Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10876
• Subject: NM_001363567.1
• Aligned Length: 1119
• Identities: 911
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ---------------ATGCGGGTCATGGCGCCCCGAACCCTCATCCTGCTGCTCTCGGGAGCCCTGGCCCTGAC  59
                           |||..||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct    1  ATGAAGACGCCAAGGATGGTGGTCATGGCGCCCCGAACCCTCTTCCTGCTGCTCTCGGGGGCCCTGACCCTGAC  74

Query   60  CGAGACCTGGGCCTGCTCCCACTCCATGAGGTATTTCTACACCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGAGAGCCCC  133
            ||||||||||||..|||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  CGAGACCTGGGCGGGCTCCCACTCCATGAGGTATTTCAGCGCCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCC  148

Query  134  GCTTCATCGCAGTGGGCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCAAGAGG-  206
            ||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||.||||  |||| 
Sbjct  149  GCTTCATCGCCATGGGCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACTCGGCGTGTCC--GAGGA  220

Query  207  -GGAGCCGCGGGCGCCGTGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGGAGACACAGAAGTACAAGCGC  279
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||||.|||...||||..|
Sbjct  221  TGGAGCCGCGGGCGCCGTGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGAAGAGGAGACACGGAACACCAAGGCC  294

Query  280  CAGGCACAGACTGACCGAGTGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCGGGTCTCACAC  353
            ||.||||||||||||.||.|||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct  295  CACGCACAGACTGACAGAATGAACCTGCAGACCCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCAGTTCTCACAC  368

Query  354  CCTCCAGTGGATGTATGGCTGCGACCTGGGGCCCGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGTATGACCAGTCCGCCTACG  427
            |||||||||||||..||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||||..|||||||
Sbjct  369  CCTCCAGTGGATGATTGGCTGCGACCTGGGGTCCGACGGACGCCTCCTCCGCGGGTATGAACAGTATGCCTACG  442

Query  428  ACGGCAAGGATTACATCGCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACGGCGGCTCAGATCACC  501
            |.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||
Sbjct  443  ATGGCAAGGATTACCTCGCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCAGCGGACACTGCGGCTCAGATCTCC  516

Query  502  CAGCGCAAGTGGGAGGCGGCCCGTGCGGCGGAGCAGCAGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCT  575
            .||||||||||.|||||||||..||.|||.||.||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  AAGCGCAAGTGTGAGGCGGCCAATGTGGCTGAACAAAGGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCT  590

Query  576  CCGCAGATACCTGGAGAACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCGGAACACCCAAAGACACACGTGACCCACCATC  649
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  591  CCACAGATACCTGGAGAACGGGAAGGAGATGCTGCAGCGCGCGGACCCCCCCAAGACACACGTGACCCACCACC  664

Query  650  TCGTCTCTGACCATGAGGCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGG  723
            ..||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  665  CTGTCTTTGACTATGAGGCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCATACTGACCTGG  738

Query  724  CAGCGGGATGGCGAGGACCAAACTCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGAACCTTCCA  797
            |||||||||||.||||||||.||.||||||...|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  739  CAGCGGGATGGGGAGGACCAGACCCAGGACGTGGAGCTCGTGGAGACCAGGCCTGCAGGGGATGGAACCTTCCA  812

Query  798  GAAGTGGGCAGCTGTGGTGGTGCCTTCTGGAGAAGAGCAGAGATACACGTGCCATGTGCAGCACGAGGGGCTGC  871
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  813  GAAGTGGGCAGCTGTGGTGGTGCCTTCTGGAGAGGAGCAGAGATACACGTGCCATGTGCAGCATGAGGGGCTGC  886

Query  872  CGGAGCCCCTCACCCTGAGATGGGAGCCATCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCGTGGGCATCGTTGCTGGCCTG  945
            ||||||||||||..|||||||||.|||..|||||||.||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct  887  CGGAGCCCCTCATGCTGAGATGGAAGCAGTCTTCCCTGCCCACCATCCCCATCATGGGTATCGTTGCTGGCCTG  960

Query  946  GCTGTCCTGGCTGTCCTAGCTGT----CCTAGGAGCTGTGGTGGCTGTTGTTATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAG  1015
            |.||||||.||      ||||||    .|| |||||||.|||.||||.|||..||||.||.|.|||||||||||
Sbjct  961  GTTGTCCTTGC------AGCTGTAGTCACT-GGAGCTGCGGTCGCTGCTGTGCTGTGGAGAAAGAAGAGCTCAG  1027

Query 1016  GTGGAAAAGGAGGGAGCTGCTCTCAGGCTGCGTCCAGCAACAGTGCCCAGGGCTCTGATGAGTCTCTCATCGCT  1089
            .|                                                                        
Sbjct 1028  AT------------------------------------------------------------------------  1029

Query 1090  TGTAAAGCC  1098
                     
Sbjct 1030  ---------  1029