Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10427
• Subject: NM_001322221.1
• Aligned Length: 1220
• Identities: 1211
• Gaps: 8

Alignment

Query    1  ------MAGALIGSEPGPAEELAKLEYLSLVSKVCTELDNHLGINDKDLAEFVISLAEKNTTFDTFKASLVKNG  68
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MAVAVAMAGALIGSEPGPAEELAKLEYLSLVSKVCTELDNHLGINDKDLAEFVISLAEKNTTFDTFKASLVKNG  74

Query   69  AEFTDSLISNLLRLIQTMRPPAKPSTSKDPVVKPKTEKEKLKELFPVLCQPDNPSVRTMLDEDDVKVAVDVLKE  142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AEFTDSLISNLLRLIQTMRPPAKPSTSKDPVVKPKTEKEKLKELFPVLCQPDNPSVRTMLDEDDVKVAVDVLKE  148

Query  143  LEALMPSAAGQEKQRDAEHRDRTKKKKRSRSRDRNRDRDRDRERNRDRDHKRRHRSRSRSRSRTRERNKVKSRY  216
            |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  LEALMPSAAGQEKQRDAEH--RTKKKKRSRSRDRNRDRDRDRERNRDRDHKRRHRSRSRSRSRTRERNKVKSRY  220

Query  217  RSRSRSQSPPKDRKDRDKYGERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEGLRKRWEGLVH  290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  RSRSRSQSPPKDRKDRDKYGERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEGLRKRWEGLVH  294

Query  291  ISELRREGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRRRNLVGETNEETSMRNPDRP  364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  ISELRREGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRRRNLVGETNEETSMRNPDRP  368

Query  365  THLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVLSKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDEDLEIELVEE  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  THLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVLSKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDEDLEIELVEE  442

Query  439  EPPFLRGHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEG  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  EPPFLRGHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEG  516

Query  513  RQIAANMRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGNKASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGS  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  RQIAANMRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGNKASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGS  590

Query  587  GKTTQITQYLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGML  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  GKTTQITQYLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGML  664

Query  661  LRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGR  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  LRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGR  738

Query  735  TYPVEILYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYS  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  TYPVEILYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYS  812

Query  809  ALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRA  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  ALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRA  886

Query  883  GRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLY  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  GRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLY  960

Query  957  TLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFH  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  TLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFH  1034

Query 1031  QTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIKARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSG  1104
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  QTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSG  1108

Query 1105  FFRNAAKKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVS  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  FFRNAAKKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVS  1182

Query 1179  DPTKLSKQKKQQRLEPLYNRYEEPNAWRISRAFRRR  1214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  DPTKLSKQKKQQRLEPLYNRYEEPNAWRISRAFRRR  1218