Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10427
• Subject: NM_001322216.1
• Aligned Length: 1214
• Identities: 944
• Gaps: 269

Alignment

Query    1  MAGALIGSEPGPAEELAKLEYLSLVSKVCTELDNHLGINDKDLAEFVISLAEKNTTFDTFKASLVKNGAEFTDS  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  LISNLLRLIQTMRPPAKPSTSKDPVVKPKTEKEKLKELFPVLCQPDNPSVRTMLDEDDVKVAVDVLKELEALMP  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  SAAGQEKQRDAEHRDRTKKKKRSRSRDRNRDRDRDRERNRDRDHKRRHRSRSRSRSRTRERNKVKSRYRSRSRS  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  QSPPKDRKDRDKYGERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEGLRKRWEGLVHISELRR  296
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------MQFGCFVQLEGLRKRWEGLVHISELRR  27

Query  297  EGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRRRNLVGETNEETSMRNPDRPTHLSLV  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   28  EGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRRRNLVGETNEETSMRNPDRPTHLSLV  101

Query  371  SAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVLSKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDEDLEIELVEEEPPFLR  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  102  SAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVLSKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDEDLEIELVEEEPPFLR  175

Query  445  GHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAAN  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  176  GHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAAN  249

Query  519  MRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGNKASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQI  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  250  MRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGNKASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQI  323

Query  593  TQYLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRECLI  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  324  TQYLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRECLI  397

Query  667  DPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEI  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  398  DPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEI  471

Query  741  LYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEM  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  472  LYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEM  545

Query  815  QTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  546  QTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRT  619

Query  889  GPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLYTLGALD  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  620  GPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLYTLGALD  693

Query  963  DEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDH  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  694  DEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDH  767

Query 1037  LTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIKARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAA  1110
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  768  LTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAA  841

Query 1111  KKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVSDPTKLS  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  842  KKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVSDPTKLS  915

Query 1185  KQKKQQRLEPLYNRYEEPNAWRISRAFRRR  1214
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  916  KQKKQQRLEPLYNRYEEPNAWRISRAFRRR  945