Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10427
- Subject:
- NM_001322217.1
- Aligned Length:
- 1214
- Identities:
- 1128
- Gaps:
- 85
Alignment
Query 1 MAGALIGSEPGPAEELAKLEYLSLVSKVCTELDNHLGINDKDLAEFVISLAEKNTTFDTFKASLVKNGAEFTDS 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 LISNLLRLIQTMRPPAKPSTSKDPVVKPKTEKEKLKELFPVLCQPDNPSVRTMLDEDDVKVAVDVLKELEALMP 148
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Sbjct 1 -----------MRPPAKPSTSKDPVVKPKTEKEKLKELFPVLCQPDNPSVRTMLDEDDVKVAVDVLKELEALMP 63
Query 149 SAAGQEKQRDAEHRDRTKKKKRSRSRDRNRDRDRDRERNRDRDHKRRHRSRSRSRSRTRERNKVKSRYRSRSRS 222
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Sbjct 64 SAAGQEKQRDAEHRDRTKKKKRSRSRDRNRDRDRDRERNRDRDHKRRHRSRSRSRSRTRERNKVKSRYRSRSRS 137
Query 223 QSPPKDRKDRDKYGERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEGLRKRWEGLVHISELRR 296
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Sbjct 138 QSPPKDRKDRDKYGERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEGLRKRWEGLVHISELRR 211
Query 297 EGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRRRNLVGETNEETSMRNPDRPTHLSLV 370
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Sbjct 212 EGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRRRNLVGETNEETSMRNPDRPTHLSLV 285
Query 371 SAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVLSKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDEDLEIELVEEEPPFLR 444
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Sbjct 286 SAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVLSKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDEDLEIELVEEEPPFLR 359
Query 445 GHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAAN 518
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Sbjct 360 GHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAAN 433
Query 519 MRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGNKASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQI 592
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Sbjct 434 MRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGNKASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQI 507
Query 593 TQYLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRECLI 666
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Sbjct 508 TQYLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRECLI 581
Query 667 DPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEI 740
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Sbjct 582 DPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEI 655
Query 741 LYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEM 814
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Sbjct 656 LYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEM 729
Query 815 QTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRT 888
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Sbjct 730 QTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRT 803
Query 889 GPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLYTLGALD 962
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Sbjct 804 GPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLYTLGALD 877
Query 963 DEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDH 1036
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Sbjct 878 DEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDH 951
Query 1037 LTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIKARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAA 1110
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Sbjct 952 LTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAA 1025
Query 1111 KKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVSDPTKLS 1184
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Sbjct 1026 KKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVSDPTKLS 1099
Query 1185 KQKKQQRLEPLYNRYEEPNAWRISRAFRRR 1214
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Sbjct 1100 KQKKQQRLEPLYNRYEEPNAWRISRAFRRR 1129