Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11307
• Subject: XM_017005175.1
• Aligned Length: 1538
• Identities: 1345
• Gaps: 181

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGTGGGGCCCTGACAGTAGGAGAGGTGTGCAGGAAAAGACGTGGCAACAATGTGTGCCACCGCAGGCCAGG  74

Query    1  ----------------------------------------------------------------------ATGA  4
                                                                                  |.||
Sbjct   75  GATCAGGCCCCCCAGGCCGGCCCCCGACCGGCTAGGTGACCATGGGGGAGCCGACTCCGTCTCTGGGTCGAGGA  148

Query    5  CAGG-GCTCGTG---------------------TCCCTGTCATATTTTCCACTCTCCACGAGGTCCTGCGCGCT  56
            ..|| |||||.|                     ||||||.|.|..||||..||.||| ||     ||| ||.||
Sbjct  149  GTGGAGCTCGCGGCTATTTTCAGCTCCAGCGGCTCCCTGCCTTCCTTTCTCCTTTCC-CG-----CTG-GCCCT  215

Query   57  TCAATCCTG-CAGCCCGGTTTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTG  129
                   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  -------TGCCAGCCCGGTTTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTG  282

Query  130  TCACAGCAGGACTGTAACGAGATTAAAGGGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGT  203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  283  TCACAGCAGGACTGTAACGAGATTAAAGGGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGT  356

Query  204  CTCGGCAGAGGACAGAGGGAACTACGCGTGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAA  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  357  CTCGGCAGAGGACAGAGGGAACTACGCGTGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAA  430

Query  278  ATGGCATCACTGTGAGCATTAAAAGAGCTGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCAT  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  431  ATGGCATCACTGTGAGCATTAAAAGAGCTGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCAT  504

Query  352  TCAATTGAAGTACAGCTTGGTACCACTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCT  425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  505  TCAATTGAAGTACAGCTTGGTACCACTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCT  578

Query  426  ACGATGCTGGAGAGTCAATAACACTTTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGG  499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  579  ACGATGCTGGAGAGTCAATAACACTTTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGG  652

Query  500  AAACCCATGTCTCTTTTCGGGAACATAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGAT  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  653  AAACCCATGTCTCTTTTCGGGAACATAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGAT  726

Query  574  TATGGCCTTCCTTTCATGTGCCACGCTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTT  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  727  TATGGCCTTCCTTTCATGTGCCACGCTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTT  800

Query  648  TCGAGCTTACTTGATAGGAGGGCTTATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTT  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  801  TCGAGCTTACTTGATAGGAGGGCTTATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTT  874

Query  722  TTAAGATCGACATTGTTCTTTGGTATCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTAT  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  875  TTAAGATCGACATTGTTCTTTGGTATCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTAT  948

Query  796  GACGCCTATGTCTTATACCCCAAGCCCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATAT  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  949  GACGCCTATGTCTTATACCCCAAGCCCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATAT  1022

Query  870  CCTGCCCGAGGTGTTGGAGAGACAATGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAG  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023  CCTGCCCGAGGTGTTGGAGAGACAATGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAG  1096

Query  944  CCGTGGCCAATGTCATCGATGAAAACGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTG  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097  CCGTGGCCAATGTCATCGATGAAAACGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTG  1170

Query 1018  GGCTTTGGCCTGTTGAAGAACCTGTCAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAA  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171  GGCTTTGGCCTGTTGAAGAACCTGTCAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAA  1244

Query 1092  GGTTATTCTCATTGAGCTGGAGAAAATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGA  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245  GGTTATTCTCATTGAGCTGGAGAAAATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGA  1318

Query 1166  AGCATGGTGCCATCCGGTGGCATGGGGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACA  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319  AGCATGGTGCCATCCGGTGGCATGGGGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACA  1392

Query 1240  GTGAGATACCACATGCCGCCCAGAAGGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTA  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393  GTGAGATACCACATGCCGCCCAGAAGGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTA  1466

Query 1314  CCGCACCGCAGGCCCAGAACTAGGCTCAAGAAGAAAGAAGTGTACTCTCACGACTGGC  1371
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1467  CCGCACCGCAGGCCCAGAACTAGGCTCAAGAAGAAAGAAGTGTACTCTCACGACTGGC  1524