Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11305
• Subject: NM_003848.3
• Aligned Length: 1296
• Identities: 1152
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGTCCCCCGTAGCAGCGCAGGCCGGGAAGCTTCTGCGAGCCCTAGCGCTGCGGCCCCGCTTCCTGGCGGC  74

Query    1  ----------------------------------------------------------------------ATGT  4
                                                                                  ||||
Sbjct   75  CGGGTCCCAGGCAGTTCAATTAACCTCCAGAAGATGGCTGAACCTGCAGGAATACCAGAGCAAGAAACTGATGT  148

Query    5  CTGACAACGGAGTGAGAGTTCAAAGATTCTTTGTAGCAGACACTGCAAATGAAGCTCTCGAGGCTGCTAAGAGA  78
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGACAACGGAGTGAGAGTTCAAAGATTCTTTGTAGCAGACACTGCAAATGAAGCTCTCGAGGCTGCTAAGAGA  222

Query   79  CTAAATGCAAAAGAAATTGTTTTAAAAGCCCAGATCTTAGCTGGAGGAAGAGGAAAAGGTGTCTTCAATAGTGG  152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTAAATGCAAAAGAAATTGTTTTAAAAGCCCAGATCTTAGCTGGAGGAAGAGGAAAAGGTGTCTTCAATAGTGG  296

Query  153  TTTGAAAGGAGGTGTTCATTTAACAAAAGACCCTAATGTTGTGGGACAGCTGGCTAAACAGATGATTGGGTACA  226
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTTGAAAGGAGGTGTTCATTTAACAAAAGACCCTAATGTTGTGGGACAGCTGGCTAAACAGATGATTGGGTACA  370

Query  227  ATCTAGCGACAAAACAAACTCCAAAAGAAGGTGTGAAAGTTAACAAGGTGATGGTTGCTGAAGCCTTGGATATT  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCTAGCGACAAAACAAACTCCAAAAGAAGGTGTGAAAGTTAACAAGGTGATGGTTGCTGAAGCCTTGGATATT  444

Query  301  TCCAGAGAAACCTACCTGGCAATTCTGATGGACCGGTCCTGCAATGGCCCCGTGCTGGTGGGCAGCCCCCAGGG  374
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCAGAGAAACCTACCTGGCAATTCTGATGGACCGGTCCTGCAATGGCCCCGTGCTGGTGGGCAGCCCCCAGGG  518

Query  375  GGGCGTCGACATTGAAGAGGTGGCTGCTTCAAACCCGGAGCTCATTTTTAAGGAGCAAATTGACATTTTTGAAG  448
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGCGTCGACATTGAAGAGGTGGCTGCTTCAAACCCGGAGCTCATTTTTAAGGAGCAAATTGACATTTTTGAAG  592

Query  449  GAATAAAGGACAGCCAAGCTCAGCGGATGGCCGAAAATCTAGGCTTCGTTGGGCCTTTGAAAAGCCAGGCTGCA  522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAATAAAGGACAGCCAAGCTCAGCGGATGGCCGAAAATCTAGGCTTCGTTGGGCCTTTGAAAAGCCAGGCTGCA  666

Query  523  GATCAAATTACGAAGCTGTATAATCTCTTCCTGAAAATTGATGCTACTCAGGTGGAAGTGAATCCCTTTGGTGA  596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATCAAATTACGAAGCTGTATAATCTCTTCCTGAAAATTGATGCTACTCAGGTGGAAGTGAATCCCTTTGGTGA  740

Query  597  AACTCCAGAAGGACAAGTTGTCTGTTTTGATGCCAAGATAAACTTTGATGACAACGCAGAATTCCGACAAAAAG  670
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AACTCCAGAAGGACAAGTTGTCTGTTTTGATGCCAAGATAAACTTTGATGACAACGCAGAATTCCGACAAAAAG  814

Query  671  ACATATTTGCTATGGACGACAAATCAGAGAATGAGCCCATTGAAAATGAAGCTGCCAAATATGATCTAAAATAC  744
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACATATTTGCTATGGACGACAAATCAGAGAATGAGCCCATTGAAAATGAAGCTGCCAAATATGATCTAAAATAC  888

Query  745  ATAGGACTAGATGGGAACATTGCCTGCTTTGTGAATGGTGCTGGGCTCGCCATGGCTACTTGTGATATCATTTT  818
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATAGGACTAGATGGGAACATTGCCTGCTTTGTGAATGGTGCTGGGCTCGCCATGGCTACTTGTGATATCATTTT  962

Query  819  CCTTAATGGTGGGAAGCCAGCCAACTTCTTGGATCTTGGAGGTGGTGTAAAGGAAGCTCAAGTATATCAAGCAT  892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTTAATGGTGGGAAGCCAGCCAACTTCTTGGATCTTGGAGGTGGTGTAAAGGAAGCTCAAGTATATCAAGCAT  1036

Query  893  TCAAATTGCTCACAGCTGATCCTAAGGTTGAAGCCATCCTTGTCAATATATTTGGTGGTATCGTCAACTGTGCC  966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCAAATTGCTCACAGCTGATCCTAAGGTTGAAGCCATCCTTGTCAATATATTTGGTGGTATCGTCAACTGTGCC  1110

Query  967  ATCATTGCCAATGGGATCACCAAAGCCTGCCGGGAGCTAGAACTCAAGGTGCCCCTGGTGGTCCGGCTTGAAGG  1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCATTGCCAATGGGATCACCAAAGCCTGCCGGGAGCTAGAACTCAAGGTGCCCCTGGTGGTCCGGCTTGAAGG  1184

Query 1041  AACCAACGTCCAAGAGGCCCAGAAGATACTCAACAACAGCGGACTCCCCATTACTTCAGCCATTGACCTGGAGG  1114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AACCAACGTCCAAGAGGCCCAGAAGATACTCAACAACAGCGGACTCCCCATTACTTCAGCCATTGACCTGGAGG  1258

Query 1115  ATGCAGCCAAGAAGGCTGTGGCCAGTGTGGCCAAGAAG  1152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGCAGCCAAGAAGGCTGTGGCCAGTGTGGCCAAGAAG  1296