Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11088
• Subject: NM_133629.3
• Aligned Length: 685
• Identities: 574
• Gaps: 95

Alignment

Query   1  ATGG-------CAG----CAAATGTGGCCCATGGCCTGCAGCAAAACGTCCTATATGTAGATTCCAATGGAGG-  62
           ||||       |||    ..|.||||  ||.||||||                        |.||    |||| 
Sbjct   1  ATGGGCGTGCTCAGGGTCGGACTGTG--CCCTGGCCT------------------------TACC----GAGGA  44

Query  63  GCTGA--CAGCTTCCC----GCCTC---CTCCAG------------CTG----CTTCAGGCTAAAACCCAGGAT  111
           |.|||  |||||||.|    |||.|   .||.||            |||    ||.|||       .||.|||.
Sbjct  45  GATGATCCAGCTTCTCAGGAGCCACAGGATCAAGACAGTGGTGGACCTGGTTTCTGCAG-------ACCTGGAA  111

Query 112  GAGG------AGGAA---------------CAGGCAGAAGCTCTCCGGAGGATCCAGGTGGTGCATGCATTTGA  164
           ||||      ||.||               .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 112  GAGGTAGCTCAGAAATGTGGCTTGTCTTACAAGGCAGAAGCTCTCCGGAGGATCCAGGTGGTGCATGCATTTGA  185

Query 165  CATCTTCCAGATGCTGGATGTGCTGCAGGAGCTCCGAGGCACTGTGGCCCAGCAGGTGACTGGTTCTTCAGGAA  238
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 186  CATCTTCCAGATGCTGGATGTGCTGCAGGAGCTCCGAGGCACTGTGGCCCAGCAGGTGACTGGTTCTTCAGGAA  259

Query 239  CTGTGAAGGTGGTGGTTGTGGACTCGGTCACTGCGGTGGTTTCCCCACTTCTGGGAGGTCAGCAGAGGGAAGGC  312
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 260  CTGTGAAGGTGGTGGTTGTGGACTCGGTCACTGCGGTGGTTTCCCCACTTCTGGGAGGTCAGCAGAGGGAAGGC  333

Query 313  TTGGCCTTGATGATGCAGCTGGCCCGAGAGCTGAAGACCCTGGCCCGGGACCTTGGCATGGCAGTGGTGGTGAC  386
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 334  TTGGCCTTGATGATGCAGCTGGCCCGAGAGCTGAAGACCCTGGCCCGGGACCTTGGCATGGCAGTGGTGGTGAC  407

Query 387  CAACCACATAACTCGAGACAGGGACAGCGGGAGGCTCAAACCTGCCCTCGGACGCTCCTGGAGCTTTGTGCCCA  460
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408  CAACCACATAACTCGAGACAGGGACAGCGGGAGGCTCAAACCTGCCCTCGGACGCTCCTGGAGCTTTGTGCCCA  481

Query 461  GCACTCGGATTCTCCTGGACACCATCGAGGGAGCAGGAGCATCAGGCGGCCGGCGCATGGCGTGTCTGGCCAAA  534
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 482  GCACTCGGATTCTCCTGGACACCATCGAGGGAGCAGGAGCATCAGGCGGCCGGCGCATGGCGTGTCTGGCCAAA  555

Query 535  TCTTCCCGACAGCCAACAGGTTTCCAGGAGATGGTAGACATTGGGACCTGGGGGACCTCAGAGCAGAGTGCCAC  608
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 556  TCTTCCCGACAGCCAACAGGTTTCCAGGAGATGGTAGACATTGGGACCTGGGGGACCTCAGAGCAGAGTGCCAC  629

Query 609  ATTACAGGGTGATCAGACA  627
           |||||||||||||||||||
Sbjct 630  ATTACAGGGTGATCAGACA  648