Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10808
• Subject: XM_017000628.1
• Aligned Length: 1383
• Identities: 1326
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGTCAAACAAAGATCG  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAAACAGAAGGAGCAGCATCTGTGCATAGAGGAACGAAGCAGCTTCTCTGCAGAATGTCAAACAAAGATCG  74

Query   18  ACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCA  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCA  148

Query   92  ACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGA  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGA  222

Query  166  CTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGA  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGA  296

Query  240  CTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGT  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGT  370

Query  314  GTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTC  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTC  444

Query  388  AAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACG  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACG  518

Query  462  TAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACA  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACA  592

Query  536  GAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTG  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTG  666

Query  610  GTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCTCTGGTCTGATCCTGCAGATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGC  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCTCTGGTCTGATCCTGCAGATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGC  740

Query  684  TGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGT  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGT  814

Query  758  GTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCC  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCC  888

Query  832  CTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCT  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCT  962

Query  906  TTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTC  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTC  1036

Query  980  TTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTC  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTC  1110

Query 1054  ACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCA  1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCA  1184

Query 1128  GGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGA  1201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGA  1258

Query 1202  TGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAA  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAA  1332

Query 1276  GGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC  1326
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC  1383