Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_10876
Subject:
NM_002117.6
Aligned Length:
1098
Identities:
1061
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGCGGGTCATGGCGCCCCGAACCCTCATCCTGCTGCTCTCGGGAGCCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCTG  74
            |||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGGGTCATGGCGCCCCGAGCCCTCCTCCTGCTGCTCTCGGGAGGCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCTG  74

Query   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCTACACCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGAGAGCCCCGCTTCATCGCAGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCGACACCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGAGAGCCCCGCTTCATCTCAGTGG  148

Query  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCAAGAGGGGAGCCGCGGGCGCCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCGAGAGGGGAGCCGCGGGCGCCG  222

Query  223  TGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGGAGACACAGAAGTACAAGCGCCAGGCACAGACTGACCG  296
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Sbjct  223  TGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGGAGACACAGAAGTACAAGCGCCAGGCACAGGCTGACCG  296

Query  297  AGTGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCGGGTCTCACACCCTCCAGTGGATGTATG  370
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Sbjct  297  AGTGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGACGGGTCTCACACCCTCCAGAGGATGTCTG  370

Query  371  GCTGCGACCTGGGGCCCGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGTATGACCAGTCCGCCTACGACGGCAAGGATTACATC  444
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Sbjct  371  GCTGCGACCTGGGGCCCGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGTATGACCAGTCCGCCTACGACGGCAAGGATTACATC  444

Query  445  GCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACGGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTGGGAGGC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  445  GCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACCGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTTGGAGGC  518

Query  519  GGCCCGTGCGGCGGAGCAGCAGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGGAGA  592
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCCGTGCGGCGGAGCAGCTGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGGAGA  592

Query  593  ACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCGGAACACCCAAAGACACACGTGACCCACCATCTCGTCTCTGACCATGAG  666
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Sbjct  593  ACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCAGAACCCCCAAAGACACACGTGACCCACCACCCCCTCTCTGACCATGAG  666

Query  667  GCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGCGAGGA  740
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Sbjct  667  GCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGGGAGGA  740

Query  741  CCAAACTCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGTGG  814
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Sbjct  741  CCAGACCCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGTGG  814

Query  815  TGGTGCCTTCTGGAGAAGAGCAGAGATACACGTGCCATGTGCAGCACGAGGGGCTGCCGGAGCCCCTCACCCTG  888
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Sbjct  815  TGGTGCCTTCTGGACAAGAGCAGAGATACACGTGCCATATGCAGCACGAGGGGCTGCAAGAGCCCCTCACCCTG  888

Query  889  AGATGGGAGCCATCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCGTGGGCATCGTTGCTGGCCTGGCTGTCCTGGCTGTCCT  962
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Sbjct  889  AGCTGGGAGCCATCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCATGGGCATCGTTGCTGGCCTGGCTGTCCTGGTTGTCCT  962

Query  963  AGCTGTCCTAGGAGCTGTGGTGGCTGTTGTTATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAGGTGGAAAAGGAGGGAGCTGCT  1036
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Sbjct  963  AGCTGTCCTTGGAGCTGTGGTCACCGCTATGATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAGGTGGAAAAGGAGGGAGCTGCT  1036

Query 1037  CTCAGGCTGCGTCCAGCAACAGTGCCCAGGGCTCTGATGAGTCTCTCATCGCTTGTAAAGCC  1098
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Sbjct 1037  CTCAGGCTGCGTGCAGCAACAGTGCCCAGGGCTCTGATGAGTCTCTCATCACTTGTAAAGCC  1098