Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10548
• Subject: NM_023729.3
• Aligned Length: 1426
• Identities: 1021
• Gaps: 248

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGAGCGCGCTGCGAGGCCTGCCAGTGGCTGGCGGAGGCGAGAGTAGCGAGAGCGAGGATGATGGCTG  74
            |||||.|||.||.|.|||.|.|||.||.||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCAGCGGGCACACTGAGGGGCTTGGCAGTGGCTGGTGGAGGCGAGAGCAGCGATAGTGAGGATGACGGCTG  74

Query   75  GGAGATTGGGTATCTCGACCGGACGTCTCAGAAATTGAAAAGG-CTATTACCCATTGAAGAAAAGAAAGAAAAA  147
            |||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||| || ||||||.|||||||.|||||.||.|.|
Sbjct   75  GGATATTGGGTATCTCGACCGGTCCTCTCAGAAATTAAAAAGGTCT-TTACCCGTTGAAGAGAAGAACGAGACA  147

Query  148  TTTAAGAAAGCAATGACCATCGGAGATGTTTCATTGGTCCAGGAGCTCCTAGATTCTGGCATTAGTGTAGATTC  221
            ||||||||||||.||||||.|||||||.||||.||.||..|.||.|||||.|||||||||||||.|||.||.||
Sbjct  148  TTTAAGAAAGCACTGACCACCGGAGATATTTCTTTAGTTAAAGAACTCCTGGATTCTGGCATTAATGTGGACTC  221

Query  222  CAACTTTCAGTATGGATGGACTCCCCTTATGTATGCTGCTAGTGTTGCCAATGCAGAGCTGGTTCGGGTCCTTT  295
            ||.|||.|..|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct  222  CAGCTTCCGCTATGGATGGACCCCTCTTATGTATGCCGCTAGTGTGGCCAATGCAGAGCTGGTTCGCTTCCTTT  295

Query  296  TGGACAGAGGTGCTAATGCAAGCTTTGAGAAGGATAAGCAAAGTATTTTGATAACTGCATGTTCTGCTCATGGC  369
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||..||..||||||||||.|||.||||||||||.||||
Sbjct  296  TGGACAGAGGTGCTAATGCCAGCTTTGATAAGGACAAGTTAACCATTTTGATAAGTGCTTGTTCTGCTCGTGGC  369

Query  370  TCAGAGGAACAGATCTTGAAGTGTGTAGAACTACTACTTTCAAGAAATGCTGATCCAAATGTTGCTTGTAGGAG  443
            ||||||||.||..|||||||.||||||||..|||||||||||||||||||.||.||||||..||||||||||||
Sbjct  370  TCAGAGGAGCAAGTCTTGAAATGTGTAGAGTTACTACTTTCAAGAAATGCGGACCCAAATACTGCTTGTAGGAG  443

Query  444  ACTTATGACCCCAATCATGTATGCTGCTCGAGATGGTCACACCCAGGTTGTTGCTCTCCTTGTTGCTCATGGAG  517
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||
Sbjct  444  ACTTATGACGCCAATCATGTATGCTGCCCGAGACGGTCATACTCAGGTTGTGGCTCTGCTTGTGGCTCACGGAG  517

Query  518  CAGAAGTTAATACCCAGGATGAGAATGGTTACACTGCTTTAACGTGGGCAGCACGTCAGGGTCATAAAAATATA  591
            |.||||||||..|||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct  518  CCGAAGTTAACGCCCAGGATGAGAATGGTTATACTGCCTTAACATGGGCAGCACGGCAGGGTCATAAAAATGTA  591

Query  592  GTTTTGAAGTTGCTTGAACTTGGAGCTAATAAAATGCTACAAACCAAAGATGGAAAGATGCCAAGTGAGATTGC  665
            .||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|..|..|||||.||||||||
Sbjct  592  ATTCTGAAGTTGCTTGAACTGGGAGCTAATAAAATGCTACAGACCAAAGATGGCAGAACACCAAGCGAGATTGC  665

Query  666  AAAAAGAAACAAACATCATGAGATCTTCAACTTACTTTCTTTTACTTTAAATCCATTGGAAGGAAAACTTCAAC  739
            |||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  666  AAAAAGAAATAAACATCTTGAGATCTTCAACTTTCTTTCTCTGACTCTAAATCCATTGGAAGGAAAACTTCAGC  739

Query  740  AGCTAACTAAAGAAGACACTATTTGTAAAATATTGACAACAGATTCTGATAGAGAAAAAGATCACATTTTTAGT  813
            |||||||.||||||||.||.|||||||||.|.|||.|.|||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.
Sbjct  740  AGCTAACCAAAGAAGAGACCATTTGTAAACTGTTGGCCACAGATTCTGATAAAGAAAAAGATCACATATTTAGC  813

Query  814  TCATATACAGCATTTGGAGATCTGGAAGTATTTTTACATGGTCTTGGACTTGAACATATGACAGATTTACTAAA  887
            .|.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|.||||
Sbjct  814  CCGTATACAGCGTTTGGAGATCTGGAAATATTTTTACATGGCCTTGGACTTGAACATATGACAGACTCATTAAA  887

Query  888  GGAAAGGGATATAACGTTAAGACATCTTTTGACCATGAGGGAAGATGAATTTACAAAGAATGGAATTACCAGTA  961
            |||||.|||||||||.||||||||.|||.|||||||||.|.||||.||..|||||||||||||||||.|.||||
Sbjct  888  GGAAAAGGATATAACTTTAAGACACCTTCTGACCATGAAGAAAGACGAGCTTACAAAGAATGGAATTGCTAGTA  961

Query  962  AAGACCAGCAGAAAATTCTGGCTGCTCTTAAAGAACTACAGGTAGAAGAGATACAATTTGGAGAGCTATCTGAA  1035
            ||||.||.||||||||..|||||||||||||.||||||.|.||||||||||||.|.||||||.|..||.|||||
Sbjct  962  AAGATCAACAGAAAATCTTGGCTGCTCTTAAGGAACTAGAAGTAGAAGAGATAAATTTTGGAAAATTACCTGAA  1035

Query 1036  GAGACAAAGTTGGAAATCAGTGGTGATGAGTTCCTCAACTTTCTTCTCAAATTAAATAAACAGTGTGGCCATTT  1109
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1036  GTGACAAAGTTGGAAATCAGTGGTGATGAGTTCCTCAACTTTCTTTTGAAATTAAATAAGCAGTGTGGCCATTT  1109

Query 1110  AATAACAGCTGTACAGAATGTTATTACTGAGTTACCTGTAAATTCTCAAAAGGTA--------------TTCT-  1168
            |||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||.|||.||              |||| 
Sbjct 1110  AATCACAGCTGTGCAGAATATCATTACCGAGTTGCCTGTAAATTCTCACAAGATAGTACTGGAGTGGGCTTCTC  1183

Query 1169  ACAAAAGTTAT---------------------------------------------------------------  1179
            .||.||.||.|                                                               
Sbjct 1184  CCAGAAATTTTACTTCAGTTTGTGAAGAACTGGTTAGTAATGTTGAAGATTTGAATGAAGAGGTCTGCAGACTG  1257

Query 1180  --------------------------------------------------------------------------  1179
                                                                                      
Sbjct 1258  AAGGAGTTGATTCAGAAGATGCAGAATGAGCGGGAAAATGACCCAACTCATATCCCACTAGTAGAAGAGGTCTC  1331

Query 1180  --------------------------------------------------------------------------  1179
                                                                                      
Sbjct 1332  TACATGGAAGACTCGAATTCTGAAGAGGTCAGCAGTTACAGTGTGTGGATTCGGGCTGCTGCTTTTCATCGGCA  1405

Query 1180  --------------------  1179
                                
Sbjct 1406  AGCTAACTTTGCAGAGAAAA  1425