Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11109
• Subject: XM_011249276.2
• Aligned Length: 1354
• Identities: 1214
• Gaps: 59

Alignment

Query    1  ATGAGGCGACGAAGGAGGCGGGACGGCTTTTACCCAGCCCCGGACTTCCGAGACAGGGAAGCTGAGGACATGGC  74
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGCGACGACGGAGGCGGGACGGCTTTTACCTAGCGCCTGACTTCCGACACAGGGAAGCTGAGGACATGGC  74

Query   75  AGGAGTGTTTGACATAGACCTGGACCAGCCAGAGGACGCGGGCTCTGAGGATGAGCTGGAGGAGGGGGGTCAGT  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGGAGTGTTTGACATAGACCTGGACCAGCCAGAAGATGCAGGCTCTGAGGATGAGCTGGAGGAGGGGGGTCAGT  148

Query  149  TAAATGAAAGCATGGACCATGGGGGAGTTGGACCATATGAACTTGGCATGGAACATTGTGAGAAATTTGAAATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAAATGAAAGCATGGACCATGGGGGAGTTGGACCATATGAACTTGGCATGGAACATTGTGAGAAATTTGAAATC  222

Query  223  TCAGAAACTAGTGTGAACAGAGGGCCAGAAAAAATCAGACCAGAATGTTTTGAGCTACTTCGGGTACTTGGTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCAGAAACTAGTGTGAACAGAGGGCCAGAAAAAATCAGACCAGAATGTTTTGAGCTACTTCGGGTACTTGGTAA  296

Query  297  AGGGGGCTATGGAAAGGTTTTTCAAGTACGAAAAGTAACAGGAGCAAATACTGGGAAAATATTTGCCATGAAGG  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGGGGCTATGGAAAGGTTTTTCAAGTACGAAAAGTAACAGGAGCAAATACTGGGAAGATATTTGCCATGAAGG  370

Query  371  TGCTTAAAAAGGCAATGATAGTAAGAAATGCTAAAGATACAGCTCATACAAAAGCAGAACGGAATATTCTGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  371  TGCTTAAAAAGGCAATGATAGTGAGGAATGCTAAGGACACGGCCCACACGAAAGCAGAGCGGAACATTCTGGAG  444

Query  445  GAAGTAAAGCATCCCTTCATCGTGGATTTAATTTATGCCTTTCAGACTGGTGGAAAACTCTACCTCATCCTTGA  518
            |||||.||.||.||.|||||.|||||..|.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  445  GAAGTGAAACACCCTTTCATTGTGGACCTGATTTATGCCTTTCAGACCGGAGGAAAGCTCTACCTCATCCTCGA  518

Query  519  GTATCTCAGTGGAGGAGAACTATTTATGCAGTTAGAAAGAGAGGGAATATTTATGGAAGACACTGCCTGCTTTT  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  519  GTATCTCAGTGGAGGAGAACTATTTATGCAGTTAGAAAGAGAGGGAATATTCATGGAAGACACAGCGTGCTTTT  592

Query  593  ACTTGGCAGAAATCTCCATGGCTTTGGGGCATTTACATCAAAAGGGGATCATCTACAGAGACCTGAAGCCGGAG  666
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTTGGCTGAAATCTCCATGGCTTTGGGGCATTTACATCAAAAAGGGATCATCTACAGAGACCTGAAGCCGGAG  666

Query  667  AATATCATGCTTAATCACCAAGGTCATGTGAAACTAACAGACTTTGGACTATGCAAAGAATCTATTCATGATGG  740
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACATCATGCTTAATCACCAAGGTCACGTGAAACTAACAGACTTTGGACTATGCAAAGAATCTATTCATGATGG  740

Query  741  AACAGTCACACACACATTTTGTGGAACAATAGAATACATGGCCCCTGAAATCTTGATGAGAAGTGGCCACAATC  814
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  AACAGTCACGCACACATTTTGTGGAACAATAGAATACATGGCCCCTGAAATCTTAATGAGAAGCGGCCACAACC  814

Query  815  GTGCTGTGGATTGGTGGAGTTTGGGAGCATTAATGTATGACATGCTGACTGGAGCACCCCCATTCACTGGGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  GTGCTGTGGATTGGTGGAGTTTGGGAGCATTAATGTATGACATGCTGACTGGAGCACCTCCATTCACTGGGGAG  888

Query  889  AATAGAAAGAAAACAATTGACAAAATCCTCAAATGTAAACTCAATTTGCCTCCCTACCTCACACAAGAAGCCAG  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct  889  AATAGAAAGAAAACAATTGACAAAATCCTCAAATGTAAACTTAATTTGCCTCCCTACCTCACACAAGAAGCTCG  962

Query  963  AGATCTGCTTAAAAAGCTGCTGAAAAGAAATGCTGCTTCTCGTCTGGGAGCTGGTCCTGGGGACGCTGGAGAAG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  963  AGATCTGCTTAAAAAGCTGCTGAAAAGAAATGCTGCTTCTCGTCTTGGAGCTGGCCCTGGGGATGCTGGAGAAG  1036

Query 1037  TTCAAGCTCATCCATTCTTTAGACACATTAACTGGGAAGAACTTCTGGCTCGAAAGGTGGAGCCCCCCTTTAAA  1110
            |.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1037  TCCAAGCTCATCCTTTTTTCAGACACATTAACTGGGAAGAACTTCTGGCTCGGAAGGTGGAACCTCCCTTTAAG  1110

Query 1111  CCTCTGTTGCAATCTGAAGAGGATGTAAGTCAGTTTGATTCCAAGTTTACACGTCAGACACCTGTCGACAGCCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  CCTCTGTTGCAATCTGAAGAGGATGTGAGTCAGTTTGATTCAAAGTTTACACGTCAGACACCTGTTGACAGCCC  1184

Query 1185  AGATGACTCAACTCTCAGTGAAAGTGCCAATCAGGTCTTTCTGGGTTTTACATATGTGGCTCCA-TCTGTACTT  1257
            .||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||          ||....|||| |||   ||.
Sbjct 1185  TGATGACTCCACTCTCAGTGAAAGTGCCAACCAGGTCTTTCTGG----------TGCAAGTCCAGTCT---CTC  1245

Query 1258  GAAAGTGTGAAAGAAAAGTTTTCCTTTGAACCAAAAATCCGATCACCTCGAAGATTTATTGGCAGCCCACGAAC  1331
            .||      |.||.||     |||     |.|||||       ||.|             .|||||..||.|||
Sbjct 1246  CAA------ACAGCAA-----TCC-----AGCAAAA-------CAGC-------------AGCAGCAGACCAAC  1283

Query 1332  ACCTGTCAGTACTGCTATGTGC  1353
            |  ..||||.|    .|||   
Sbjct 1284  A--ATTCAGCA----AATG---  1296