Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10876
• Subject: NM_005514.8
• Aligned Length: 1098
• Identities: 1015
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGCGGGTCATGGCGCCCCGAACCCTCATCCTGCTGCTCTCGGGAGCCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCTG  74
            ||||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ATGCTGGTCATGGCGCCCCGAACCGTCCTCCTGCTGCTCTCGGCGGCCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCGG  74

Query   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCTACACCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGAGAGCCCCGCTTCATCGCAGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCTACACCTCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCTTCATCTCAGTGG  148

Query  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCAAGAGGGGAGCCGCGGGCGCCG  222
            ||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTACGTGGACGACACCCAGTTCGTGAGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCGAGAGAGGAGCCGCGGGCGCCG  222

Query  223  TGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGGAGACACAGAAGTACAAGCGCCAGGCACAGACTGACCG  296
            |||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||..||||||..||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGATAGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGAACACACAGATCTACAAGGCCCAGGCACAGACTGACCG  296

Query  297  AGTGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCGGGTCTCACACCCTCCAGTGGATGTATG  370
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|
Sbjct  297  AGAGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCGGGTCTCACACCCTCCAGAGCATGTACG  370

Query  371  GCTGCGACCTGGGGCCCGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGTATGACCAGTCCGCCTACGACGGCAAGGATTACATC  444
            ||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTGCGACGTGGGGCCGGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGCATGACCAGTACGCCTACGACGGCAAGGATTACATC  444

Query  445  GCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACGGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTGGGAGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACGGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTGGGAGGC  518

Query  519  GGCCCGTGCGGCGGAGCAGCAGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGGAGA  592
            ||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCCGTGAGGCGGAGCAGCGGAGAGCCTACCTGGAGGGCGAGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGGAGA  592

Query  593  ACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCGGAACACCCAAAGACACACGTGACCCACCATCTCGTCTCTGACCATGAG  666
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Sbjct  593  ACGGGAAGGACAAGCTGGAGCGCGCTGACCCCCCAAAGACACACGTGACCCACCACCCCATCTCTGACCATGAG  666

Query  667  GCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGCGAGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGTTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGCGAGGA  740

Query  741  CCAAACTCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGTGG  814
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCAAACTCAGGACACTGAGCTTGTGGAGACCAGACCAGCAGGAGATAGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGTGG  814

Query  815  TGGTGCCTTCTGGAGAAGAGCAGAGATACACGTGCCATGTGCAGCACGAGGGGCTGCCGGAGCCCCTCACCCTG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  815  TGGTGCCTTCTGGAGAAGAGCAGAGATACACATGCCATGTACAGCATGAGGGGCTGCCGAAGCCCCTCACCCTG  888

Query  889  AGATGGGAGCCATCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCGTGGGCATCGTTGCTGGCCTGGCTGTCCTGGCTGTCCT  962
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Sbjct  889  AGATGGGAGCCGTCTTCCCAGTCCACCGTCCCCATCGTGGGCATTGTTGCTGGCCTGGCTGTCCTAGCAG---T  959

Query  963  AGCTGTCCTAGGAGCTGTGGTGGCTGTTGTTATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAGGTGGAAAAGGAGGGAGCTGCT  1036
            .|..|||.|.|||||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  960  TGTGGTCATCGGAGCTGTGGTCGCTGCTGTGATGTGTAGGAGGAAGAGTTCAGGTGGAAAAGGAGGGAGCTACT  1033

Query 1037  CTCAGGCTGCGTCCAGCAACAGTGCCCAGGGCTCTGATGAGTCTCTCATCGCTTGTAAAGCC  1098
            ||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||..|||         
Sbjct 1034  CTCAGGCTGCGTGCAGCGACAGTGCCCAGGGCTCTGATGTGTCTCTCACAGCT---------  1086