Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11307
- Subject:
- NM_001351446.1
- Aligned Length:
- 1752
- Identities:
- 1322
- Gaps:
- 408
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTGTCACAGCAGATGGATGCAAGGACAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TTTTATGAAAAATGAGATACTTTCAGCAAGCCAGCCTTTTGCTTTTAATTGTACATTCCCTCCCATAACATCTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGGAAGTCAGTGTAACATGGTATAAAAATTCTAGCAAAATCCCAGTGTCCAAAATCATACAGTCTAGAATTCAC 222
Query 1 -----------------------------------------------------------ATG------ACAGGG 9
||| |.||||
Sbjct 223 CAGGACGAGACTTGGATTTTGTTTCTCCCCATGGAATGGGGGGACTCAGGAGTCTACCAATGTGTTATAAAGGG 296
Query 10 CTCGTGTC-CCTGTCATA---------------------TTTT-----------------CCACTCTCCACGAG 44
|.|.|.| .|||||||| |||| .|||| |||| .||
Sbjct 297 -TAGAGACAGCTGTCATAGAATACATGTAAACCTAACTGTTTTTGAAAAACATTGGTGTGACACT-TCCA-TAG 367
Query 45 GT------CC------------TGCGCGCTTC-----AATCCTGCAGCCCGGTTTGG---GGATG-TGGTC--- 88
|| || ||.| |.| |||..|.||.| |||| .|||| |.|||
Sbjct 368 GTGGTTTACCAAATTTATCAGATGAG---TACAAGCAAATATTACATC-----TTGGAAAAGATGATAGTCTCA 433
Query 89 CTTG----CTGCTCTGC-----GGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCT---GTC----ACAG------CAGGA 140
|.|| ||||.||.| |.|||| |||.| ||| |.|| .||||
Sbjct 434 CATGTCATCTGCACTTCCCGAAGAGTTG----------------TGTTTTGGGTCCAATAAAGTGGTATAAGGA 491
Query 141 CTGTAACGAGATTAAAGGGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGTCTCGGCAGAGG 214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 CTGTAACGAGATTAAAGGGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGTCTCGGCAGAGG 565
Query 215 ACAGAGGGAACTACGCGTGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAAATGGCATCACT 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 566 ACAGAGGGAACTACGCGTGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAAATGGCATCACT 639
Query 289 GTGAGCATTA---AAAGAGCTGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCATTCAATTGA 359
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 640 GTGAGCATTACAGAAAGAGCTGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCATTCAATTGA 713
Query 360 AGTACAGCTTGGTACCACTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCTACGATGCT 433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 714 AGTACAGCTTGGTACCACTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCTACGATGCT 787
Query 434 GGAGAGTCAATAACACTTTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGGAAACCCAT 507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788 GGAGAGTCAATAACACTTTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGGAAACCCAT 861
Query 508 GTCTCTTTTCGGGAACATAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGATTATGGCCT 581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 862 GTCTCTTTTCGGGAACATAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGATTATGGCCT 935
Query 582 TCCTTTCATGTGCCACGCTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTTTCGAGCTT 655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 936 TCCTTTCATGTGCCACGCTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTTTCGAGCTT 1009
Query 656 ACTTGATAGGAGGGCTTATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTTTTAAGATC 729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 ACTTGATAGGAGGGCTTATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTTTTAAGATC 1083
Query 730 GACATTGTTCTTTGGTATCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTATGACGCCTA 803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084 GACATTGTTCTTTGGTATCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTATGACGCCTA 1157
Query 804 TGTCTTATACCCCAAGCCCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATATCCTGCCCG 877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158 TGTCTTATACCCCAAGCCCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATATCCTGCCCG 1231
Query 878 AGGTGTTGGAGAGACAATGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAGCCGTGGCC 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232 AGGTGTTGGAGAGACAATGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAGCCGTGGCC 1305
Query 952 AATGTCATCGATGAAAACGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTGGGCTTTGG 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306 AATGTCATCGATGAAAACGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTGGGCTTTGG 1379
Query 1026 CCTGTTGAAGAACCTGTCAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAAGGTTATTC 1099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 CCTGTTGAAGAACCTGTCAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAAGGTTATTC 1453
Query 1100 TCATTGAGCTGGAGAAAATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGAAGCATGGT 1173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454 TCATTGAGCTGGAGAAAATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGAAGCATGGT 1527
Query 1174 GCCATCCGGTGGCATGGGGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACAGTGAGATA 1247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1528 GCCATCCGGTGGCATGGGGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACAGTGAGATA 1601
Query 1248 CCACATGCCGCCCAGAAGGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTACCGCACCG 1321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602 CCACATGCCGCCCAGAAGGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTACCGCACCG 1675
Query 1322 CAGGCCCAGAACTAGGCTCAAGAAGAAAGAAGTGTACTCTCACGACTGGC 1371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676 CAGGCCCAGAACTAGGCTCAAGAAGAAAGAAGTGTACTCTCACGACTGGC 1725