Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10876
• Subject: NM_002127.5
• Aligned Length: 1104
• Identities: 911
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGCGGGTCATGGCGCCCCGAACCCTCATCCTGCTGCTCTCGGGAGCCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCTG  74
            |||..||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||..|
Sbjct    1  ATGGTGGTCATGGCGCCCCGAACCCTCTTCCTGCTGCTCTCGGGGGCCCTGACCCTGACCGAGACCTGGGCGGG  74

Query   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCTACACCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGAGAGCCCCGCTTCATCGCAGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||
Sbjct   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCAGCGCCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCTTCATCGCCATGG  148

Query  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCAAGAGG--GGAGCCGCGGGCGC  220
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||.||||  ||||  ||||||||||||||
Sbjct  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACTCGGCGTGTCC--GAGGATGGAGCCGCGGGCGC  220

Query  221  CGTGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGGAGACACAGAAGTACAAGCGCCAGGCACAGACTGAC  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||||.|||...||||..|||.||||||||||||
Sbjct  221  CGTGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGAAGAGGAGACACGGAACACCAAGGCCCACGCACAGACTGAC  294

Query  295  CGAGTGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCGGGTCTCACACCCTCCAGTGGATGTA  368
            .||.|||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||..
Sbjct  295  AGAATGAACCTGCAGACCCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCAGTTCTCACACCCTCCAGTGGATGAT  368

Query  369  TGGCTGCGACCTGGGGCCCGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGTATGACCAGTCCGCCTACGACGGCAAGGATTACA  442
            ||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||||..||||||||.||||||||||||.
Sbjct  369  TGGCTGCGACCTGGGGTCCGACGGACGCCTCCTCCGCGGGTATGAACAGTATGCCTACGATGGCAAGGATTACC  442

Query  443  TCGCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACGGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTGGGAG  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||.||||||||||.|||
Sbjct  443  TCGCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCAGCGGACACTGCGGCTCAGATCTCCAAGCGCAAGTGTGAG  516

Query  517  GCGGCCCGTGCGGCGGAGCAGCAGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGGA  590
            ||||||..||.|||.||.||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  517  GCGGCCAATGTGGCTGAACAAAGGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCTCCACAGATACCTGGA  590

Query  591  GAACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCGGAACACCCAAAGACACACGTGACCCACCATCTCGTCTCTGACCATG  664
            ||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||||||||.|..||||.||||.|||
Sbjct  591  GAACGGGAAGGAGATGCTGCAGCGCGCGGACCCCCCCAAGACACACGTGACCCACCACCCTGTCTTTGACTATG  664

Query  665  AGGCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGCGAG  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  665  AGGCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCATACTGACCTGGCAGCGGGATGGGGAG  738

Query  739  GACCAAACTCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGT  812
            |||||.||.||||||...|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  GACCAGACCCAGGACGTGGAGCTCGTGGAGACCAGGCCTGCAGGGGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGT  812

Query  813  GGTGGTGCCTTCTGGAGAAGAGCAGAGATACACGTGCCATGTGCAGCACGAGGGGCTGCCGGAGCCCCTCACCC  886
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..|
Sbjct  813  GGTGGTGCCTTCTGGAGAGGAGCAGAGATACACGTGCCATGTGCAGCATGAGGGGCTGCCGGAGCCCCTCATGC  886

Query  887  TGAGATGGGAGCCATCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCGTGGGCATCGTTGCTGGCCTGGCTGTCCTGGCTGTC  960
            ||||||||.|||..|||||||.||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||.||||||.||    
Sbjct  887  TGAGATGGAAGCAGTCTTCCCTGCCCACCATCCCCATCATGGGTATCGTTGCTGGCCTGGTTGTCCTTGC----  956

Query  961  CTAGCTGT----CCTAGGAGCTGTGGTGGCTGTTGTTATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAGGTGGAAAAGGAGGGA  1030
              ||||||    .|| |||||||.|||.||||.|||..||||.||.|.|||||||||||.|             
Sbjct  957  --AGCTGTAGTCACT-GGAGCTGCGGTCGCTGCTGTGCTGTGGAGAAAGAAGAGCTCAGAT-------------  1014

Query 1031  GCTGCTCTCAGGCTGCGTCCAGCAACAGTGCCCAGGGCTCTGATGAGTCTCTCATCGCTTGTAAAGCC  1098
                                                                                
Sbjct 1015  --------------------------------------------------------------------  1014