Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11312
- Subject:
- NM_022002.2
- Aligned Length:
- 1419
- Identities:
- 1134
- Gaps:
- 285
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACAGTCACCAGGACTCACCACTTCAAGGAGGGGTCCCTCAGAGCACCTGCCATACCCCTGCACAGTGCTGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGCTGAGTTGGCTTCAAACCATCCAAGAGGCCCAGAAGCAAACCTGGAGGTGAGACCCAAAGAAAGCTGGAACC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ATGCTGACTTTGTACACTGTGAGGACACAGAGTCTGTTCCTGGAAAGCCCAGTGTCAACGCAGATGAGGAAGTC 222
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGACATGTGAAGG 14
||||||||||||||
Sbjct 223 GGAGGTCCCCAAATCTGCCGTGTATGTGGGGACAAGGCCACTGGCTATCACTTCAATGTCATGACATGTGAAGG 296
Query 15 ATGCAAGGGCTTTTTCAGGAGGGCCATGAAACGCAACGCCCGGCTGAGGTGCCCCTTCCGGAAGGGCGCCTGCG 88
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATGCAAGGGCTTTTTCAGGAGGGCCATGAAACGCAACGCCCGGCTGAGGTGCCCCTTCCGGAAGGGCGCCTGCG 370
Query 89 AGATCACCCGGAAGACCCGGCGACAGTGCCAGGCCTGCCGCCTGCGCAAGTGCCTGGAGAGCGGCATGAAGAAG 162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGATCACCCGGAAGACCCGGCGACAGTGCCAGGCCTGCCGCCTGCGCAAGTGCCTGGAGAGCGGCATGAAGAAG 444
Query 163 GAGATGATCATGTCCGACGAGGCCGTGGAGGAGAGGCGGGCCTTGATCAAGCGGAAGAAAAGTGAACGGACAGG 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGATGATCATGTCCGACGAGGCCGTGGAGGAGAGGCGGGCCTTGATCAAGCGGAAGAAAAGTGAACGGACAGG 518
Query 237 GACTCAGCCACTGGGAGTGCAGGGGCTGACAGAGGAGCAGCGGATGATGATCAGGGAGCTGATGGACGCTCAGA 310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GACTCAGCCACTGGGAGTGCAGGGGCTGACAGAGGAGCAGCGGATGATGATCAGGGAGCTGATGGACGCTCAGA 592
Query 311 TGAAAACCTTTGACACTACCTTCTCCCATTTCAAGAATTTCCG---GCCAGGGGTGCTTAGCAGTGGCTGCGAG 381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGAAAACCTTTGACACTACCTTCTCCCATTTCAAGAATTTCCGGCTGCCAGGGGTGCTTAGCAGTGGCTGCGAG 666
Query 382 TTGCCAGAGTCTCTGCAGGCCCCATCGAGGGAAGAAGCTGCCAAGTGGAGCCAGGTCCGGAAAGATCTGTGCTC 455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTGCCAGAGTCTCTGCAGGCCCCATCGAGGGAAGAAGCTGCCAAGTGGAGCCAGGTCCGGAAAGATCTGTGCTC 740
Query 456 TTTGAAGGTCTCTCTGCAGCTGCGGGGGGAGGATGGCAGTGTCTGGAACTACAAACCCCCAGCCGACAGTGGCG 529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTGAAGGTCTCTCTGCAGCTGCGGGGGGAGGATGGCAGTGTCTGGAACTACAAACCCCCAGCCGACAGTGGCG 814
Query 530 GGAAAGAGATCTTCTCCCTGCTGCCCCACATGGCTGACATGTCAACCTACATGTTCAAAGGCATCATCAGCTTT 603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGAAAGAGATCTTCTCCCTGCTGCCCCACATGGCTGACATGTCAACCTACATGTTCAAAGGCATCATCAGCTTT 888
Query 604 GCCAAAGTCATCTCCTACTTCAGGGACTTGCCCATCGAGGACCAGATCTCCCTGCTGAAGGGGGCCGCTTTCGA 677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCCAAAGTCATCTCCTACTTCAGGGACTTGCCCATCGAGGACCAGATCTCCCTGCTGAAGGGGGCCGCTTTCGA 962
Query 678 GCTGTGTCAACTGAGATTCAACACAGTGTTCAACGCGGAGACTGGAACCTGGGAGTGTGGCCGGCTGTCCTACT 751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTGTGTCAACTGAGATTCAACACAGTGTTCAACGCGGAGACTGGAACCTGGGAGTGTGGCCGGCTGTCCTACT 1036
Query 752 GCTTGGAAGACACTGCAGGTGGCTTCCAGCAACTTCTACTGGAGCCCATGCTGAAATTCCACTACATGCTGAAG 825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCTTGGAAGACACTGCAGGTGGCTTCCAGCAACTTCTACTGGAGCCCATGCTGAAATTCCACTACATGCTGAAG 1110
Query 826 AAGCTGCAGCTGCATGAGGAGGAGTATGTGCTGATGCAGGCCATCTCCCTCTTCTCCCCAGACCGCCCAGGTGT 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGCTGCAGCTGCATGAGGAGGAGTATGTGCTGATGCAGGCCATCTCCCTCTTCTCCCCAGACCGCCCAGGTGT 1184
Query 900 GCTGCAGCACCGCGTGGTGGACCAGCTGCAGGAGCAATTCGCCATTACTCTGAAGTCCTACATTGAATGCAATC 973
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCTGCAGCACCGCGTGGTGGACCAGCTGCAGGAGCAATTCGCCATTACTCTGAAGTCCTACATTGAATGCAATC 1258
Query 974 GGCCCCAGCCTGCTCATAGGTTCTTGTTCCTGAAGATCATGGCTATGCTCACCGAGCTCCGCAGCATCAATGCT 1047
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGCCCCAGCCTGCTCATAGGTTCTTGTTCCTGAAGATCATGGCTATGCTCACCGAGCTCCGCAGCATCAATGCT 1332
Query 1048 CAGCACACCCAGCGGCTGCTGCGCATCCAGGACATACACCCCTTTGCTACGCCCCTCATGCAGGAGTTGTTCGG 1121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGCACACCCAGCGGCTGCTGCGCATCCAGGACATACACCCCTTTGCTACGCCCCTCATGCAGGAGTTGTTCGG 1406
Query 1122 CATCACAGGTAGC 1134
|||||||||||||
Sbjct 1407 CATCACAGGTAGC 1419