Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_10801
Subject:
NM_001166005.1
Aligned Length:
864
Identities:
622
Gaps:
242

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MTTEKSLVTEAENSQHQQKEEGEEAINSGQQEPQQEESCQTAAEGDNWCEQKLKASNGDTPTHEDLTKNKERTS  74

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct  75  ESRGLSRLFSSFLKRPKSQVSEEEGKEVESDKEKGEGGQKEIEFGTSLDEEIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLH  148

Query   1  -------------------------------------------------------------MHCKVSLLDDTVY  13
                                                                        |||||||||||||
Sbjct 149  SLSSAETQPAQEELREDPDFEIKEGEGLEECSKIEVKEESPQSKAETELKASQKPIRKHRNMHCKVSLLDDTVY  222

Query  14  ECVVEKHAKGQDLLKRVCEHLNLLEEDYFGLAIWDNATSKTWLDSAKEIKKQVRGVPWNFTFNVKFYPPDPAQL  87
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ECVVEKHAKGQDLLKRVCEHLNLLEEDYFGLAIWDNATSKTWLDSAKEIKKQVRGVPWNFTFNVKFYPPDPAQL  296

Query  88  TEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDPELHGVDYVSDFKLAPNQTKELEEKVMEL  161
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TEDITRYYLCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDPELHGVDYVSDFKLAPNQTKELEEKVMEL  370

Query 162  HKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHKAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKR  235
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  HKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHKAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKR  444

Query 236  SSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTR  309
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  SSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTR  518

Query 310  QASALIDRPAPHFERTASKRASRSLDGAAAVDSADRSPRPTSAPAITQGQVAEGGVLDASAKKTVVPKAQKETV  383
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  QASALIDRPAPHFERTASKRASRSLDGAAAVDSADRSPRPTSAPAITQGQVAEGGVLDASAKKTVVPKAQKETV  592

Query 384  KAEVKKEDEPPEQAEPEPTEAW---------------------------------KKKRERLDGENIYIRHSNL  424
           ||||||||||||||||||||||                                 |||||||||||||||||||
Sbjct 593  KAEVKKEDEPPEQAEPEPTEAWKVEKTHIEVTVPTSNGDQTQKLAEKTEDLIRMRKKKRERLDGENIYIRHSNL  666

Query 425  MLEDLDKSQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLNINGQIPTGEGPPLVKTQTVTIS  498
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  MLEDLDKSQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLNINGQIPTGEGPPLVKTQTVTIS  740

Query 499  DNANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNSGDLDPGVLLTAQTITSETPSSTTTTQITKTVKGGISET  572
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  DNANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNSGDLDPGVLLTAQTITSETPSSTTTTQITKTVKGGISET  814

Query 573  RIEKRIVITGDADIDHDQVLVQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIADE  622
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  RIEKRIVITGDADIDHDQVLVQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIADE  864