Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11277
• Subject: XM_024453186.1
• Aligned Length: 1239
• Identities: 1001
• Gaps: 237

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGAAATTTTTGGTAGAATATAAGAGTGCAGTGGAGAAGAAACTGGCAGAGTACAAATGTAACACCAACAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AGCAATTGAACTAAAATTAGTTCGTTTTCCTGAAGATCTTGAAAATGACATTAGAACTTTCTTTCCTGAGTATA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCCATCAACTCTTTGGGGATGATGAAACTGCTTTTGGTTACAAGGGTCTAAAGATCCTGTTATACTATATTGCT  222

Query    1  ---------------ATGTTCCGTGTTGAATATGCATCTAAAGTTGATGAGAACTTTGACTGTGTAGAGGCAGA  59
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTAGCCTGTCAACAATGTTCCGTGTTGAATATGCATCTAAAGTTGATGAGAACTTTGACTGTGTAGAGGCAGA  296

Query   60  TGATGTTGAGGGCAAAATTAGACAAATCATTCCACCTGGATTTTGCACAAACACGAATGATTTCCTTTCTTTAC  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGATGTTGAGGGCAAAATTAGACAAATCATTCCACCTGGATTTTGCACAAACACGAATGATTTCCTTTCTTTAC  370

Query  134  TGGAAAAGGAAGTTGATTTCAAGCCATTCGGAACCTTACTTCATACCTACTCAGTTCTCAGTCCAACAGGAGGA  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGAAAAGGAAGTTGATTTCAAGCCATTCGGAACCTTACTTCATACCTACTCAGTTCTCAGTCCAACAGGAGGA  444

Query  208  GAAAACTTTACCTTTCAGATATATAAGGCTGACATGACATGTAGAGGCTTTCGAGAATATCATGAAAGGCTTCA  281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAACTTTACCTTTCAGATATATAAGGCTGACATGACATGTAGAGGCTTTCGAGAATATCATGAAAGGCTTCA  518

Query  282  GACCTTTTTGATGTGGTTTATTGAAACTGCTAGCTTTATTGACGTGGATGATGAAAGATGGCACTACTTTCTAG  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACCTTTTTGATGTGGTTTATTGAAACTGCTAGCTTTATTGACGTGGATGATGAAAGATGGCACTACTTTCTAG  592

Query  356  TATTTGAGAAGTATAATAAGGATGGAGCTACGCTCTTTGCGACCGTAGGCTACATGACAGTCTATAATTACTAT  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TATTTGAGAAGTATAATAAGGATGGAGCTACGCTCTTTGCGACCGTAGGCTACATGACAGTCTATAATTACTAT  666

Query  430  GTGTACCCAGACAAAACCCGGCCACGTGTAAGTCAGATGCTGATTTTGACTCCATTTCAAGGTCAAGGCCATGG  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGTACCCAGACAAAACCCGGCCACGTGTAAGTCAGATGCTGATTTTGACTCCATTTCAAGGTCAAGGCCATGG  740

Query  504  TGCTCAACTTCTTGAAACAGTTCATAGATACTACACTGAATTTCCTACAGTTCTTGATATTACAGCGGAAGATC  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTCAACTTCTTGAAACAGTTCATAGATACTACACTGAATTTCCTACAGTTCTTGATATTACAGCGGAAGATC  814

Query  578  CATCCAAAAGCTATGTGAAATTACGAGACTTTGTGCTTGTGAAGCTTTGTCAAGATTTGCCCTGTTTTTCCCGG  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CATCCAAAAGCTATGTGAAATTACGAGACTTTGTGCTTGTGAAGCTTTGTCAAGATTTGCCCTGTTTTTCCCGG  888

Query  652  GAAAAATTAATGCAAGGATTCAATGAAGATATGGCGATAGAGGCACAACAGAAGTTCAAAATAAATAAGCAACA  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAAAATTAATGCAAGGATTCAATGAAGATATGGTGATAGAGGCACAACAGAAGTTCAAAATAAATAAGCAACA  962

Query  726  CGCTAGAAGGGTTTATGAAATTCTTCGACTACTGGTAACTGACATGAGTGATGCCGAACAATACAGAAGCTACA  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCTAGAAGGGTTTATGAAATTCTTCGACTACTGGTAACTGACATGAGTGATGCCGAACAATACAGAAGCTACA  1036

Query  800  GACTGGATATTAAAAGAAGACTAATTAGCCCATATAAGAAAAAGCAGAGAGATCTTGCTAAGATGAGAAAATGT  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GACTGGATATTAAAAGAAGACTAATTAGCCCATATAAGAAAAAGCAGAGAGATCTTGCTAAGATGAGAAAATGT  1110

Query  874  CTCAGACCAGAAGAACTGACAAACCAGATGAACCAAATAGAAATAAGCATGCAACATGAACAGCTGGAAGAGAG  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCAGACCAGAAGAACTGACAAACCAGATGAACCAAATAGAAATAAGCATGCAACATGAACAGCTGGAAGAGAG  1184

Query  948  TTTTCAGGAACTAGTGGAAGATTACCGGCGTGTTATTGAACGACTTGCTCAAGAG  1002
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTTCAGGAACTAGTGGAAGATTACCGGCGTGTTATTGAACGACTTGCTCAAGAG  1239