTCAAGAAAAATGGGGTTATCCCAGAGCCATCCAAGCTACCTTATATAAAAGCAGCAAATG 667
Query 1259 AGAACCCCCACCATGATATAAGGAAGGGCCGTGCCTCATGGAAAAGCAACAGGTGGCCTCAAGAAAATAAAGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 668 AGAACCCCCACCATGATATAAGGAAGGGCCGTGCCTCATGGAAAAGCAACAGGTGGCCTCAAGAAAATAAAGAA 741
Query 1333 ACACAAAAAGAAATGAAGAACAAGAATAGAAACTGGGAGAAGCACAGGAAGGCTGACAGACATCGTGAAGTGGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 742 ACACAAAAAGAAATGAAGAACAAGAATAGAAACTGGGAGAAGCACAGGAAGGCTGACAGACATCGTGAAGTGGA 815
Query 1407 TGAGGATTTTCCCAGGGGCCCCAAAACCTACTCTTCTCCTGGCAGTTTTAAAACCCAGAAGCCTTCTAAGCCCT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 816 TGAGGATTTTCCCAGGGGCCCCAAAACCTACTCTTCTCCTGGCAGTTTTAAAACCCAGAAGCCTTCTAAGCCCT 889
Query 1481 TTCACCGTTCATCACATTACCACACGTCAAGAGAAGACAAGTCTCCCAAGGAAGGCAAGAGGGGCAAGCAGAAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 890 TTCACCGTTCATCACATTACCACACGTCAAGAGAAGACAAGTCTCCCAAGGAAGGCAAGAGGGGCAAGCAGAAG 963
Query 1555 AAAAAGGAGAGGTGCTGGGAAGATGATGACAATGATAACTTATTTCTTATTAAGCAGAGAAAAAAAAAGTCT 1626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 964 AAAAAGGAGAGGTGCTGGGAAGATGATGACAATGATAACTTATTTCTTATTAAGCAGAGAAAAAAAAAGTCT 1035