Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11109
- Subject:
- NM_001272042.1
- Aligned Length:
- 1575
- Identities:
- 1281
- Gaps:
- 291
Alignment
Query 1 ATGAGGCGACGAAGGAGGCGGGACGGCTTTTACCCAGCCCCGGACTTCCGAGACAGGGAAGCTGAGGACATGGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGCGACGAAGGAGGCGGGACGGCTTTTACCCAGCCCCGGACTTCCGAGACAGGGAAGCTGAGGACATGGC 74
Query 75 AGGAGTGTTTGACATAGACCTGGACCAGCCAGAGGACGCGGGCTCTGAGGATGAGCTGGAGGAGGGGGGTCAGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGGAGTGTTTGACATAGACCTGGACCAGCCAGAGGACGCGGGCTCTGAGGATGAGCTGGAGGAGGGGGGTCAGT 148
Query 149 TAAATGAAAGCATGGACCATGGGGGAGTTGGACCATATGAACTTGGCATGGAACATTGTGAGAAATTTGAAATC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TAAATGAAAGCATGGACCATGGGGGAGTTGGACCATATGAACTTGGCATGGAACATTGTGAGAAATTTGAAATC 222
Query 223 TCAGAAACTAGTGTGAACAGAGGGCCAGAAAAAATCAGACCAGAATGTTTTGAGCTACTTCGGGTACTTGGTAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCAGAAACTAGTGTGAACAGAGGGCCAGAAAAAATCAGACCAGAATGTTTTGAGCTACTTCGGGTACTTGGTAA 296
Query 297 AGGGGGCTATGGAAAGGTTTTTCAAGTACGAAAAGTAACAGGAGCAAATACTGGGAAAATATTTGCCATGAAGG 370
||||||||||||
Sbjct 297 AGGGGGCTATGG-------------------------------------------------------------- 308
Query 371 TGCTTAAAAAGGCAATGATAGTAAGAAATGCTAAAGATACAGCTCATACAAAAGCAGAACGGAATATTCTGGAG 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 309 -------AAAGGCAATGATAGTAAGAAATGCTAAAGATACAGCTCATACAAAAGCAGAACGGAATATTCTGGAG 375
Query 445 GAAGTAAAGCATCCCTTCATCGTGGATTTAATTTATGCCTTTCAGACTGGTGGAAAACTCTACCTCATCCTTGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 GAAGTAAAGCATCCCTTCATCGTGGATTTAATTTATGCCTTTCAGACTGGTGGAAAACTCTACCTCATCCTTGA 449
Query 519 GTATCTCAGTGGAGGAGAACTATTTATGCAGTTAGAAAGAGAGGGAATATTTATGGAAGACACTGCCTGCTTTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 450 GTATCTCAGTGGAGGAGAACTATTTATGCAGTTAGAAAGAGAGGGAATATTTATGGAAGACACTGCCTGCTTTT 523
Query 593 ACTTGGCAGAAATCTCCATGGCTTTGGGGCATTTACATCAAAAGGGGATCATCTACAGAGACCTGAAGCCGGAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 524 ACTTGGCAGAAATCTCCATGGCTTTGGGGCATTTACATCAAAAGGGGATCATCTACAGAGACCTGAAGCCGGAG 597
Query 667 AATATCATGCTTAATCACCAAGGTCATGTGAAACTAACAGACTTTGGACTATGCAAAGAATCTATTCATGATGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 AATATCATGCTTAATCACCAAGGTCATGTGAAACTAACAGACTTTGGACTATGCAAAGAATCTATTCATGATGG 671
Query 741 AACAGTCACACACACATTTTGTGGAACAATAGAATACATGGCCCCTGAAATCTTGATGAGAAGTGGCCACAATC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 672 AACAGTCACACACACATTTTGTGGAACAATAGAATACATGGCCCCTGAAATCTTGATGAGAAGTGGCCACAATC 745
Query 815 GTGCTGTGGATTGGTGGAGTTTGGGAGCATTAATGTATGACATGCTGACTGGAGCACCCCCATTCACTGGGGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 746 GTGCTGTGGATTGGTGGAGTTTGGGAGCATTAATGTATGACATGCTGACTGGAGCACCCCCATTCACTGGGGAG 819
Query 889 AATAGAAAGAAAACAATTGACAAAATCCTCAAATGTAAACTCAATTTGCCTCCCTACCTCACACAAGAAGCCAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 820 AATAGAAAGAAAACAATTGACAAAATCCTCAAATGTAAACTCAATTTGCCTCCCTACCTCACACAAGAAGCCAG 893
Query 963 AGATCTGCTTAAAAAGCTGCTGAAAAGAAATGCTGCTTCTCGTCTGGGAGCTGGTCCTGGGGACGCTGGAGAAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 894 AGATCTGCTTAAAAAGCTGCTGAAAAGAAATGCTGCTTCTCGTCTGGGAGCTGGTCCTGGGGACGCTGGAGAAG 967
Query 1037 TTCAAGCTCATCCATTCTTTAGACACATTAACTGGGAAGAACTTCTGGCTCGAAAGGTGGAGCCCCCCTTTAAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 968 TTCAAGCTCATCCATTCTTTAGACACATTAACTGGGAAGAACTTCTGGCTCGAAAGGTGGAGCCCCCCTTTAAA 1041
Query 1111 CCTCTGTTGCAATCTGAAGAGGATGTAAGTCAGTTTGATTCCAAGTTTACACGTCAGACACCTGTCGACAGCCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042 CCTCTGTTGCAATCTGAAGAGGATGTAAGTCAGTTTGATTCCAAGTTTACACGTCAGACACCTGTCGACAGCCC 1115
Query 1185 AGATGACTCAACTCTCAGTGAAAGTGCCAATCAGGTCTTTCTGGGTTTTACATATGTGGCTCCATCTGTACTTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116 AGATGACTCAACTCTCAGTGAAAGTGCCAATCAGGTCTTTCTGGGTTTTACATATGTGGCTCCATCTGTACTTG 1189
Query 1259 AAAGTGTGAAAGAAAAGTTTTCCTTTGAACCAAAAATCCGATCACCTCGAAGATTTATTGGCAGCCCACGAACA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190 AAAGTGTGAAAGAAAAGTTTTCCTTTGAACCAAAAATCCGATCACCTCGAAGATTTATTGGCAGCCCACGAACA 1263
Query 1333 CCTGTCAG------------TACTGCT-----------------ATGTGC------------------------ 1353
|||||||| |.||.|| |.||||
Sbjct 1264 CCTGTCAGCCCAGTCAAATTTTCTCCTGGGGATTTCTGGGGAAGAGGTGCTTCGGCCAGCACAGCAAATCCTCA 1337
Query 1354 -------------------------------------------------------------------------- 1353
Sbjct 1338 GACACCTGTGGAATACCCAATGGAAACAAGTGGCATAGAGCAGATGGATGTGACAATGAGTGGGGAAGCATCGG 1411
Query 1354 -------------------------------------------------------------------------- 1353
Sbjct 1412 CACCACTTCCAATACGACAGCCGAACTCTGGGCCATACAAAAAACAAGCTTTTCCCATGATCTCCAAACGGCCA 1485
Query 1354 --------------------- 1353
Sbjct 1486 GAGCACCTGCGTATGAATCTA 1506