Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10956
• Subject: XM_017010866.2
• Aligned Length: 1371
• Identities: 1316
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ATGAACCGATACACAACCATGAGACAGTTGGGGGACGGCACGTATGGGAGTGTGCTTATGGGCAAGAGTAATGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCGATACACAACCATGAGACAGTTGGGGGACGGCACGTATGGGAGTGTGCTTATGGGCAAGAGTAATGA  74

Query   75  ATCCGGGGAGCTGGTGGCCATCAAAAGGATGAAGAGAAAGTTCTATTCTTGGGATGAATGCATGAACTTGAGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCCGGGGAGCTGGTGGCCATCAAAAGGATGAAGAGAAAGTTCTATTCTTGGGATGAATGCATGAACTTGAGAG  148

Query  149  AAGTTAAGTCTCTGAAGAAACTTAATCATGCCAATGTTATTAAATTGAAAGAAGTTATCAGAGAAAATGACCAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGTTAAGTCTCTGAAGAAACTTAATCATGCCAATGTTATTAAATTGAAAGAAGTTATCAGAGAAAATGACCAT  222

Query  223  CTTTATTTTATATTTGAATATATGAAAGAAAACCTCTATCAATTAATGAAAGACAGAAACAAGTTGTTCCCTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTTATTTTATATTTGAATATATGAAAGAAAACCTCTATCAATTAATGAAAGACAGAAACAAGTTGTTCCCTGA  296

Query  297  ATCAGTCATCAGAAATATTATGTATCAAATATTGCAAGGGCTGGCTTTTATCCATAAACATGGCTTTTTTCATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCAGTCATCAGAAATATTATGTATCAAATATTGCAAGGGCTGGCTTTTATCCATAAACATGGCTTTTTTCATA  370

Query  371  GGGACATGAAACCAGAAAACTTGCTTTGTATGGGTCCAGAGCTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGACTTGCAAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGACATGAAACCAGAAAACTTGCTTTGTATGGGTCCAGAGCTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGACTTGCAAGA  444

Query  445  GAATTAAGGTCACAGCCACCATACACTGATTATGTATCTACCAGATGGTATCGTGCCCCTGAAGTTTTACTGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAATTAAGGTCACAGCCACCATACACTGATTATGTATCTACCAGATGGTATCGTGCCCCTGAAGTTTTACTGAG  518

Query  519  ATCTTCAGTTTATAGTTCTCCCATTGATGTGTGGGCTGTTGGAAGTATCATGGCTGAACTCTATATGTTAAGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATCTTCAGTTTATAGTTCTCCCATTGATGTGTGGGCTGTTGGAAGTATCATGGCTGAACTCTATATGTTAAGGC  592

Query  593  CACTTTTCCCAGGGACAAGTGAGGTCGATGAAATCTTTAAAATTTGCCAAGTTTTAGGGACTCCCAAAAAAAGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACTTTTCCCAGGGACAAGTGAGGTCGATGAAATCTTTAAAATTTGCCAAGTTTTAGGGACTCCCAAAAAAAGT  666

Query  667  GACTGGCCAGAAGGATACCAGCTGGCATCCTCTATGAACTTCCGTTTTCCCCAGTGTGTTCCTATAAACTTAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACTGGCCAGAAGGATACCAGCTGGCATCCTCTATGAACTTCCGTTTTCCCCAGTGTGTTCCTATAAACTTAAA  740

Query  741  AACTCTTATTCCCAATGCCAGTAATGAAGCTATTCAGCTCATGACCGAAATGTTGAATTGGGATCCAAAGAAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AACTCTTATTCCCAATGCCAGTAATGAAGCTATTCAGCTCATGACCGAAATGTTGAATTGGGATCCAAAGAAAC  814

Query  815  GACCGACAGCAAGCCAGGCATTGAAACACCCATATTTTCAAGTTGGTCAGGTATTAGGCCCTTCGTCAAATCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACCGACAGCAAGCCAGGCATTGAAACACCCATATTTTCAAGTTGGTCAGGTATTAGGCCCTTCGTCAAATCAT  888

Query  889  CTGGAATCAAAACAGTCTTTAAATAAGCAGCTGCAACCATTAGAATCAAAGCCATCTTTAGTTGAGGTAGAGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGAATCAAAACAGTCTTTAAATAAGCAGCTGCAACCATTAGAATCAAAGCCATCTTTAGTTGAGGTAGAGCC  962

Query  963  TAAGCCTCTGCCGGATATAATCGATCAGGTTGTTGGACAACCCCAGCCAAAAACTAGCCAGCAGCCACTGCAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAAGCCTCTGCCGGATATAATCGATCAGGTTGTTGGACAACCCCAGCCAAAAACTAGCCAGCAGCCACTGCAGC  1036

Query 1037  CCATTCAGCCGCCACAGAACCTGAGCGTCCAGCAACCTCCAAAGCAACAGAGTCAGGAGAAACCGCCACAAACG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCATTCAGCCGCCACAGAACCTGAGCGTCCAGCAACCTCCAAAGCAACAGAGTCAGGAGAAACCGCCACAAACG  1110

Query 1111  CTATTCCCGAGCATCGTCAAAAACATGCCAACTAAGCCAAATGGCACACTGAGTCATAAAAGTGGTAGGAGGCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTATTCCCGAGCATCGTCAAAAACATGCCAACTAAGCCAAATGGCACACTGAGTCATAAAAGTGGTAGGAGGCG  1184

Query 1185  TTGGGGTCAGACTATCTTCAAGTCTGGAGATAGCTGGGAAGAGTTGGAGGACTATGATTTCGGAGCCTCCCATT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTGGGGTCAGACTATCTTCAAGTCTGGAGATAGCTGGGAAGAGTTGGAGGACTATGATTTCGGAGCCTCCCATT  1258

Query 1259  CCAAGAAGCCAAGCATGGGTGTTTTTAAAGAAAAAAGGAAAAAAGATTCTCCATTTCGTCAACAGGTGAAGATG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.               
Sbjct 1259  CCAAGAAGCCAAGCATGGGTGTTTTTAAAGAAAAAAGGAAAAAAGATTCTCCATTTCGG---------------  1317

Query 1333  GCTGTTATTTCCCTCTCAGCACACCAGTTTCCCACGTTA  1371
                                                   
Sbjct 1318  ---------------------------------------  1317