Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11255
• Subject: NM_012403.1
• Aligned Length: 715
• Identities: 664
• Gaps: 14

Alignment

Query   1  ATGGAGATGGGCAGACGGATTCATTTAGAGCTGCGGAACAGGACGCCCTCTGATGTGAAAGAACTTGTCCTGGA  74
           |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct   1  ATGGAGATGGGCAGACGGATTCATTCAGAGCTGCGGAACAGGGCGCCCTCTGATGTGAAAGAACTTGCCCTGGA  74

Query  75  CAACAGTCGGTCGAATGAAGGCAAACTCGAAGGCCTCACAGATGAATTTGAAGAACTGGAATTCTTAAGTACAA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  75  CAACAGTCGGTCGAATGAAGGCAAACTCGAAGCCCTCACAGATGAATTTGAAGAACTGGAATTCTTAAGTAAAA  148

Query 149  TCAACGTAGGCCTCACCTCAATCGCAAACTTACCAAAGTTAAACAAACTTAAG-AAGCTTGAACTAAGCGATAA  221
           ||||||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||    |||.||.|| ||||||||||||        
Sbjct 149  TCAACGGAGGCCTCACCTCAATCTCAGACTTACCAAAGTT----AAAGTTGAGAAAGCTTGAACTA--------  210

Query 222  CAGAGTCTCAGGGGGCCTGGAAGTATTGGCAGAAAAGTGTCCGAACCTCACGCATCTAAATTTAAGTGGCAACA  295
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 211  -AGAGTCTCAGGGGGCCTGGAAGTATTGGCAGAAAAGTGTCCAAACCTCACGCATCTATATTTAAGTGGCAACA  283

Query 296  AAATTAAAGACCTCAGCACAATAGAGCCACTGAAAAAGTTAGAAAACCTCAAGAGCTTAGACCTTTTCAATTGC  369
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284  AAATTAAAGACCTCAGCACAATAGAGCCACTGAAACAGTTAGAAAACCTCAAGAGCTTAGACCTTTTCAATTGC  357

Query 370  GAGGTAACCAACCTGAACGACTACCGAGAAAATGTGTTCAAGCTCCTCCCGCAACTCACATATCTCGACGGCTA  443
           ||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 358  GAGGTAACCAACCTGAACGACTACGGAGAAAACGTGTTCAAGCTTCTCCTGCAACTCACATATCTCGACAGCTG  431

Query 444  TGACCGGGACGACAAGGAGGCCCCTGACTCGGATGCTGAGGGCTACGTGGAGGGCCTGGATGATGAGGAGGAGG  517
           |.||.|||||.||||||||||||||.||||.|||..|||||.|.|||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 432  TTACTGGGACCACAAGGAGGCCCCTTACTCAGATATTGAGGACCACGTGGAGGGCCTGGATGACGAGGAGGAGG  505

Query 518  ATGAGGATGAGGAGGAGTATGATGAAGATGCTCAGGTAGTGGAAGACGAGGAGGACGAGGATGAGGAGGAGGAA  591
           .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 506  GTGAGCATGAGGAGGAGTATGATGAAGATGCTCAGGTAGTGGAAGATGAGGAGGGCGAGGAGGAGGAGGAGGAA  579

Query 592  GGTGAAGAGGAGGACGTGAGTGGAGAGGAGGAGGAGGATGAAGAAGGTTATAACGATGGAGAGGTAGATGACGA  665
           |||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 580  GGTGAAGAGGAGGACGTGAGTGGAGGGGACGAGGAGGATGAAGAAGGTTATAACGATGGAGAGGTAGATGGCGA  653

Query 666  GGAAGATGAAGAAGAGCTTGGTGAAGAAGAAAGGGGTCAGAAGCGAAAA  714
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 654  GGAAGATGAAGAAGAGCTTGGTGAAGAAGAAAGGGGTCAGAAGCGAAAA  702