Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10835
• Subject: XM_011535717.3
• Aligned Length: 1395
• Identities: 1098
• Gaps: 297

Alignment

Query    1  ATGCCTTATTTTACAAGACTCATTTTGTTCTTGTTTTGCTTGATGGTTCTCGTGGAGAGCAGAAAACCCAAGAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAAGCGATGGACAGGGCAGGTGGAAATGCCCAAGCCAAGTCACTTATATAAGAAGAACCTTGATGTGACCAAGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCCGGAAGGGAAAGCCTCAGCAGCTTCTCAGAGTGGACGAGCACGACTTCAGCATGAGACCCGCCTTCGGAGGC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCTGCCATCCCGGTGGGCGTGGACGTACAGGTGGAGAGCCTGGACAGCATCTCCGAGGTGGACATGGACTTCAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TATGACCCTGTACCTGCGGCATTACTGGAAGGATGAGAGGCTAGCTTTCTCCAGCGCCAGCAACAAGAGCATGA  370
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -ATGACCCTGTACCTGCGGCATTACTGGAAGGATGAGAGGCTAGCTTTCTCCAGCGCCAGCAACAAGAGCATGA  73

Query  371  CCTTCGATGGCCGGCTGGTGAAGAAGATCTGGGTCCCTGATGTCTTCTTTGTTCACTCCAAAAGATCGTTCACT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  CCTTCGATGGCCGGCTGGTGAAGAAGATCTGGGTCCCTGATGTCTTCTTTGTTCACTCCAAAAGATCGTTCACT  147

Query  445  CATGACACCACCACTGACAACATCATGCTGAGGGTGTTCCCAGATGGACACGTGCTGTACAGCATGAGGATTAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  CATGACACCACCACTGACAACATCATGCTGAGGGTGTTCCCAGATGGACACGTGCTGTACAGCATGAGGATTAC  221

Query  519  GGTCACTGCCATGTGCAACATGGACTTCAGCCACTTTCCCCTGGACTCCCAGACCTGTTCTTTGGAGCTGGAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GGTCACTGCCATGTGCAACATGGACTTCAGCCACTTTCCCCTGGACTCCCAGACCTGTTCTTTGGAGCTGGAGA  295

Query  593  GCTATGCCTATACAGATGAAGATCTAATGCTGTACTGGAAGAATGGGGATGAATCCCTAAAAACAGATGAGAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  GCTATGCCTATACAGATGAAGATCTAATGCTGTACTGGAAGAATGGGGATGAATCCCTAAAAACAGATGAGAAG  369

Query  667  ATCTCCTTGTCTCAGTTTCTGATTCAGAAATTTCACACAACTTCCAGGCTGGCCTTCTACAGCAGCACTGGCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  ATCTCCTTGTCTCAGTTTCTGATTCAGAAATTTCACACAACTTCCAGGCTGGCCTTCTACAGCAGCACTGGCTG  443

Query  741  GTACAACCGTCTGTACATTAACTTCACGTTGCGTCGCCACATCTTCTTCTTCTTGCTCCAAACATATTTCCCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GTACAACCGTCTGTACATTAACTTCACGTTGCGTCGCCACATCTTCTTCTTCTTGCTCCAAACATATTTCCCTG  517

Query  815  CCACTCTGATGGTCATGCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATCGACCGCAGAGCTGTGCCTGCCAGAGTTTCACTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  CCACTCTGATGGTCATGCTGTCCTGGGTGTCCTTCTGGATCGACCGCAGAGCTGTGCCTGCCAGAGTTTCACTG  591

Query  889  GGTATCACGACGGTGCTGACCATGACCACCATCATCACGGGCGTGAATGCCTCCATGCCGCGCGTCTCCTACGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  GGTATCACGACGGTGCTGACCATGACCACCATCATCACGGGCGTGAATGCCTCCATGCCGCGCGTCTCCTACGT  665

Query  963  CAAGGCCGTGGACATCTACCTCTGGGTCAGCTTTGTGTTCGTGTTCCTCTCGGTGCTGGAGTATGCGGCTGTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  CAAGGCCGTGGACATCTACCTCTGGGTCAGCTTTGTGTTCGTGTTCCTCTCGGTGCTGGAGTATGCGGCTGTCA  739

Query 1037  ACTACCTGACCACCGTGCAGGAGCGCAAGGAACGGAAGCTGCGGGAGAAGTTCCCGTGCATGTGTGGAATGCTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  ACTACCTGACCACCGTGCAGGAGCGCAAGGAACGGAAGCTGCGGGAGAAGTTCCCGTGCATGTGTGGAATGCTT  813

Query 1111  CATTCAAAAACCATGATGCTGGATGGAAGCTACAGTGAGTCTGAGGCCAACAGCCTGGCTGGGTACCCCAGAAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CATTCAAAAACCATGATGCTGGATGGAAGCTACAGTGAGTCTGAGGCCAACAGCCTGGCTGGGTACCCCAGAAG  887

Query 1185  CCATATCCTGACAGAAGAAGAAAGGCAAGACAAAATAGTGGTCCACCTGGGCCTGAGTGGTGAAGCCAACGCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  CCATATCCTGACAGAAGAAGAAAGGCAAGACAAAATAGTGGTCCACCTGGGCCTGAGTGGTGAAGCCAACGCTG  961

Query 1259  CCAGAAAGAAGGGGCTTCTGAAGGGCCAGACGGGTTTTCGTATCTTCCAGAATACCCATGCCATTGACAAATAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  CCAGAAAGAAGGGGCTTCTGAAGGGCCAGACGGGTTTTCGTATCTTCCAGAATACCCATGCCATTGACAAATAC  1035

Query 1333  TCTAGGTTGATATTCCCTGCCTCCTACATATTTTTCAACTTAATTTATTGGTCAGTGTTTTCC  1395
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  TCTAGGTTGATATTCCCTGCCTCCTACATATTTTTCAACTTAATTTATTGGTCAGTGTTTTCC  1098