Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10634
• Subject: NM_001347144.1
• Aligned Length: 1200
• Identities: 980
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ATGCTGGCCCGGAGGAAGCCGATGCTGCCGGCGCTCACCATCAACCCTACCATCGCCGAGGGCCCGTCCCCAAC  74
            |||||||||||||||||||||.||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGCTGGCCCGGAGGAAGCCGGTGTTACCGGCACTCACTATCAACCCTACCATCGCCGAGGGCCCGTCCCCCAC  74

Query   75  CAGCGAGGGCGCCTCCGAGGCAAACCTGGTGGACCTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTGGAACTTGACGAGCAGC  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||
Sbjct   75  CAGCGAGGGCGCCTCTGAGGCAAACCTGGTGGACCTCCAGAAGAAGCTGGAAGAGCTGGACCTGGATGAGCAGC  148

Query  149  A---GAAGCGGCTGGAAGCCTTTCTCACCCAGAAAGCCAAGGTCGGCGAACTCAAAGACGATGACTTCGAAAGG  219
            |   ||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct  149  AAAGGAAGCGGCTGGAGGCCTTCCTTACCCAGAAGGCTAAGGTCGGTGAGCTCAAGGACGACGACTTTGAGAGG  222

Query  220  ACCTCAGAGCTGGACGCGGGCAACGGCGGGGTGGTCACCAAAGTCCAGCACAGACCCTCGGGCCTCATCATGGC  293
            |.|||||||||||..||.|||||.|||||.|||||||||||.|.||.|||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  223  ATCTCAGAGCTGGGTGCCGGCAATGGCGGAGTGGTCACCAAGGCCCGGCATAGGCCGTCAGGCCTCATCATGGC  296

Query  294  CAGGAAGCTGATCCACCTTGAGATCAAGCCGGCCATCCGGAACCAGATCATCCGCGAGCACCAGGTCCTGCACG  367
            |||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|.||.||||||||||||||.||||..|||||.|||||||
Sbjct  297  CAGAAAGCTGATCCACCTGGAGATCAAACCGGCCGTGCGCAACCAGATCATCCGGGAGCTGCAGGTGCTGCACG  370

Query  368  AGTGCAACTCACCGTACATCGTGGGCTTCTACGGGGCCTTCTACTGTGACAGGGAGATCAGCATCTGCATGGAG  441
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTGCAACTCGCCCTACATCGTGGGCTTCTATGGGGCCTTCTACAGCGACGGCGAGATCAGCATCTGCATGGAG  444

Query  442  CACATGGATGGCGGCTCCCTGGACCAGGGGCTGAAAGAGGCCAAGAGGATTCCCGAGGACATCCTGGGGAAAGT  515
            |||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|||||||||.|||||||.||.||||||.|||||||.||
Sbjct  445  CACATGGATGGTGGCTCACTGGACCAGGTACTGAAGGAGGCCAAGCGGATTCCTGAAGACATCTTGGGGAAGGT  518

Query  516  CAGCATTGCGGTTCTCCGGGGCTTGGCGTACCTCCGAGAGAAGCACCAGATCATGCACCGAAATGTGAAGCCCT  589
            ||||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  519  CAGCATTGCGGTGCTCCGGGGCCTGGCCTACCTCCGAGAGAAGCACCAGATCATGCACAGAGATGTGAAGCCCT  592

Query  590  CCAACATCCTCGTGAACTCTAGAGGGGAGATCAAGCTGTGTGACTTCGGGGTGAGCGGCCAGCTCATCGACTCC  663
            ||||||||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  593  CCAACATCCTGGTGAACTCTCGCGGGGAGATTAAGCTGTGTGACTTCGGGGTGAGCGGCCAGCTGATCGACTCC  666

Query  664  ATGGCCAACTCCTTCATGGGCACGCGCTCCTACATGGCTCCGGAGCGGTTGCAGGGCACACATTACTCGGTGCA  737
            |||||||||||.||..|.||.|||||||||||||||.|.||.||||||.||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  667  ATGGCCAACTCGTTTGTAGGGACGCGCTCCTACATGTCCCCAGAGCGGCTGCAGGGCACCCACTACTCTGTGCA  740

Query  738  GTCGGTCATCTGGAGCATGGACCTGTCCCTGGTGGAGCTGGCCATCGAAAGGTACCCCATCCCCCCGCCCGACG  811
            |||||.||||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||||..|||||.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct  741  GTCGGACATCTGGAGCATGGGGCTGTCGCTGGTGGAGCTGGCCATCGGGAGGTATCCCATTCCCCCACCTGATG  814

Query  812  CCAAGGAGCTGGAGGCCATCTTTGGCCAGCCCGTGGTCGACAGGGAAGAAGGAGAGCCTCACAGCATCTCCTCT  885
            |||||||.||.|||||||.||||||||.|||.|||||.|||.|||.|||.|||||.||.||.||..|||||.|.
Sbjct  815  CCAAGGAACTAGAGGCCAGCTTTGGCCGGCCTGTGGTGGACGGGGCAGACGGAGAACCCCATAGTGTCTCCCCG  888

Query  886  TGGCCAGGGTCCCCCGGGCGCCCCAACAGCGGTTACGGGATGGACAGCCTGCCCGCCATGGCCATCTTCGAACT  959
            .||||..||.||||.||.|||||||.|||.|||.|.|||||||||||||..||.||||||||||||||.||.||
Sbjct  889  AGGCCCAGGCCCCCTGGACGCCCCATCAGTGGTCATGGGATGGACAGCCGACCGGCCATGGCCATCTTTGAGCT  962

Query  960  GCTGGACTATATTGTGAAAGAGCCGCCTCCTAAGCTGCCCAACGGTGTGTTCACCCCCGACTTCCAGGAGTTTG  1033
            |||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||..||||||||||.|.|.||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGGACTACATAGTGAACGAGCCACCTCCCAAGCTGCCCAGTGGTGTGTTCAGCTCAGACTTCCAGGAGTTTG  1036

Query 1034  TCAATAAATGCCTCATCAAAAACCCAACGGAGCGGGCGGACCTAAAGATGCTCACAAACCACGCCTTCATCAAG  1107
            |.||||||||.|||||.||.||||||.|.|||||.||.||.||.|||.||||.|..||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGAATAAATGTCTCATTAAGAACCCAGCAGAGCGAGCAGATCTGAAGCTGCTGATGAACCACGCCTTCATCAAG  1110

Query 1108  CGGTCCGAGGTGAAAGAAGCGGATTTTGCCTGC-----------------------------------------  1140
            ||.||.||||.|.|.||||.|||.||.|||.||                                         
Sbjct 1111  CGCTCTGAGGGGGAGGAAGTGGACTTCGCCGGCTGGCTGTGCAGAACCCTGCGGCTGAAGCAGCCCAGCACACC  1184

Query 1141  ----------------  1140
                            
Sbjct 1185  CACGCGGACTGCAGTG  1200