Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10951
• Subject: NM_001174147.2
• Aligned Length: 1206
• Identities: 1116
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------------ATGTT  5
                                                                                 |||||
Sbjct    1  ATGGATATAGCAACAGGTCCCGAGTCGCTGGAGAGGTGCTTCCCTCGCGGGCAGACGGACTGCGCCAAGATGTT  74

Query    6  GGACGGCATCAAGATGGAGGAGCACGCCCTGCGCCCCGGGCCCGCCACTCTGGGGGTGCTGCTGGGCTCCGACT  79
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACGGCATCAAGATGGAGGAGCACGCCCTGCGCCCCGGGCCCGCCACTCTGGGGGTGCTGCTGGGCTCCGACT  148

Query   80  GCCCGCATCCCGCCGTCTGCGAGGGCTGCCAGCGGCCCATCTCCGACCGCTTCCTGATGCGAGTCAACGAGTCG  153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCCGCATCCCGCCGTCTGCGAGGGCTGCCAGCGGCCCATCTCCGACCGCTTCCTGATGCGAGTCAACGAGTCG  222

Query  154  TCCTGGCACGAGGAGTGTTTGCAGTGCGCGGCGTGTCAGCAAGCCCTCACCACCAGCTGCTACTTCCGGGATCG  227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCTGGCACGAGGAGTGTTTGCAGTGCGCGGCGTGTCAGCAAGCCCTCACCACCAGCTGCTACTTCCGGGATCG  296

Query  228  GAAACTGTACTGCAAACAAGACTACCAACAGCTCTTCGCGGCCAAGTGCAGCGGCTGCATGGAGAAGATCGCCC  301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAACTGTACTGCAAACAAGACTACCAACAGCTCTTCGCGGCCAAGTGCAGCGGCTGCATGGAGAAGATCGCCC  370

Query  302  CCACCGAGTTCGTGATGCGGGCGCTGGAGTGCGTGTACCACCTGGGCTGCTTCTGCTGCTGCGTGTGTGAACGG  375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCACCGAGTTCGTGATGCGGGCGCTGGAGTGCGTGTACCACCTGGGCTGCTTCTGCTGCTGCGTGTGTGAACGG  444

Query  376  CAGCTACGCAAGGGCGACGAATTCGTGCTCAAGGAGGGCCAGCTGCTGTGCAAGGGTGACTACGAGAAGGAGAA  449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGCTACGCAAGGGCGACGAATTCGTGCTCAAGGAGGGCCAGCTGCTGTGCAAGGGTGACTACGAGAAGGAGAA  518

Query  450  GGACCTGCTCAGCTCCGTGAGCCCCGACGAGTCCGACTCCGTGAAGAGCGAGGATGAAGATGGGGACATGAAGC  523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGACCTGCTCAGCTCCGTGAGCCCCGACGAGTCCGACTCCGTGAAGAGCGAGGATGAAGATGGGGACATGAAGC  592

Query  524  CGGCCAAGGGGCAGGGCAGTCAGAGCAAGGGCAGCGGGGATGACGGGAAGGACCCGCGGAGGCCCAAGCGACCC  597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGGCCAAGGGGCAGGGCAGTCAGAGCAAGGGCAGCGGGGATGACGGGAAGGACCCGCGGAGGCCCAAGCGACCC  666

Query  598  CGGACCATCCTCACCACGCAGCAGCGAAGAGCCTTCAAGGCCTCCTTCGAGGTCTCGTCGAAGCCTTGCCGAAA  671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGGACCATCCTCACCACGCAGCAGCGAAGAGCCTTCAAGGCCTCCTTCGAGGTCTCGTCGAAGCCTTGCCGAAA  740

Query  672  GGTCCGAGAGACACTGGCAGCTGAGACGGGCCTCAGTGTGCGCGTGGTCCAGGTCTGGTTTCAGAACCAAAGAG  745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTCCGAGAGACACTGGCAGCTGAGACGGGCCTCAGTGTGCGCGTGGTCCAGGTCTGGTTTCAGAACCAAAGAG  814

Query  746  CAAAGATGAAGAAGCTGGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAACTCCCAGCGGCTGGGCCAGGAG  819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAAAGATGAAGAAGCTGGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAACTCCCAGCGGCTGGGCCAGGAG  888

Query  820  GTCCTGTCCAGCCGCATGGAGGGCATGATGGCTTCCTACACGCCGCTGGCCCCACCACAGCAGCAGATCGTGGC  893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCCTGTCCAGCCGCATGGAGGGCATGATGGCTTCCTACACGCCGCTGGCCCCACCACAGCAGCAGATCGTGGC  962

Query  894  CATGGAACAGAGCCCCTACGGCAGCAGCGACCCCTTCCAGCAGGGCCTCACGCCGCCCCAAATGCCA-------  960
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  963  CATGGAACAGAGCCCCTACGGCAGCAGCGACCCCTTCCAGCAGGGCCTCACGCCGCCCCAAATGCCAGGTGACC  1036

Query  961  --------------GGGAACGACTCCATCTTCCATGACATCGACAGCGATACCTCCTTAACCAGCCTCAGCGAC  1020
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACATGAACCCCTATGGGAACGACTCCATCTTCCATGACATCGACAGCGATACCTCCTTAACCAGCCTCAGCGAC  1110

Query 1021  TGCTTCCTCGGCTCCTCAGACGTGGGCTCCCTGCAGGCCCGCGTGGGGAACCCCATCGACCGGCTCTACTCCAT  1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGCTTCCTCGGCTCCTCAGACGTGGGCTCCCTGCAGGCCCGCGTGGGGAACCCCATCGACCGGCTCTACTCCAT  1184

Query 1095  GCAGAGTTCCTACTTCGCCTCC  1116
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCAGAGTTCCTACTTCGCCTCC  1206