Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10808
- Subject:
- XM_006497165.3
- Aligned Length:
- 1326
- Identities:
- 1216
- Gaps:
- 21
Alignment
Query 1 ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTC 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCCTCCAGCCCAGCCTC 74
Query 75 CCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGGTCTTCCGACGCCAGTGGGAGTTACAGTTCAACCATGA 148
Query 149 ATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTC 222
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 149 ATGGCCATCAGAACGGACTGGACTCGCCACCTCTCTACCCCTCTGCTCCGATCCTGGGAGGCAGCGGGCCTGTC 222
Query 223 AGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTC 296
.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 CGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATCGTAGAGGATCCCCAGACCAAGTGTGAATATATGCTCAACTC 296
Query 297 GATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAG 370
.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 CATGCCCAAGAGACTGTGCTTAGTGTGTGGCGACATCGCCTCTGGGTACCACTATGGGGTTGCATCATGTGAAG 370
Query 371 CCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAA 444
|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 371 CCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACGATTCAAGGTAACATAGAGTACAGCTGCCCAGCCACGAATGAATGTGAG 444
Query 445 ATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGA 518
|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATCACAAAGCGCAGACGCAAATCCTGCCAGGCCTGCCGCTTCATGAAGTGTCTCAAAGTGGGCATGCTGAAAGA 518
Query 519 AGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCAT 592
||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 519 AGGGGTCCGTCTTGACAGAGTGCGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGAATAGATGCTGAGAACAGCCCAT 592
Query 593 ACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCTCTGGTCTGATCCTGCAGATAACAAGATTGTC 666
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 593 ACCTGAACCCTCAGCTGGTGCAGCCAGCCAAAAAGCCAT---------------------ATAACAAGATTGTC 645
Query 667 TCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAA 740
||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 646 TCGCATTTGTTGGTGGCTGAACCAGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAA 719
Query 741 AGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAG 814
|||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 720 AGCCCTCACCACACTCTGTGACTTGGCTGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCAAAACATATTCCAG 793
Query 815 GCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGT 888
||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.||.
Sbjct 794 GCTTCTCCACACTGTCCCTGGCAGACCAGATGAGCCTCCTCCAGAGTGCATGGATGGAGATTCTGATCCTCGGC 867
Query 889 GTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTC 962
||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 868 GTTGTGTACCGATCGCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGATGAAGACCAGTC 941
Query 963 CAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGG 1036
.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 942 TAAATTAGCAGGCCTTCTTGACCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTGAAGAAGTACAAGAGCATGAAGCTAG 1015
Query 1037 AAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAA 1110
|.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1016 AGAAGGAAGAATTCGTCACCCTCAAAGCAATAGCTCTTGCTAATTCAGATTCCATGCATATAGAAGATGTGGAA 1089
Query 1111 GCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCC 1184
||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090 GCTGTGCAGAAACTTCAGGATGTGTTACATGAGGCCCTGCAGGATTACGAGGCTGGCCAGCACATGGAAGACCC 1163
Query 1185 TCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCT 1258
|||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1164 TCGCCGTGCAGGCAAGATGCTGATGACGCTGCCGCTGCTGAGGCAGACCTCCACCAAGGCAGTCCAGCACTTCT 1237
Query 1259 ACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC 1326
|||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1238 ACAACATCAAACTCGAAGGCAAAGTGCCCATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGCTGGAGGCCAAGGTC 1305