Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11307
• Subject: XM_011512094.1
• Aligned Length: 1817
• Identities: 1306
• Gaps: 478

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTGTCACAGCAGATGGATGCAAGGACAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TTTTATGAAAAATGAGATACTTTCAGCAAGCCAGCCTTTTGCTTTTAATTGTACATTCCCTCCCATAACATCTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGGAAGTCAGTGTAACATGGTATAAAAATTCTAGCAAAATCCCAGTGTCCAAAATCATACAGTCTAGAATTCAC  222

Query    1  -----------------------------------------------------------ATG------ACAGGG  9
                                                                       |||      |.||||
Sbjct  223  CAGGACGAGACTTGGATTTTGTTTCTCCCCATGGAATGGGGGGACTCAGGAGTCTACCAATGTGTTATAAAGGG  296

Query   10  CTCGTGTC-CCTGTCATA---------------------TTTT-----------------CCACTCTCCACGAG  44
             |.|.|.| .||||||||                     ||||                 .|||| |||| .||
Sbjct  297  -TAGAGACAGCTGTCATAGAATACATGTAAACCTAACTGTTTTTGAAAAACATTGGTGTGACACT-TCCA-TAG  367

Query   45  GT------CC------------TGCGCGCTTC-----AATCCTGCAGCCCGGTTTGG---GGATG-TGGTC---  88
            ||      ||            ||.|   |.|     |||..|.||.|     ||||   .|||| |.|||   
Sbjct  368  GTGGTTTACCAAATTTATCAGATGAG---TACAAGCAAATATTACATC-----TTGGAAAAGATGATAGTCTCA  433

Query   89  CTTG----CTGCTCTGC-----GGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCT---GTC----ACAG------CAGGA  140
            |.||    ||||.||.|     |.||||                |||.|   |||    |.||      .||||
Sbjct  434  CATGTCATCTGCACTTCCCGAAGAGTTG----------------TGTTTTGGGTCCAATAAAGTGGTATAAGGA  491

Query  141  CTGTAACGAGATTAAAGGGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGTCTCGGCAGAGG  214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  CTGTAACGAGATTAAAGGGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGTCTCGGCAGAGG  565

Query  215  ACAGAGGGAACTACGCGTGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAAATGGCATCACT  288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  ACAGAGGGAACTACGCGTGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAAATGGCATCACT  639

Query  289  GTGAGCATTA---AAAGAGCTGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCATTCAATTGA  359
            ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  GTGAGCATTACAGAAAGAGCTGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCATTCAATTGA  713

Query  360  AGTACAGCTTGGTACCACTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCTACGATGCT  433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  AGTACAGCTTGGTACCACTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCTACGATGCT  787

Query  434  GGAGAGTCAATAACACTTTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGGAAACCCAT  507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  GGAGAGTCAATAACACTTTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGGAAACCCAT  861

Query  508  GTCTCTTTTCGGGAACATAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGATTATGGCCT  581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  GTCTCTTTTCGGGAACATAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGATTATGGCCT  935

Query  582  TCCTTTCATGTGCCACGCTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTTTCGAGCTT  655
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  936  TCCTTTCATGTGCCACGCTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTTTCGAGCTT  1009

Query  656  ACTTGATAGGAGGGCTTATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTTTTAAGATC  729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  ACTTGATAGGAGGGCTTATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTTTTAAGATC  1083

Query  730  GACATTGTTCTTTGGTATCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTATGACGCCTA  803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  GACATTGTTCTTTGGTATCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTATGACGCCTA  1157

Query  804  TGTCTTATACCCCAAGCCCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATATCCTGCCCG  877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158  TGTCTTATACCCCAAGCCCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATATCCTGCCCG  1231

Query  878  AGGTGTTGGAGAGACAATGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAGCCGTGGCC  951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232  AGGTGTTGGAGAGACAATGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAGCCGTGGCC  1305

Query  952  AATGTCATCGATGAAAACGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTGGGCTTTGG  1025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306  AATGTCATCGATGAAAACGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTGGGCTTTGG  1379

Query 1026  CCTGTTGAAGAACCTGTCAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAAGGTTATTC  1099
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380  CCTGTTGAAGAACCTGTCAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAAGGTTATTC  1453

Query 1100  TCATTGAGCTGGAGAAAATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGAAGCATGGT  1173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454  TCATTGAGCTGGAGAAAATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGAAGCATGGT  1527

Query 1174  GCCATCCGGTGGCATGGGGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACAGTGAGATA  1247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1528  GCCATCCGGTGGCATGGGGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACAGTGAGATA  1601

Query 1248  CCACATGCCGCCCAGAAGGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTACCGCACCG  1321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602  CCACATGCCGCCCAGAAGGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTACCGCACCG  1675

Query 1322  CAGGCCCAGA--------------ACTAGG---CTCAAGAA--GAAAGAAGTGTACT---------------CT  1361
            ||||   .||              ||.|||   .|||.|.|  | |.|.||.|| ||               ||
Sbjct 1676  CAGG---TGAGCGGGTGGGAGGACACGAGGTTTGTCACGCACTG-ATGGAGGGT-CTATCATTGCGTGGTGGCT  1744

Query 1362  CACGACTGGC-------------------------------  1371
            |||..||||.                               
Sbjct 1745  CACAGCTGGAGGAGGACACGTTTCATCGGGGCCGTCTGCTC  1785