Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11109
- Subject:
- XM_006534314.3
- Aligned Length:
- 1575
- Identities:
- 1131
- Gaps:
- 381
Alignment
Query 1 ATGAGGCGACGAAGGAGGCGGGACGGCTTTTACCCAGCCCCGGACTTCCGAGACAGGGAAGCTGAGGACATGGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGGAGTGTTTGACATAGACCTGGACCAGCCAGAGGACGCGGGCTCTGAGGATGAGCTGGAGGAGGGGGGTCAGT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TAAATGAAAGCATGGACCATGGGGGAGTTGGACCATATGAACTTGGCATGGAACATTGTGAGAAATTTGAAATC 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------ATGGACCATGGGGGAGTTGGACCATATGAACTTGGCATGGAACATTGTGAGAAATTTGAAATC 63
Query 223 TCAGAAACTAGTGTGAACAGAGGGCCAGAAAAAATCAGACCAGAATGTTTTGAGCTACTTCGGGTACTTGGTAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 TCAGAAACTAGTGTGAACAGAGGGCCAGAAAAAATCAGACCAGAATGTTTTGAGCTACTTCGGGTACTTGGTAA 137
Query 297 AGGGGGCTATGGAAAGGTTTTTCAAGTACGAAAAGTAACAGGAGCAAATACTGGGAAAATATTTGCCATGAAGG 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 138 AGGGGGCTATGGAAAGGTTTTTCAAGTACGAAAAGTAACAGGAGCAAATACTGGGAAGATATTTGCCATGAAGG 211
Query 371 TGCTTAAAAAGGCAATGATAGTAAGAAATGCTAAAGATACAGCTCATACAAAAGCAGAACGGAATATTCTGGAG 444
||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 212 TGCTTAAAAAGGCAATGATAGTGAGGAATGCTAAGGACACGGCCCACACGAAAGCAGAGCGGAACATTCTGGAG 285
Query 445 GAAGTAAAGCATCCCTTCATCGTGGATTTAATTTATGCCTTTCAGACTGGTGGAAAACTCTACCTCATCCTTGA 518
|||||.||.||.||.|||||.|||||..|.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct 286 GAAGTGAAACACCCTTTCATTGTGGACCTGATTTATGCCTTTCAGACCGGAGGAAAGCTCTACCTCATCCTCGA 359
Query 519 GTATCTCAGTGGAGGAGAACTATTTATGCAGTTAGAAAGAGAGGGAATATTTATGGAAGACACTGCCTGCTTTT 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 360 GTATCTCAGTGGAGGAGAACTATTTATGCAGTTAGAAAGAGAGGGAATATTCATGGAAGACACAGCGTGCTTTT 433
Query 593 ACTTGGCAGAAATCTCCATGGCTTTGGGGCATTTACATCAAAAGGGGATCATCTACAGAGACCTGAAGCCGGAG 666
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 434 ACTTGGCTGAAATCTCCATGGCTTTGGGGCATTTACATCAAAAAGGGATCATCTACAGAGACCTGAAGCCGGAG 507
Query 667 AATATCATGCTTAATCACCAAGGTCATGTGAAACTAACAGACTTTGGACTATGCAAAGAATCTATTCATGATGG 740
||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508 AACATCATGCTTAATCACCAAGGTCACGTGAAACTAACAGACTTTGGACTATGCAAAGAATCTATTCATGATGG 581
Query 741 AACAGTCACACACACATTTTGTGGAACAATAGAATACATGGCCCCTGAAATCTTGATGAGAAGTGGCCACAATC 814
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 582 AACAGTCACGCACACATTTTGTGGAACAATAGAATACATGGCCCCTGAAATCTTAATGAGAAGCGGCCACAACC 655
Query 815 GTGCTGTGGATTGGTGGAGTTTGGGAGCATTAATGTATGACATGCTGACTGGAGCACCCCCATTCACTGGGGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 656 GTGCTGTGGATTGGTGGAGTTTGGGAGCATTAATGTATGACATGCTGACTGGAGCACCTCCATTCACTGGGGAG 729
Query 889 AATAGAAAGAAAACAATTGACAAAATCCTCAAATGTAAACTCAATTTGCCTCCCTACCTCACACAAGAAGCCAG 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 730 AATAGAAAGAAAACAATTGACAAAATCCTCAAATGTAAACTTAATTTGCCTCCCTACCTCACACAAGAAGCTCG 803
Query 963 AGATCTGCTTAAAAAGCTGCTGAAAAGAAATGCTGCTTCTCGTCTGGGAGCTGGTCCTGGGGACGCTGGAGAAG 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 804 AGATCTGCTTAAAAAGCTGCTGAAAAGAAATGCTGCTTCTCGTCTTGGAGCTGGCCCTGGGGATGCTGGAGAAG 877
Query 1037 TTCAAGCTCATCCATTCTTTAGACACATTAACTGGGAAGAACTTCTGGCTCGAAAGGTGGAGCCCCCCTTTAAA 1110
|.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct 878 TCCAAGCTCATCCTTTTTTCAGACACATTAACTGGGAAGAACTTCTGGCTCGGAAGGTGGAACCTCCCTTTAAG 951
Query 1111 CCTCTGTTGCAATCTGAAGAGGATGTAAGTCAGTTTGATTCCAAGTTTACACGTCAGACACCTGTCGACAGCCC 1184
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 952 CCTCTGTTGCAATCTGAAGAGGATGTGAGTCAGTTTGATTCAAAGTTTACACGTCAGACACCTGTTGACAGCCC 1025
Query 1185 AGATGACTCAACTCTCAGTGAAAGTGCCAATCAGGTCTTTCTGGGTTTTACATATGTGGCTCCATCTGTACTTG 1258
.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026 TGATGACTCCACTCTCAGTGAAAGTGCCAACCAGGTCTTTCTGGGTTTTACATATGTGGCTCCATCTGTACTTG 1099
Query 1259 AAAGTGTGAAAGAAAAGTTTTCCTTTGAACCAAAAATCCGATCACCTCGAAGATTTATTGGCAGCCCACGAACA 1332
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1100 AAAGTGTGAAAGAAAAGTTTTCATTTGAACCAAAAATCCGATCTCCTAGAAGATTTATTGGTAGTCCACGAACA 1173
Query 1333 CCTGTCAG---------------TACTG--------------CTATGTGC------------------------ 1353
|||||||| |.||| |.|.||||
Sbjct 1174 CCTGTCAGCCCAGTCAAATTCTCTCCTGGGGATTTCTGGGGACGAGGTGCTTCAGCCAGCACGGCAAATCCTCA 1247
Query 1354 -------------------------------------------------------------------------- 1353
Sbjct 1248 GACCCCTGTGGAATACCCAATGGAAACAAGTGGGATAGAGCAGATGGATGTGACAGTGAGCGGGGAAGCATCAG 1321
Query 1354 -------------------------------------------------------------------------- 1353
Sbjct 1322 CGCCACTTCCAATCCGACAACCCAACTCCGGGCCGTACAAAAAACAAGCTTTTCCTATGATCTCCAAACGGCCA 1395
Query 1354 --------------------- 1353
Sbjct 1396 GAGCACCTGCGGATGAATCTA 1416