Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11063
• Subject: XM_005259075.4
• Aligned Length: 1489
• Identities: 897
• Gaps: 515

Alignment

Query    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||..|||||.||||||||.||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATGGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||.|||.|||.||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||..|||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            |||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAAG  444
            ||||||||.|||.|||||.||||||||.||.||.|.|||.||||||||||||||||.||.||||||||||.|||
Sbjct  371  TCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCTTATACTTGGAGACTCCCAAG  444

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGAC  518
            ||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||.||||||||
Sbjct  445  CCCTACATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  518

Query  519  TCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAAA  592
            ||..||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.||||||||.|||
Sbjct  519  TCTGGACGCAAGCTACCTATGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTGTGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  592

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            |||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCAAAGCTGTCCAAGCCCTACATCACAATCAA  740
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  667  GTGAGTGCCAGTCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC-------------------------------  709

Query  741  CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  889  CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
                                      |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  --------------------------ATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  757

Query 1037  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG  1110
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|.||.||||||||||.||||.|.||||.||||||||||||||||
Sbjct  758  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTCACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGG  831

Query 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC  1184
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  832  AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  905

Query 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTG---ACTGGATATTAC  1255
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||   |.|||||    |
Sbjct  906  TGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGGTAAGTGGAT----C  975

Query 1256  CC------------------------------------------------------------------------  1257
            ||                                                                        
Sbjct  976  CCAGCATCCTTGGCAGTAGGGTTTTATGTGGAGTCTATCTGGCTTTCAGAGAAGAGTCAGGAAAACATTTTTAT  1049

Query 1258  --------------------------------------------------------------------------  1257
                                                                                      
Sbjct 1050  TCCCAGCCTGTGTCCCATGGGCACAAGCAAATCCCAAATTCTCCTCCTGAACCCTCCCAATTTGTCTCTACAGA  1123

Query 1258  --------------------------------------------------------------------------  1257
                                                                                      
Sbjct 1124  CTCTCTTCTCCTTGTTTTTCTGTTTTCTTATGGCTGACCTTGTGTCTGGCCTGAAAAAGGTAGGGAGGGGGCTT  1197

Query 1258  ---------  1257
                     
Sbjct 1198  TATCAGCCC  1206