Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10429
• Subject: NM_002022.3
• Aligned Length: 1674
• Identities: 1672
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGGCCAAGAAAGTTGCAGTGATTGGAGCTGGTGTGAGTGGCCTCTCCTCCATCAAATGCTGTGTGGATGAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAAGAAAGTTGCAGTGATTGGAGCTGGTGTGAGTGGCCTCTCCTCCATCAAATGCTGTGTGGATGAGGA  74

Query   75  CCTGGAGCCCACCTGCTTTGAGAGAAGTGATGACATTGGGGGATTATGGAAGTTTACTGAATCTTCCAAAGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGGAGCCCACCTGCTTTGAGAGAAGTGATGACATTGGGGGATTATGGAAGTTTACTGAATCTTCCAAAGATG  148

Query  149  GGATGACCAGGGTCTATAAGTCATTAGTGACAAATGTCTGTAAGGAAATGTCATGTTACAGTGACTTCCCTTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGATGACCAGGGTCTATAAGTCATTAGTGACAAATGTCTGTAAGGAAATGTCATGTTACAGTGACTTCCCTTTC  222

Query  223  CACGAAGATTATCCTAATTTCATGAACCATGAAAAATTTTGGGACTATCTCCAAGAATTTGCTGAGCACTTTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACGAAGATTATCCTAATTTCATGAACCATGAAAAATTTTGGGACTATCTCCAAGAATTTGCTGAGCACTTTGA  296

Query  297  CCTCCTGAAATACATTCAGTTTAAGACCACTGTGTGCAGCATAACGAAGCGTCCAGACTTCTCCGAAACTGGTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTCCTGAAATACATTCAGTTTAAGACCACTGTGTGCAGCATAACGAAGCGTCCAGACTTCTCCGAAACTGGTC  370

Query  371  AGTGGGATGTTGTCACAGAGACAGAGGGCAAGCAAAATAGAGCTGTCTTTGATGCTGTTATGGTTTGCACTGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTGGGATGTTGTCACAGAGACAGAGGGCAAGCAAAATAGAGCTGTCTTTGATGCTGTTATGGTTTGCACTGGA  444

Query  445  CATTTCCTGAATCCCCATTTACCTTTGGAAGCCTTTCCTGGAATTCATAAGTTTAAAGGTCAGATCCTGCATAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATTTCCTGAATCCCCATTTACCTTTGGAAGCCTTTCCTGGAATTCATAAGTTTAAAGGTCAGATCCTGCATAG  518

Query  519  TCAAGAGTACAAGATCCCAGAAGGCTTTCAGGGCAAACGCGTCTTGGTGATTGGTCTTGGGAACACTGGAGGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAAGAGTACAAGATCCCAGAAGGCTTTCAGGGCAAACGCGTCTTGGTGATTGGTCTTGGGAACACTGGAGGAG  592

Query  593  ACATTGCTGTGGAACTCAGTCGAACGGCAGCTCAGGTACTTCTCAGTACTAGAACTGGTACCTGGGTTCTTGGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACATTGCTGTGGAACTCAGTCGAACGGCAGCTCAGGTACTTCTCAGTACTAGAACTGGTACCTGGGTTCTTGGG  666

Query  667  CGCTCTTCAGATTGGGGCTATCCTTATAATATGATGGTTACAAGAAGATGCTGTAGTTTTATTGCACAAGTTCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCTCTTCAGATTGGGGCTATCCTTATAATATGATGGTTACAAGAAGATGCTGTAGTTTTATTGCACAAGTTCT  740

Query  741  GCCTTCACGTTTTCTAAACTGGATTCAAGAAAGGAAGTTGAATAAGAGATTTAATCATGAGGATTATGGATTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCTTCACGTTTTCTAAACTGGATTCAAGAAAGGAAGTTGAATAAGAGATTTAATCATGAGGATTATGGATTAA  814

Query  815  GTATTACCAAAGGGAAAAAAGCAAAATTCATTGTGAATGATGAGCTGCCAAACTGTATCCTCTGTGGGGCAATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTATTACCAAAGGGAAAAAAGCAAAATTCATTGTGAATGATGAGCTGCCAAACTGTATCCTCTGTGGGGCAATC  888

Query  889  ACTATGAAAACCAGCGTGATTGAATTTACAGAAACCTCTGCTGTCTTTGAAGATGGGACAGTGGAAGAAAACAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTATGAAAACCAGCGTGATTGAATTTACAGAAACCTCTGCTGTCTTTGAAGATGGGACAGTGGAAGAAAACAT  962

Query  963  TGATGTTGTGATCTTCACTACAGGATATACATTTTCTTTTCCATTTTTTGAAGAACCTCTTAAAAGCCTCTGTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGATGTTGTGATCTTCACTACAGGATATACATTTTCTTTTCCATTTTTTGAAGAACCTCTTAAAAGCCTCTGTA  1036

Query 1037  CAAAGAAGATATTTCTATACAAGCAAGTCTTTCCCTTAAACCTAGAGAGAGCGACATTAGCCATCATCGGCCTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAAAGAAGATATTTCTATACAAGCAAGTCTTTCCCTTAAACCTAGAGAGAGCGACATTAGCCATCATCGGCCTT  1110

Query 1111  ATCGGCCTTAAAGGATCCATCTTATCAGGCACAGAGCTCCAAGCACGATGGGTCACAAGAGTATTCAAAGGACT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCGGCCTTAAAGGATCCATCTTATCAGGCACAGAGCTCCAAGCACGATGGGTCACAAGAGTATTCAAAGGACT  1184

Query 1185  CTGTAAGATACCTCCATCCCAAAAATTGATGATGGAGGCTACTGAAAAGGAACAGCTCATTAAAAGGGGAGTGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTGTAAGATACCTCCATCCCAAAAATTGATGATGGAGGCTACTGAAAAGGAACAGCTCATTAAAAGGGGAGTGT  1258

Query 1259  TTAAAGACACCAGCAAAGACAAATTTGACTACATTGCCTACATGGATGATATCGCTGCCTGCATAGGCACAAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTAAAGACACCAGCAAAGACAAATTTGACTACATTGCCTACATGGATGATATCGCTGCCTGCATAGGCACAAAG  1332

Query 1333  CCCAGCATCCCACTTCTGTTCCTCAAGGATCCCAGACTAGCTTGGGAAGTTTTCTTTGGACCATGTACTCCTTA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCAGCATCCCACTTCTGTTCCTCAAGGATCCCAGACTAGCTTGGGAAGTTTTCTTTGGACCATGTACTCCTTA  1406

Query 1407  TCAGTACCGCCTCATGGGCCCTGGAAAATGGGATGGAGCCAGAAATGCCATCCTGACCCAGTGGGACAGAACAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCAGTACCGCCTCATGGGCCCTGGAAAATGGGATGGAGCCAGAAATGCCATCCTGACCCAGTGGGACAGAACAT  1480

Query 1481  TGAAACCTTTAAAAACTCGAATTGTCCCTGATTCCTCCAAGCCTGCCTCCATGTCACATTATTTAAAAGCCTGG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGAAACCTTTAAAAACTCGAATTGTCCCTGATTCCTCCAAGCCTGCCTCCATGTCACATTATTTAAAAGCCTGG  1554

Query 1555  GGGGCACCTGTCCTACTTGCCTCTCTTCTACTTATCTGTAAATCTTCACTTTTCTTGAAATTGGTGAGAGATAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGGGCACCTGTCCTACTTGCCTCTCTTCTACTTATCTGTAAATCTTCACTTTTCTTGAAATTGGTGAGAGATAA  1628

Query 1629  ACTACAGGACAGAATGTCCCCTTACCTAGTAAGTCTTTG--GAGGA  1672
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
Sbjct 1629  ACTACAGGACAGAATGTCCCCTTACCTAGTAAGTCTTTGGCGAGGA  1674