Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10808
• Subject: XM_011509266.3
• Aligned Length: 1431
• Identities: 1305
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGCTGGGGTGGTTCAAAGAACAGGAAAAAAAAAAGGCAACATGACTGGAGCCTAGTGAATGAAGGAGTGTC  74

Query    1  -------------------------------ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCT  43
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGACTTGAGGCTGGCAGGCTTCTCTGCAGAATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCT  148

Query   44  TCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCA  117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCA  222

Query  118  GACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTC  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTC  296

Query  192  TGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATC  265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATC  370

Query  266  CCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCT  339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCT  444

Query  340  GGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGA  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGA  518

Query  414  ATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCA  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCA  592

Query  488  TGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTAC  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTAC  666

Query  562  AAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCT  635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct  667  AAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCAT----  736

Query  636  CTGGTCTGATCCTGCAGATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGC  709
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  -----------------ATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGC  793

Query  710  CTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTG  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  CTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTG  867

Query  784  GTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCA  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  GTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCA  941

Query  858  GAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATG  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  GAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATG  1015

Query  932  CAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAG  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  CAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAG  1089

Query 1006  CTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAA  1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  CTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAA  1163

Query 1080  TTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGG  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164  TTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGG  1237

Query 1154  ATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGG  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238  ATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGG  1311

Query 1228  CAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTT  1301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312  CAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTT  1385

Query 1302  TTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC  1326
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386  TTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC  1410