Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11307
• Subject: NM_001351448.1
• Aligned Length: 1371
• Identities: 1299
• Gaps: 72

Alignment

Query    1  ATGACAGGGCTCGTGTCCCTGTCATATTTTCCACTCTCCACGAGGTCCTGCGCGCTTCAATCCTGCAGCCCGGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACAGGGCTCGTGTCCCTGTCATATTTTCCACTCTCCACGAGGTCCTGCGCGCTTCAATCCTGCAGCCCGGT  74

Query   75  TTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTGTCACAGCAGGACTGTAACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTGTCACAGCAGGACTGTAACG  148

Query  149  AGATTAAAGGGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGTCTCGGCAGAGGACAGAGGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGATTAAAGGGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGTCTCGGCAGAGGACAGAGGG  222

Query  223  AACTACGCGTGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAAATGGCATCACTGTGAGCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACTACGCGTGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAAATGGCATCACTGTGAGCAT  296

Query  297  TAAAAGAGCTGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCATTCAATTGAAGTACAGCTTG  370
            ||                                                                        
Sbjct  297  TA------------------------------------------------------------------------  298

Query  371  GTACCACTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCTACGATGCTGGAGAGTCAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  299  GTACCACTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCTACGATGCTGGAGAGTCAAT  372

Query  445  AACACTTTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGGAAACCCATGTCTCTTTTCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  373  AACACTTTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGGAAACCCATGTCTCTTTTCG  446

Query  519  GGAACATAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGATTATGGCCTTCCTTTCATGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  447  GGAACATAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGATTATGGCCTTCCTTTCATGT  520

Query  593  GCCACGCTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTTTCGAGCTTACTTGATAGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  521  GCCACGCTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTTTCGAGCTTACTTGATAGGA  594

Query  667  GGGCTTATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTTTTAAGATCGACATTGTTCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  595  GGGCTTATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTTTTAAGATCGACATTGTTCT  668

Query  741  TTGGTATCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTATGACGCCTATGTCTTATACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  669  TTGGTATCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTATGACGCCTATGTCTTATACC  742

Query  815  CCAAGCCCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATATCCTGCCCGAGGTGTTGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  743  CCAAGCCCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATATCCTGCCCGAGGTGTTGGAG  816

Query  889  AGACAATGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAGCCGTGGCCAATGTCATCGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  817  AGACAATGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAGCCGTGGCCAATGTCATCGA  890

Query  963  TGAAAACGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTGGGCTTTGGCCTGTTGAAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  891  TGAAAACGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTGGGCTTTGGCCTGTTGAAGA  964

Query 1037  ACCTGTCAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAAGGTTATTCTCATTGAGCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  965  ACCTGTCAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAAGGTTATTCTCATTGAGCTG  1038

Query 1111  GAGAAAATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGAAGCATGGTGCCATCCGGTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039  GAGAAAATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGAAGCATGGTGCCATCCGGTG  1112

Query 1185  GCATGGGGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACAGTGAGATACCACATGCCGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113  GCATGGGGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACAGTGAGATACCACATGCCGC  1186

Query 1259  CCAGAAGGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTACCGCACCGCAGGCCCAGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187  CCAGAAGGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTACCGCACCGCAGGCCCAGAA  1260

Query 1333  CTAGGCTCAAGAAGAAAGAAGTGTACTCTCACGACTGGC  1371
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261  CTAGGCTCAAGAAGAAAGAAGTGTACTCTCACGACTGGC  1299