Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11063
• Subject: NM_001031850.4
• Aligned Length: 1280
• Identities: 1166
• Gaps: 31

Alignment

Query    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            ||||||.||||||||||||||||||||||.||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATGGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|   ||||||||||||||||||.||..||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCA---AATTATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGA  293

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACACAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  367

Query  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAAG  444
            ||||||||.|||..|||||||||.||||||||||||||..||||||..||||||||.||..|||||||||.|||
Sbjct  368  TCATAAAGCGAGGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATACTCGGAGACTCCCAAG  441

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||..|||||||||||||.||||||.||||||.||||||||
Sbjct  442  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  515

Query  519  TCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAAA  592
            |||.||.||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||||||||||.|||.||||||||.|||
Sbjct  516  TCCGGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  589

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            |||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  663

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCAAAGCTGTCCAAGCCCTACATCACAATCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.|||.||||||||.|||||
Sbjct  664  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATCACCATCAA  737

Query  741  CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            |||||||||||||||.|||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct  738  CAACTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTACACCTACA  811

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  812  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT  885

Query  889  CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962
            |||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  959

Query  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  TAACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1033

Query 1037  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG  1110
            ||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||||.||||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  1107

Query 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1108  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1181

Query 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTG---------ACTGGA  1249
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||         | ||||
Sbjct 1182  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCA-TGGA  1254

Query 1250  TATTACCC--------------  1257
                |.||              
Sbjct 1255  ----AACCAGACAGAGTCTCAT  1272