Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10876
• Subject: NM_001242758.1
• Aligned Length: 1106
• Identities: 981
• Gaps: 19

Alignment

Query    1  ATGCGGGTCATGGCGCCCCGAACCCTCATCCTGCTGCTCTCGGGAGCCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCTG  74
            |||...|||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||||||||..|
Sbjct    1  ATGGCCGTCATGGCGCCCCGAACCCTCCTCCTGCTACTCTCGGGGGCCCTGGCCCTGACCCAGACCTGGGCGGG  74

Query   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCTACACCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGAGAGCCCCGCTTCATCGCAGTGG  148
            |||||||||||||||||||||||.|||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCTTCACATCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCTTCATCGCCGTGG  148

Query  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCAAGAGG--GGAGCCGCGGGCGC  220
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |.|||.|  ||||||||||||||
Sbjct  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAG--CCAGAAGATGGAGCCGCGGGCGC  220

Query  221  CGTGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGGAGACACAGAAGTA-CAAGCGCCAGGCACAGACTGA  293
            |||||.|.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||| || .|||..|||..||||||||||
Sbjct  221  CGTGGATAGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCAGGAGACACGGAA-TATGAAGGCCCACTCACAGACTGA  293

Query  294  CCGAGTGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCGGGTCTCACACCCTCCAGTGGATGT  367
            |||||.||.||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||.|||||...||||
Sbjct  294  CCGAGCGAACCTGGGGACCCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGACGGTTCTCACACCATCCAGATAATGT  367

Query  368  ATGGCTGCGACCTGGGGCCCGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGTATGACCAGTCCGCCTACGACGGCAAGGATTAC  441
            |||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||....|||..||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  ATGGCTGCGACGTGGGGCCGGACGGGCGCTTCCTCCGCGGGTACCGGCAGGACGCCTACGACGGCAAGGATTAC  441

Query  442  ATCGCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACGGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTGGGA  515
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||.|||.||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  442  ATCGCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCTTGGACCGCGGCGGACATGGCAGCTCAGATCACCAAGCGCAAGTGGGA  515

Query  516  GGCGGCCCGTGCGGCGGAGCAGCAGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGG  589
            |||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||..|||||||||..||||||||||||||||||
Sbjct  516  GGCGGTCCATGCGGCGGAGCAGCGGAGAGTCTACCTGGAGGGCCGGTGCGTGGACGGGCTCCGCAGATACCTGG  589

Query  590  AGAACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCGGAACACCCAAAGACACACGTGACCCACCATCTCGTCTCTGACCAT  663
            ||||||||||||||||||||||||||.||||.|.|||.||||||||..||||||||||.|.|.|||||||||||
Sbjct  590  AGAACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCACGGACCCCCCCAAGACACATATGACCCACCACCCCATCTCTGACCAT  663

Query  664  GAGGCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGCGA  737
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  664  GAGGCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGGGA  737

Query  738  GGACCAAACTCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTG  811
            ||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  738  GGACCAGACCCAGGACACGGAGCTCGTGGAGACCAGGCCTGCAGGGGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCGGCTG  811

Query  812  TGGTGGTGCCTTCTGGAGAAGAGCAGAGATACACGTGCCATGTGCAGCACGAGGGGCTGCCGGAGCCCCTCACC  885
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||..|||||||||||
Sbjct  812  TGGTGGTGCCTTCTGGAGAGGAGCAGAGATACACCTGCCATGTGCAGCATGAGGGTCTGCCCAAGCCCCTCACC  885

Query  886  CTGAGATGGGAGCCATCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCGTGGGCATCGTTGCTGGCCTGGCTGTCC-TGGCTG  958
            |||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.||| |||   
Sbjct  886  CTGAGATGGGAGCTGTCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCGTGGGCATCATTGCTGGCCTGGTTCTCCTTGG---  956

Query  959  TCCTAGCTGT----CCTAGGAGCTGTGGTGGCTGTTGTTATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAGGTGGAAAAGGAGG  1028
                ||||||    .|| |||||||||||.||||..||.|||||.||||||||||||||||.|.||||||||||
Sbjct  957  ----AGCTGTGATCACT-GGAGCTGTGGTCGCTGCCGTGATGTGGAGGAGGAAGAGCTCAGATAGAAAAGGAGG  1025

Query 1029  GAGCTGCTCTCAGGCTGCGTCCAGCAACAGTGCCCAGGGCTCTGATGAGTCTCTCATCGCTTGTAAAGCC  1098
            |||.|.|.||||||||||...|||..|||||||||||||||||||||.||||||||..||||||||||..
Sbjct 1026  GAGTTACACTCAGGCTGCAAGCAGTGACAGTGCCCAGGGCTCTGATGTGTCTCTCACAGCTTGTAAAGTG  1095