Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10951
- Subject:
- NM_001174146.2
- Aligned Length:
- 1218
- Identities:
- 1116
- Gaps:
- 102
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------------------ATGTT 5
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Sbjct 1 ATGGATATAGCAACAGGTCCCGAGTCGCTGGAGAGGTGCTTCCCTCGCGGGCAGACGGACTGCGCCAAGATGTT 74
Query 6 GGACGGCATCAAGATGGAGGAGCACGCCCTGCGCCCCGGGCCCGCCACTCTGGGGGTGCTGCTGGGCTCCGACT 79
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Sbjct 75 GGACGGCATCAAGATGGAGGAGCACGCCCTGCGCCCCGGGCCCGCCACTCTGGGGGTGCTGCTGGGCTCCGACT 148
Query 80 GCCCGCATCCCGCCGTCTGCGAGGGCTGCCAGCGGCCCATCTCCGACCGCTTCCTGATGCGAGTCAACGAGTCG 153
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Sbjct 149 GCCCGCATCCCGCCGTCTGCGAGGGCTGCCAGCGGCCCATCTCCGACCGCTTCCTGATGCGAGTCAACGAGTCG 222
Query 154 TCCTGGCACGAGGAGTGTTTGCAGTGCGCGGCGTGTCAGCAAGCCCTCACCACCAGCTGCTACTTCCGGGATCG 227
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Sbjct 223 TCCTGGCACGAGGAGTGTTTGCAGTGCGCGGCGTGTCAGCAAGCCCTCACCACCAGCTGCTACTTCCGGGATCG 296
Query 228 GAAACTGTACTGCAAACAAGACTACCAACAGCTCTTCGCGGCCAAGTGCAGCGGCTGCATGGAGAAGATCGCCC 301
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Sbjct 297 GAAACTGTACTGCAAACAAGACTACCAACAGCTCTTCGCGGCCAAGTGCAGCGGCTGCATGGAGAAGATCGCCC 370
Query 302 CCACCGAGTTCGTGATGCGGGCGCTGGAGTGCGTGTACCACCTGGGCTGCTTCTGCTGCTGCGTGTGTGAACGG 375
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Sbjct 371 CCACCGAGTTCGTGATGCGGGCGCTGGAGTGCGTGTACCACCTGGGCTGCTTCTGCTGCTGCGTGTGTGAACGG 444
Query 376 CAGCTACGCAAGGGCGACGAATTCGTGCTCAAGGAGGGCCAGCTGCTGTGCAAGGGTGACTACGAGAAGGAGAA 449
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Sbjct 445 CAGCTACGCAAGGGCGACGAATTCGTGCTCAAGGAGGGCCAGCTGCTGTGCAAGGGTGACTACGAGAAGGAGAA 518
Query 450 GGACCTGCTCAGCTCCGTGAGCCCCGACGAGTCCGACTCCGTGAAGAGCGAGGATGAAGATGGGGACATGAAGC 523
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Sbjct 519 GGACCTGCTCAGCTCCGTGAGCCCCGACGAGTCCGACTCCGTGAAGAGCGAGGATGAAGATGGGGACATGAAGC 592
Query 524 CGGCCAAGGGGCAGGGCAGTCAGAGCAAGGGCAGCGGGGATGACGGGAAGGACCCGCGGAGGCCCAAGCGACCC 597
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Sbjct 593 CGGCCAAGGGGCAGGGCAGTCAGAGCAAGGGCAGCGGGGATGACGGGAAGGACCCGCGGAGGCCCAAGCGACCC 666
Query 598 CGGACCATCCTCACCACGCAGCAGCGAAGAGCCTTCAAGGCCTCCTTCGAGGTCTCGTCGAAGCCTTGCCGAAA 671
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Sbjct 667 CGGACCATCCTCACCACGCAGCAGCGAAGAGCCTTCAAGGCCTCCTTCGAGGTCTCGTCGAAGCCTTGCCGAAA 740
Query 672 GGTCCGAGAGACACTGGCAGCTGAGACGGGCCTCAGTGTGCGCGTGGTCCAGGTCTGGTTTCAGAACCAAAGAG 745
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Sbjct 741 GGTCCGAGAGACACTGGCAGCTGAGACGGGCCTCAGTGTGCGCGTGGTCCAGGTCTGGTTTCAGAACCAAAGAG 814
Query 746 CAAAGATGAAGAAGCTGGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAACTCCCAGCGG------------ 807
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Sbjct 815 CAAAGATGAAGAAGCTGGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAACTCCCAGCGGCTGGGCCAGGGT 888
Query 808 ---------------------CTGGGCCAGGAGGTCCTGTCCAGCCGCATGGAGGGCATGATGGCTTCCTACAC 860
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Sbjct 889 GAGCCGGGGCCGGGGCAGGGCCTGGGCCAGGAGGTCCTGTCCAGCCGCATGGAGGGCATGATGGCTTCCTACAC 962
Query 861 GCCGCTGGCCCCACCACAGCAGCAGATCGTGGCCATGGAACAGAGCCCCTACGGCAGCAGCGACCCCTTCCAGC 934
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Sbjct 963 GCCGCTGGCCCCACCACAGCAGCAGATCGTGGCCATGGAACAGAGCCCCTACGGCAGCAGCGACCCCTTCCAGC 1036
Query 935 AGGGCCTCACGCCGCCCCAAATGCCAGGGAACGACTCCATCTTCCATGACATCGACAGCGATACCTCCTTAACC 1008
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Sbjct 1037 AGGGCCTCACGCCGCCCCAAATGCCAGGGAACGACTCCATCTTCCATGACATCGACAGCGATACCTCCTTAACC 1110
Query 1009 AGCCTCAGCGACTGCTTCCTCGGCTCCTCAGACGTGGGCTCCCTGCAGGCCCGCGTGGGGAACCCCATCGACCG 1082
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Sbjct 1111 AGCCTCAGCGACTGCTTCCTCGGCTCCTCAGACGTGGGCTCCCTGCAGGCCCGCGTGGGGAACCCCATCGACCG 1184
Query 1083 GCTCTACTCCATGCAGAGTTCCTACTTCGCCTCC 1116
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Sbjct 1185 GCTCTACTCCATGCAGAGTTCCTACTTCGCCTCC 1218