Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11245
• Subject: NM_001290061.1
• Aligned Length: 754
• Identities: 634
• Gaps: 119

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MGRAGAAAVIPGLALLWAVGLGSAAPSPPRLRLSFQELQAWHGLQTFSLERTCCYQALLVDEERGRLFVGAENH  74

Query   1  ---------------------------------------MNFVKLLHAYNRTHLLACGTGAFHPTCAFVEVGHR  35
                                                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  VASLNLDNISKRAKKLAWPAPVEWREECNWAGKDIGTECMNFVKLLHAYNRTHLLACGTGAFHPTCAFVEVGHR  148

Query  36  AEEPVLRLDPGRIEDGKGKSPYDPRHRAASVLVGEELYSGVAADLMGRDFTIFRSLGQRPSLRTEPHDSRWLNE  109
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AEEPVLRLDPGRIEDGKGKSPYDPRHRAASVLVGEELYSGVAADLMGRDFTIFRSLGQRPSLRTEPHDSRWLNE  222

Query 110  PKFVKVFWIPESENPDDDKIYFFFRETAVEAAPALGRLSVSRVGQICRNDVGGQRSLVNKWTTFLKARLVCSVP  183
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  PKFVKVFWIPESENPDDDKIYFFFRETAVEAAPALGRLSVSRVGQICRNDVGGQRSLVNKWTTFLKARLVCSVP  296

Query 184  GVEGDTHFDQL-----QDVFLLSSRDHRTPLLYAVFST-SSIFQGSAVCVYSMNDVRRAFLGPFAHKEGPMHQW  251
           |||||||||||     .||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  GVEGDTHFDQLRPFPAEDVFLLSSRDHRTPLLYAVFSTSSSIFQGSAVCVYSMNDVRRAFLGPFAHKEGPMHQW  370

Query 252  VSYQGRVPYPRPGMCPSKTFGTFSSTKDFPDDVIQFARNHPLMYNSVLPTGGRPLFLQVGANYTFTQIAADRVA  325
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  VSYQGRVPYPRPGMCPSKTFGTFSSTKDFPDDVIQFARNHPLMYNSVLPTGGRPLFLQVGANYTFTQIAADRVA  444

Query 326  AADGHYDVLFIGTDVGTVLKVISVPKGSRPSAEGLLLEELHVFEDSAAVTSMQISSKRHQLYVASRSAVAQIAL  399
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  AADGHYDVLFIGTDVGTVLKVISVPKGSRPSAEGLLLEELHVFEDSAAVTSMQISSKRHQLYVASRSAVAQIAL  518

Query 400  HRCAAHGRVCTECCLARDPYCAWDGVACTRFQPSAKRRFRRQDVRNGDPSTLCSGDSSRPALLEHKVFGVEGSS  473
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  HRCAAHGRVCTECCLARDPYCAWDGVACTRFQPSAKRRFRRQDVRNGDPSTLCSGDSSRPALLEHKVFGVEGSS  592

Query 474  AFLECEPRSLQARVEWTFQRAGVTAHTQVLAEERTERTARGLLLRRLRRRDSGVYLCAAVEQGFTQPLRRLSLH  547
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AFLECEPRSLQARVEWTFQRAGVTAHTQVLAEERTERTARGLLLRRLRRRDSGVYLCAAVEQGFTQPLRRLSLH  666

Query 548  VLSATQAERLARAEEAAPAAPPGPKLWYRDFLQLVEPGGGGSANSLRMCRPQPALQSLPLESRRKGRNRRTHAP  621
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  VLSATQAERLARAEEAAPAAPPGPKLWYRDFLQLVEPGGGGSANSLRMCRPQPALQSLPLESRRKGRNRRTHAP  740

Query 622  EPRAERGPRSATHW  635
           ||||||||||||||
Sbjct 741  EPRAERGPRSATHW  754