Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11307
• Subject: XM_017005176.1
• Aligned Length: 1538
• Identities: 1273
• Gaps: 253

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGTGGGGCCCTGACAGTAGGAGAGGTGTGCAGGAAAAGACGTGGCAACAATGTGTGCCACCGCAGGCCAGG  74

Query    1  ----------------------------------------------------------------------ATGA  4
                                                                                  |.||
Sbjct   75  GATCAGGCCCCCCAGGCCGGCCCCCGACCGGCTAGGTGACCATGGGGGAGCCGACTCCGTCTCTGGGTCGAGGA  148

Query    5  CAGG-GCTCGTG---------------------TCCCTGTCATATTTTCCACTCTCCACGAGGTCCTGCGCGCT  56
            ..|| |||||.|                     ||||||.|.|..||||..||.||| ||     ||| ||.||
Sbjct  149  GTGGAGCTCGCGGCTATTTTCAGCTCCAGCGGCTCCCTGCCTTCCTTTCTCCTTTCC-CG-----CTG-GCCCT  215

Query   57  TCAATCCTG-CAGCCCGGTTTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTG  129
                   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  -------TGCCAGCCCGGTTTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTG  282

Query  130  TCACAGCAGGACTGTAACGAGATTAAAGGGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGT  203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  283  TCACAGCAGGACTGTAACGAGATTAAAGGGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGT  356

Query  204  CTCGGCAGAGGACAGAGGGAACTACGCGTGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAA  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  357  CTCGGCAGAGGACAGAGGGAACTACGCGTGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAA  430

Query  278  ATGGCATCACTGTGAGCATTAAAAGAGCTGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCAT  351
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct  431  ATGGCATCACTGTGAGCATTA-----------------------------------------------------  451

Query  352  TCAATTGAAGTACAGCTTGGTACCACTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCT  425
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  452  -------------------GTACCACTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCT  506

Query  426  ACGATGCTGGAGAGTCAATAACACTTTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGG  499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  ACGATGCTGGAGAGTCAATAACACTTTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGG  580

Query  500  AAACCCATGTCTCTTTTCGGGAACATAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGAT  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  581  AAACCCATGTCTCTTTTCGGGAACATAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGAT  654

Query  574  TATGGCCTTCCTTTCATGTGCCACGCTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTT  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  655  TATGGCCTTCCTTTCATGTGCCACGCTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTT  728

Query  648  TCGAGCTTACTTGATAGGAGGGCTTATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTT  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  TCGAGCTTACTTGATAGGAGGGCTTATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTT  802

Query  722  TTAAGATCGACATTGTTCTTTGGTATCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTAT  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  803  TTAAGATCGACATTGTTCTTTGGTATCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTAT  876

Query  796  GACGCCTATGTCTTATACCCCAAGCCCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATAT  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  GACGCCTATGTCTTATACCCCAAGCCCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATAT  950

Query  870  CCTGCCCGAGGTGTTGGAGAGACAATGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAG  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  951  CCTGCCCGAGGTGTTGGAGAGACAATGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAG  1024

Query  944  CCGTGGCCAATGTCATCGATGAAAACGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTG  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025  CCGTGGCCAATGTCATCGATGAAAACGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTG  1098

Query 1018  GGCTTTGGCCTGTTGAAGAACCTGTCAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAA  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099  GGCTTTGGCCTGTTGAAGAACCTGTCAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAA  1172

Query 1092  GGTTATTCTCATTGAGCTGGAGAAAATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGA  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173  GGTTATTCTCATTGAGCTGGAGAAAATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGA  1246

Query 1166  AGCATGGTGCCATCCGGTGGCATGGGGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACA  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247  AGCATGGTGCCATCCGGTGGCATGGGGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACA  1320

Query 1240  GTGAGATACCACATGCCGCCCAGAAGGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTA  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321  GTGAGATACCACATGCCGCCCAGAAGGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTA  1394

Query 1314  CCGCACCGCAGGCCCAGAACTAGGCTCAAGAAGAAAGAAGTGTACTCTCACGACTGGC  1371
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395  CCGCACCGCAGGCCCAGAACTAGGCTCAAGAAGAAAGAAGTGTACTCTCACGACTGGC  1452